Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_013966_1                                                                                                                 top


Strain : Haloferax volcanii DS2 RefSeq :NC_013966 (plasmid pHV4 )
CRISPR id : NC_013966_1
DR consensus (30 bp) : GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCNumber of repetitions :40
Begin Position : 204975 End Position : 207584

204975GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGCAGGCATCTCGACCGGCGACCTCCCGGAACACTTTG 205041
205042GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTGCACAAGTCCATCAAAGAAGACGGTTACACGCAACC 205108
205109GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGTCCTCGACGAAGCCGGGGTCCAATTCGGGAACCG 205173
205174GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGCGACCGGGCCGAACGAAACCGCGCAGAACATCACGG 205240
205241GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCAGGACACGTCTGCGCTGCGTGCGCCTACTGCATGAG 205306
205307GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGCGCACGCGTAGGCCCCGAGCACGAACGCGACCGGG 205372
205373GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTGATTCTCGAAGGAGCCGAGCGCGGCTTCCGTGGAAT 205439
205440GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGTGAAGGTCAAACGCTTCTGGTAGGCAGGCCCGCG 205504
205505GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCAGTCTGCGGTCCCGGCGTTGTGAATGTGAACGACTT 205570
205571GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGCCGATTGCGATATTTTTCAGAATCGGCGACTGTT 205635
205636GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGGTGTCCAAATGTCGCCAGAGAATTCCTGTCAAGCTT 205702
205703GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTGACGCTGTTCGATGTCTTTCAACTCGTTTGTCTCTC 205769
205770GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGGCCTCCGCGGCGGGCGGTAAAGCCGATTCATCCT 205834
205835GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGACGGTTCCGTTCTCGTCGTAGATCGTCACGTCCA 205899
205900GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGCGCGACAGAGCCCGTCGAGATCTCCGAAGGCGAGA 205965
205966GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTCTCGGCAACAGACCCTGCGTTAGTAATTTGGACACT 206032
206033GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCAGATTGTGGATGAACGTCACGCCAAGCCGACCGGGA 206098
206099GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGACGAGACGATCGGGCTTCTGGAAGACCAGGAGGAAG 206165
206166GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTTCAGCGACTACGACCTGATGCGCTCCGATACAG 206229
206230GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCATGATCCGCGTGGTCCGGTTGACGTTCGGCTGCTCTT 206296
206297GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTATCACCCGTGGGCCGGTGACAACGAGGACCACGA 206361
206362GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCATTTTGCCGGACGCTTCGGGAGTTGATTCATAGTT 206426
206427GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGTCGCTCGCGGGATCGACATCATCGCGCTCAAGGCGA 206493
206494GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTAGTCCGCCCCGCACTCAGGGCACGCGTCGTCGTCC 206559
206560GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTGCGCGTGCAGCTCGTTTGATGAGACGTCACCACCG 206625
206626GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGAGGGCGGGGGCAACGTCGCGGAGATGCAGGACCTC 206691
206692GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGAGACGATTGAGTGGGGCGGTGACTCCGCTATGGCAG 206758
206759GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTATTACAATTGCCAAAAACCACGTTGCTAATAGCTCCG 206826
206827GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGGGAGTGTATGCGATATCCCTTAAAACCCCCTACTT 206892
206893GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCACTCGTCGCACGTGTTAGTTTTCGGTTCGCTCGTTT 206958
206959GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGGCGGGCTCGGCAGGAGCTCGAAGACCGCTTTTCGG 207024
207025GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCACCGACGATGTAACTGTCTCGGCGGCAACGCTCCC 207089
207090GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCACTCTCCGCGTCCGACTGCTCGACATCCCGACATCG 207155
207156GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCACCGCGAAATCGGCGTCAATCGTCACGTCCGGTAGG 207221
207222GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCCACTCTGCGAAGCCGTCGATGAAGTCCTCGAACTCC 207287
207288GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTTTTCTACGAGGTCGGAAACGGACACTTCGACGTT 207352
207353GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCTCGAAGCCGCAGACGACGGCGCAGAGAGCGGTATCAC 207419
207420GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCCGGCTCGACGACGATTACTTCGCGCTCGAAGCTCGT 207485
207486GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGCGTCGCTCGCGGGATCGACATCATCGCGCTCAAGGCGATG 207554
207555GTTTCAGACGAACCCTTGTGGGATTGAAGT207584
Left flanking sequence : Till position 204975 (length bp)
TTTCCGTCGACCCTCGGGGGGTACGGGGGAATTGAGGGTCGACGGAAACGTTGATGTGAGTTCGCTATGT
ACAGCCGTCTACCCCCGTGAATTCGGACGG
Right flanking sequence : From position 207584 (length bp)
CTAGACGGCACTGTCTCGGAGGGTGTGTCAAATTCACTGACAATAGAATAAAAACGTCGGCAACCAAGAT
GGAGGCACGGACATGAGGCCCCTTGCCAAG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp