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CRISPRs details
NC_014122_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_014122_5                                                                                                                 
top
Strain :
Methanocaldococcus infernus ME
RefSeq :
NC_014122 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014122_5
DR consensus (37 bp) :
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
Number of repetitions :
17
Begin Position :
604543
End Position :
605764
604543
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
TCAAGCCGTCCTCAATTTTTATTTTTTGATCAACAAT
604616
604617
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
GATACTCAAGAGAACTATATCTTGAATATGAGAAAG
604689
604690
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
TTCTGGTAAGTCTTCTAATTCATTAATTATCTTTTC
604762
604763
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
CAGGGCTATTACAGTTCCTACAGCTCTATCTAT
604832
604833
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
ATAAAGAGAAAACATGAAGAGATTAAAGAAACAAAG
604905
604906
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
TGATACCCCTAAAAGAGTATTCCTAAGAAAAATAAGAAGAT
604983
604984
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
TGAAAAGGCATTAATGAGTAGAATTATTCAATATAC
605056
605057
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
AAATGAATGAAATAGAATTAAGTGGGGGCATAAAAA
605129
605130
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
AATGTATAGAGGAAAATTTGGTGTTAGTGGGTCAATGACAGTGTTGG
605213
605214
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
AATCCGGGGAGTATCGTCCAATATCCAGAACAGGAT
605286
605287
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
GGAAAAAATAGAATGGTTAGAAAAAGAACAAGAAGAGA
605361
605362
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
AAATGGTGATCCAATCACATACATAGATGAGTATAGCA
605436
605437
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
TTATTATATGAAATAATAAGTGAAGTTGAAAAAT
605507
605508
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
GTGTTTTGTGGAAAGTGACAAATGATTCAGAATATT
605580
605581
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
GACAGAGGGGAAGACTACTACGACATGTTGCCAAAAG
605654
605655
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
GACAAAAAAGAAGTTTGAAGAGACAAGAGAAATTTT
605727
605728
GTTTCCATCCTTGTTTTAATGGACTGGTGATTCAAAC
605764
Left flanking sequence : Till position 604543 (length
bp)
CAGACTACTTAGGGGGGAATATAAGAACTCATAGATATGACTTAGGACTAATTGAAAGAATTGAGGATAG
ATATAGGCAAGTTATTGAAATCATTAATTC
Right flanking sequence : From position 605764 (length
bp)
CCTTAATGTCTGCCCTTATTTTATATCAAAACTCCTATAAAAAACTTTCTTTTTAAACCCGAGTTTTCTT
ACTGGTTGGTTATTGAACCCCTATATAAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp