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CRISPRs details
NC_013790_17
Flanking alignement tool
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NC_013790_17                                                                                                                 
top
Strain :
Methanobrevibacter ruminantium M1
RefSeq :
NC_013790 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013790_17
DR consensus (30 bp) :
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
Number of repetitions :
62
Begin Position :
1033123
End Position :
1037151
1033123
ATTTTAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ATCAATATCTGAATCAATATTGATATTATTCTTGAA
1033188
1033189
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GCTCCAAACTTATCAGCATTTTCAGATTTATAATAA
1033254
1033255
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCATCATTTCCATCTACGATTGGTTCGTTAAAAA
1033318
1033319
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TTACGAGAGTAACATTCTTCTGAAGCACAGTTGGTAA
1033385
1033386
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AGGTAATAATATGAAATTACCACTACTGTTGGAGTAG
1033452
1033453
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AAAACCATTCTCCAATAATATCTTCTGTGCATATTG
1033518
1033519
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CACACTTTTGACACCATAATGGACTCTTTCTTG
1033581
1033582
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ATTCATTCCCCCTTACTAATTCTACAAGTTTAAAA
1033646
1033647
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TAGAGACAGTACAACTCAATATGGATTAAATAGTGAG
1033713
1033714
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AGAATCTACGAGAATTATTCTATCATAACTGGTTAT
1033779
1033780
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ATTCTGCTGATGGATTAAGTTGCACTTTATCTGCTAA
1033846
1033847
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TAATCCTAACCTTTATCGGTAACTTGATATTGCAA
1033911
1033912
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CCAAAAAAAACATAAAAAAAAGACTCGGTAGT
1033973
1033974
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCATCTATGTCTGCCCCATATTGTATGATTCCGTT
1034038
1034039
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCATCTATGTCTGCCCCATATTGTATGATTCCGTT
1034103
1034104
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TATTTGGTAGAGTCAAACCACATCGGACAGTCATCT
1034169
1034170
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ACAAAGTAGAATTAAATCTTGGTAACTGGGTAAC
1034233
1034234
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GTTTGACTATCACTATCGTGGATGATATTGAGCAT
1034298
1034299
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ATAAATTATTGTTTAATAAAGAACCTGATAAGTTTA
1034364
1034365
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CTTAGTCCAGTATTGGCACCTATGACTAGTGTTA
1034428
1034429
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GGTGCTGAGTTATATGATGTGGAAATTGATTTTAA
1034493
1034494
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CAGAAAGCGATGTTTGGAGAGTTCTTTGAAGATGCT
1034559
1034560
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TATGTATGTTCCGATGATTAGTATCATTGTGTTGAA
1034625
1034626
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ACGGACATATAATTTATGATACAAGCAATGTATACAA
1034692
1034693
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CAGCTTACAAAGAAATAATCGCTGATATCAGTAATAG
1034759
1034760
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AATGACCTTATGGATAATACTAAAACAGTTAAAAA
1034824
1034825
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TGTGCTAGTTAATGCTAATCCTGCTCCTTCATAT
1034888
1034889
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TAGAACCTTTCAAGGAAGACATAGTCTGCTATTGTA
1034954
1034955
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CTTGCAGAACTGGACTTGCTCCTAGAATACAATTA
1035019
1035020
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ATACATATCAAAGACCCTCATATCCGAAACAATGTA
1035085
1035086
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCTTCGATTTCGTGGAATAATTGTGTGAAATCGA
1035149
1035150
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
ATGTCACCTTGTCCTTAAGTGGTGTCTTAAGTCCTA
1035215
1035216
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CAGTAGAATTCGATGCACAAAGGACAATGAGTAG
1035279
1035280
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GCTCCAAACTTATCAGCATTTTCAGATTTATAATAA
1035345
1035346
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCATCATTTCCATCTACGATTGGTTCGTTAAAAA
1035409
1035410
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TTACGAGAGTAACATTCTTCTGAAGCACAGTTGGTAA
1035476
1035477
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GCACTTGGAACTGCCGATGGTGTCGGAAACATCTT
1035541
1035542
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GAAAAGACATCATGTCAACAATTATGAATTGGAAGA
1035607
1035608
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TTGATGATTTTATACATTCTTTTAGTTTAGAACGT
1035672
1035673
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CCAGAGTTGATAAAAAATGTACAAAACAGTTATTAA
1035738
1035739
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GCGAGGAGTGCCTAAATTCACATTCAAGCAATACTA
1035804
1035805
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GACAATGAAATTAAGAAATTAAAATCATTATTGGAT
1035870
1035871
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CCTTACCATCGCTTCAGATTAGCAGAAACTACTGA
1035935
1035936
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCCAAGGTTGGCTACTTCAATGATACTGACTCTTTG
1036001
1036002
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TTTACGTTGTCCTGTACCGCTTTCATCATCAACCAT
1036067
1036068
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCGCAATAACACCGAAATTATCTAATACGAATTCAT
1036133
1036134
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TGCAGAAGCCCAGTTCCAAATCTTCAACTTGGACAA
1036199
1036200
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TTGTAAATTTATAGGGAATAAGACTACTGAAGAAAG
1036265
1036266
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CTTTAGTAAATGGGGGGGGCAAACTTTTAGTAAAATA
1036332
1036333
TTCAATCCCCAAAATGGGTCTGATTTTAAC
CTGTGTGTATAGTTGAAGTTGCAATTGTTGATAT
1036396
1036397
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
GTGCAAGTCCTCCAATAGATTATTTCCTCCCCTAT
1036461
1036462
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CCATATTCTCTCACCCAAATATAAGAATAGGATTTTG
1036528
1036529
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TCCTCTGGAGCATAATAATTGAATCCTAATTTTAA
1036593
1036594
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AATTCAAATCCAACGATGTAATTTCCATCGCTTAC
1036658
1036659
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TATTTAGGATTGAAGAAATTGTTAATGATTGTATTGA
1036725
1036726
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TGAAACAAGTTCAAGCCAAGTATAACACCTTTTCAAG
1036792
1036793
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AAATTTATTGATATCTTATTTTTATGCCTTTTTTTA
1036858
1036859
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TGTTCAGTCTCTACAATTAAGTCCTCTAGGTTTAT
1036923
1036924
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
CCGAACCTTACTTTGAAGATGAGGAAACCTTTGAAGATA
1036992
1036993
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
AAACAAGAAAACACTGCAACTAGTAATATTTTCTAT
1037058
1037059
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
TATGTTGATGCGAAATACCCTAACAGCTTCAGG
1037121
1037122
ATTTCAATCCCAAAATGGTCTGATTTTAAC
1037151
Left flanking sequence : Till position 1033123 (length
bp)
ATGAAGATTCTGTTATTATTTATCAATTAATGATGGAAGAATCTTTAACAAGAAATGTTTTAGGGGTTGA
AAAGGCATCAGTGGATGATGTTATTTTGTA
Right flanking sequence : From position 1037151 (length
bp)
AGGCGAGAATTTTCGCCTAAATACCCCTTTTACACATTAATATTTGTCCATTTTTTAATTTAAAATTTTC
GAATGGTAAAAAAGAATTTATTTAAAACAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp