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CRISPRs details
NC_014222_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_014222_1                                                                                                                 
top
Strain :
Methanococcus voltae A3
RefSeq :
NC_014222 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014222_1
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
Number of repetitions :
36
Begin Position :
339765
End Position :
342408
339765
TTTATTTTCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TGCTACGTCTAATTTAATATTCTTTTCTGTAGACAT
339837
339838
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
ACTTGCAGTATTAATCTGTCTAGGTTTCGAAAAACCA
339911
339912
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
CCTGTTGCCGTCCGTATTCTCCCAATTTAACAGATT
339984
339985
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTAAATACGGACTTTGCGGGGGTTATATACAATATAG
340058
340059
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
CATGTCTACTAAACCCCACTCTCTTTCAGTATCTGA
340131
340132
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TGATGGAGAAGTGACAGGATCTTCCTTCGAAGCAT
340203
340204
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTATACAAGATTTGCGGTGAAATTGAAATATTAATAAC
340278
340279
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTTTAAATTATCTAAAAGTATTTCAGCTTGTTCCTTGCT
340354
340355
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TACAGACATTGCTAAAAAAATATATCATTGTGATAATAG
340430
340431
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTTTAACAACAAAAATGTTGTTAGTATCATTTAATTA
340504
340505
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
AAACCATCTGAAGAGTTGCCAAATCATATATATATACAATC
340582
340583
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
ATAGTAATCAGCAAAAAGCTAAAGAATTGGAGAATATAT
340658
340659
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TGATGTACTTAGCTTGCTTTTCTGAGACTCTTATCTGCA
340734
340735
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
AAAATTGTATTCAATTGTACAAAGAAATTTAGTAG
340806
340807
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
ATGTGTATGTACCTAATCGATTAAGAGATGAAC
340876
340877
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
AAAATCTTGTGGAATGACTATTGATGATATTGCAGA
340949
340950
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TATCATATTGATTGTATGCTGATGTATAATCAATATTAC
341025
341026
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTTATCATACCCCCATACTTTTAACAAATAGGGTGT
341098
341099
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTGTACGAGGCTCGTTAGTATCGGCTATAATGTTA
341170
341171
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TAAAATAATAAAATATATTTCATAATACATTAACAAATTTT
341248
341249
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
CACAAGATAACAGTACAAAATTTAACGATAGTTTATTAA
341324
341325
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
ATTTTATCCTCTTAGGTATATTGGGAATAGATATAT
341397
341398
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TAAATATTTATTTAATTATTTAATAGAAATATTTATA
341471
341472
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TGACCTTTTTAGATGAATAGTATTACAAAACAATAATTAT
341548
341549
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTTTTTTCTAAAAGGACAGTTCAAAAAATTCTATGATA
341623
341624
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
AAAAAGGTCATATAGGATATATTGATGAATCTATATATT
341699
341700
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
ATTCATATAATATAATTAGTTGAAAAACTAAATATTGAA
341775
341776
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TCTTCTGTAAATCGTCTAACCGCGTGCTTACAGACGATGGTTTCA
341857
341858
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
ACAGATGACGAACCGTACGGACACGGTGCAAAAAGTGCAA
341934
341935
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TTTATTTTATTATGTTGTTTTTAAGTCAACATAA
342005
342006
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TAAATGGCGTAAAACTATTCATATAAAAGATATTTA
342078
342079
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
GTTCAGGTTTACCCCTTAACCCATCAATTACTTGTCG
342152
342153
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
CCATATTGTACAAGAACAAAGTTATTATCAAGAAGA
342225
342226
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TAGTGTCGCTATCGGTGCCAGTACACTTATTGCCAG
342298
342299
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
TATTGATATGTTTGAACCACATATCAACGAATTATG
342371
342372
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCACTGTGAC
342408
Left flanking sequence : Till position 339765 (length
bp)
AATAACCTTAGGATTAATAATTGTAATATATCAAAATAGAAGTTCTGTATCAAAAAGTTATAGACGTTAT
AAAAGACGATATTAACTTAAATACTTTTTT
Right flanking sequence : From position 342408 (length
bp)
ACGTAGTTAAATTATTACTCACCAATAAGCATTTAAAACAGCTTATAGATTAAACAAAGCTCTATTTAGC
CGTATCGCAAAAATAATGTAATTCAGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp