Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_013887_17                                                                                                                 top


Strain : Methanocaldococcus sp. FS406-22 RefSeq :NC_013887 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013887_17
DR consensus (30 bp) : GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACNumber of repetitions :18
Begin Position : 1194903 End Position : 1196104

1194903GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACGACTTAAACTTATTGCAAGTAATATAATCTTTTAAAAT 1194970
1194971GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACCTGTTGGAGAAGGAACATCCTCAGGATTTAAAG 1195033
1195034GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACCTTTATTCTGGAGGGCTACTTGAAACAGTAGATAGT 1195099
1195100GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACATATTAAACCGAAATAAGCACAGTCCATATGTATTTT 1195166
1195167GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACTTGACTTTGAATCTAACGATTGTTATCGGTACACGTATT 1195235
1195236GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACTCAGTAGATTTAAATGCGTTCTTCGACATTTCAGGAGCTAA 1195306
1195307GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACTTAATTTGGACTGTTATTGCAGTTGGCAAGGTTACATTAT 1195376
1195377GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACCTAAATAAACAGGTTCAGAAGATACGGGCGTATTGTTT 1195444
1195445GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACGTTGGAATCTAAAAAACTTATCAGAGTGTCCAAAACGTTTGG 1195516
1195517GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACCTGTGCTACATTTCTGTCAATCCAATATGCTGGTGGCAAACAGATG 1195592
1195593GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACAAATCAGCAAGGATTATTGCCCAATGGTTTGCCTGGAA 1195660
1195661GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACTCCAACACTGTATTCTCACTGTAAGATATGTCGACATC 1195728
1195729GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACATTAATCAAGTTAATCTTGCTCTGATTCGTGAATTTATAGC 1195799
1195800GTTAAAATCAGACCGATTCGGTATGGAAACTTCGTTTCAGACCACATTATCCACGACCCTGACAGCTA 1195867
1195868GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACTTGGATGTTGCACAATTAAACTTTAACGCTTATTTGCAGT 1195937
1195938GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACATTACAAAGATTGATAATATAATTCGCTCAAAAGTTCCA 1196006
1196007GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAACGAGATGGAAATGTTAGAGAGGTTTTATGATAAGCCAGT 1196074
1196075GTTAAAATAAGACCGATTCGGTATGGAAAC1196104
Left flanking sequence : Till position 1194903 (length bp)
GTTTATAAATGAGGATAGTTATTTACCCTTAGAAAAATATGGTGCCGAAAAGTATAAATATAAGAAAGAT
AATAAAAAATAAGTTGTGAATGATTGCCTT
Right flanking sequence : From position 1196104 (length bp)
TTCTCTTCAACTATCCAACCGATTCTTCTCTGCCCATCCAGTTAAAATCAGACCTCTTTGAGGATGGAAA
CATTTCACAGTAATACCATCCAGACCACGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp