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CRISPRs details
NC_013921_1
Flanking alignement tool
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NC_013921_1                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacter italicus Ab9
RefSeq :
NC_013921 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013921_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
56
Begin Position :
759928
End Position :
763624
759928
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GGTCCTACTGCTTCGATATAGCTATTTCCACTCAGCA
759994
759995
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAACATAGTTGGTATAGACAAGATTGCCAAGAACACCC
760063
760064
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCTGTTCTTTTTCTCCTCAAGCTCTGCAACCTTAAG
760129
760130
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCGTAAAAGCAGTATTGAGGGCAATTACCAAGGCG
760194
760195
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCTTTGAGGGAAGGTCTTAGGAAGATTTCTGCTGT
760260
760261
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTGTCTTTGTGCAAGATGGGAAATATTCTGTTGGCG
760326
760327
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCAAAAAAACCTCTATCAAAAGAAATTCTTATTAGA
760392
760393
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GGTAAAACAGTAACATGAGGAACTATATCAACTCTAGA
760460
760461
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GAAATAAGAATATAGAGTTTGTGAAATTTCATAATTT
760527
760528
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAAGTTTTGGAGGAATTTTTATAATAGTGATAAAAA
760593
760594
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGACTTTTGTTTTAGGTGTTATTCTTGGCGTTTCTTT
760661
760662
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTTTTTTTCACCCTTTCCCTCGTTTACATAAATAT
760727
760728
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGGGCTTAAGAGTGCTGTTATGAATCCTGTTTTTGA
760793
760794
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCGATACTTCTCCGGCATCGAGAAGCCCAGGGATGTAT
760861
760862
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCTTTCGATCCTGTTGCTGAAGCTGAAGAGATATTGAA
760930
760931
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAAATAGGCGTTTGGTTAGTTCTTTGGGTATTCTT
760995
760996
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACTCTAGACTTAGAAGAAGGATCATAGTAAACATTTT
761062
761063
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AACTGGGGAAGTCTTTAATGAACCTGTGCAGGAATAT
761129
761130
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAAGAAAAGCAGCTTTCTAACACAACAGTTAACTAT
761195
761196
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GTTATAGAGGAGGTTGTCCAATTATGAAGAACGATA
761261
761262
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTCTAAAACATCCTTTCTATAACTTTCTAATTATAT
761327
761328
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTCACAATTTGATAATTTACTTACTTCTGTGAA
761392
761393
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAACATAAAAATCCTTTCATATTAAACAAAAATAAACT
761460
761461
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAATTTTCTAAAATCTTCCCATTCCATTTGAATTCCTC
761528
761529
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATCTCTGAAATACCCTACCTTGTCTATCGGCTATCCAGTAG
761599
761600
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTATTGGGTTTAAGCATGCTTGTACGAATAAGTGCC
761665
761666
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGTTATTGGTGATAATGTCGTTTTAGATGTGCGTAT
761731
761732
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTCCCCCACAGCTTGAGGCTGATGATGTGGAAATAGAG
761799
761800
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATGACTACTGTTGATTGGGCTGGTCTTTTTTCTGG
761864
761865
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTTTTAAGGTTGCACTTTATAATCCTGTCTCTAATCAA
761932
761933
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTTCTTTTCCACACCTCTAAGAATACCCAAAGAAC
761998
761999
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAAAGAGCTAACAAAGAGCTAACAACTATCAAGA
762063
762064
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GTAAAAGCCCTTTGGGGCTTTTACTACTATTATGG
762128
762129
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TCCTATATATAGGCTTAGAAGTCTTGATGAAGTTTTA
762195
762196
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTGAAATTGTTGAAGAATATCCTGAGCTGGTTGCC
762260
762261
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGGGAAAAAGTATTAAGAGCAGTACTTCCTGAAGC
762325
762326
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TCTTCAAACCAATAGTCCACTTTATCTTTCACAAAAT
762392
762393
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTAAAAATACCTTAAAGAAAATTTACTCTATAAAA
762458
762459
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCTTTGCAATTTGTATTTCCATGTCGTTCACCTTC
762524
762525
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GGGTTTAATAATGCTTCCTCAATTTTTTCTGGGGTGA
762591
762592
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAAAGTCCTTCCTCATTTTGTCTGTAATAATTTTGAT
762658
762659
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGAGCGCAACGATAAACTTAGAATACCGCATGTTAT
762724
762725
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGACTACTGCTTCTTTTTGTTCAGCTATCTCTTTTTC
762792
762793
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAGGCCACCAACTCCGAATGGTGGCAAGGATGAAGG
762859
762860
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTGACCTGCAACAGTTGTCCATGTTGGAGCTGTATC
762925
762926
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGCTCGGCGAGCTCCTGGAGCATCTCCCACTCGGTAG
762992
762993
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AACTGCTGGGCCAGTCCTTCCTCGGCCTCGATTTGCTT
763060
763061
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAGGATACATTGTTGGAGTAGCTGATAGGTGGCCACTTC
763129
763130
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GAACAAGGAATTTATACTCCAGCAACGGAGGTTCAT
763195
763196
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCGCTTACGACGGTTTAATTTACTTAACGAAGTCTA
763261
763262
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAGGTGAAGTACCAACCATAATTAATTGAGAATGCT
763327
763328
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTCGCACTTCTTTTGTGTCTCTCAATGGTTCTGTTGC
763394
763395
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGCTCAAAGCTAAACTGCTGAAGGTGGTGTAAATGT
763461
763462
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGTTAGAGAGCGCCGCTTTCAATCCTGTTACTGCTTC
763528
763529
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTCTATGTGGTTTTCTATCTTTTCATTTAGTTCTG
763594
763595
GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
763624
Left flanking sequence : Till position 759928 (length
bp)
ATTGATTTCATTAGATATTATGGTATAATAAAGTCAGGAAACTTGACATGAATTAAAAAAGTGTAAATTA
TTAATGTGCTATTTATGCATGTTATAATGG
Right flanking sequence : From position 763624 (length
bp)
TCTCTCAAAAAGGCAACAAAAAACTAAACCCATACCGATGTAAAAATATGGGATAAATGAATGGTTAATA
AAGTTAAATAAAAAGTTAAGACGCTGCAGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp