Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_013887_15                                                                                                                 top


Strain : Methanocaldococcus sp. FS406-22 RefSeq :NC_013887 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013887_15
DR consensus (30 bp) : GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACNumber of repetitions :15
Begin Position : 1021672 End Position : 1022671

1021672GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACTCTTATGCAAATGAGGACAAAACAAATCCTTACCAAC 1021738
1021739GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTAGTGATAAGGTAGGAAAATTGAGATTAAAAAAAAA 1021804
1021805GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTAATCGGAAACACCAAAACCTCCGGAGGGGTAACTCTACATGATG 1021879
1021880GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTAGTGATAAGGTAGGAAAATTGAGATTAAAAAAAAA 1021945
1021946GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTAATCGGAAACACCAAAACCTCCGGAGGGGTAACTCTACATGATG 1022020
1022021GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTAGTGATAAGGTAGGAAAATTGAGATTAAAAAAAAA 1022086
1022087GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTAATCGGAAACACCAAAACCTCCGGAGGGGTAACTCTACATGATG 1022161
1022162GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTTCTTTCTAATTCAATTAGCTCTGTCAAATCTTTTTTTAAAATA 1022235
1022236GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTGGTTTTAGGAACCGACAAAGAACTAAAAGAATTAGAAGA 1022305
1022306GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACACTTTATCTAACGTGCTTAATGGCCCTTCTTCAGC 1022370
1022371GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACGACATCTTAGAATTAGATGCAATGTTGAGTTATAATG 1022437
1022438GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACAACATTCTACCAGTTGTTGTGTATTTTTTAACTCTCA 1022504
1022505GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTCTATTTCTTCTATTATCTTTATTATTTCCTTCTCCA 1022571
1022572GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACAAGCCCACAGCAACAAATAGATTGACAAACTTATCATGGT 1022641
1022642GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAAC1022671
Left flanking sequence : Till position 1021672 (length bp)
GTTTATAAATAAAGGTAGTTATTTACCCTTAGAAAAATATAGTGCCGAAAAGTATAAATATAAGAAAAAT
AATAAAAAATAGATTGTGAATGATTGCCCT
Right flanking sequence : From position 1022671 (length bp)
TTCTCTATTTTCTCCAAATCCAAAATAAATAACTCGTTAAAATCAGGCCTCTTGGAGGATGGAAACTTTT
TTAAATAAAAAATAAAGATAAAAACTTCAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp