CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_013974_12
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_013974_12                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile BI9
RefSeq :
NC_013974 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013974_12
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
22
Begin Position :
1706867
End Position :
1708277
1706867
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
CAAAGAAGCTCCACCCCATCTGTTTTTTATTATAGC
1706931
1706932
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TGTTTTCCATGAACATTTCGAGCTGACTTTTATTGT
1706996
1706997
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AACTTCTTGTTTTTTCTTTAAAACACGTACTTGGTC
1707061
1707062
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAATCAATGCCAACTATAGGAACGTCGGGATTAATTG
1707127
1707128
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GGAGTATAAGGTAAATCGTAAGCAACTCCAGAAAGAG
1707193
1707194
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GAATTACAATATTATCTCCAGCATCAAGACTAGGAT
1707258
1707259
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
CTGATAGAAAAAGAAGATTATTTGAAAGTTGAGACTA
1707324
1707325
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAAGATTGCAATAGATTTCCTGTTAAAATAGGTACAG
1707390
1707391
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
ACTGAACCTACTAGCATTGTAGGGTTGAAGTCTACAA
1707456
1707457
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TCTTTTTCAAATTGCATAGTTGGTTATACTTATTATAA
1707523
1707524
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AAATATGTAAGTTTTAATTTAAAATGATATTCAACT
1707588
1707589
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
AATATTTAGAGATGGCGTAGAGTGTTAAAAGTTTCA
1707653
1707654
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
GAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGCAAGCC
1707719
1707720
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TATAGCTAATTATTAGATTCAATTTTAATTTCGTTAA
1707785
1707786
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
ATTGCAACACTTCATCAGTTGATAAATATAGTATATT
1707851
1707852
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TTATACATATTTGTAGCTCCTTGCTGAACTGTTGCA
1707916
1707917
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
TGGTTAAATCTCCAACAGAACATTTATCTAAATTACAA
1707983
1707984
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA
1708049
1708050
GTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAAT
AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT
1708116
1708117
GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT
CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT
1708182
1708183
GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAAT
TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCTCTTTGAAATTT
1708248
1708249
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
1708277
Left flanking sequence : Till position 1706867 (length
bp)
GGTGTGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1708277 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTAGCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp