Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_014392_9                                                                                                                 top


Strain : Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 RefSeq :NC_014392 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014392_9
DR consensus (30 bp) : GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACNumber of repetitions :20
Begin Position : 2477566 End Position : 2478857

2477566GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTATACTGAATATAACACCTACAAGCCTATCTACT 2477630
2477631GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGAGGGATATATTTTGAGTGATGGGACTTTAGATGTTG 2477698
2477699GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTCTCTACCTTAAGAACTTCTTCTAACACACTCCACAA 2477766
2477767GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTAATGTAAACATAACTTATACAGGTCGATTAGAT 2477832
2477833GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACAATATTTTTATCAATACCTAAAAACACCTGTAAG 2477898
2477899GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATATGACAATTTGAACATCTAAAAGTTCCCATCCAG 2477964
2477965GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAAAATGAAAATAGGGCGGAATTTTTACCGCCCGCCCC 2478032
2478033GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGAAGGTGTAGATATTTTTTCAGAGAAATCAAAAAA 2478098
2478099GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATTAAACCTGTAAATACTCTTTGTAAAACATTTCCA 2478164
2478165GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAACTTTGTGAAGTAGTTAAATAAACTTCTCCCTT 2478229
2478230GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACTTAAAATCTGCTGATATAATTGCATAATCTGTTC 2478295
2478296GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTTTTATAGCTTGCTCTAATTTCCCTATATCTTCTTT 2478363
2478364GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTTAAAATTAAAAATCAACCCCTTTCAAAAATTT 2478429
2478430GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGGTTATGAGCCAAATGTGCAGAGTTCGAAAAGAA 2478494
2478495GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTACAGAAGGTGGTTTTTGTTAAAATTGATTGTCG 2478558
2478559GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATTAACTCTTTAGTACTTACAAATTCACCATTAACAG 2478625
2478626GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAACTGTGTACATATAACTCCCTCTTTTCATTCTTCTAA 2478693
2478694GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGTGTCTCTTATAGAACATTTCTTTGGTATTAAAATATT 2478761
2478762GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAAACATACCTAATCTCATCAGCCTTGCTCTTCTAA 2478827
2478828GTTTTTAACCTTTCTTTTGGGGAATTTTAT2478857
Left flanking sequence : Till position 2477566 (length bp)
GAATTTACTGAACTGTGTGCTGTTTTGATATGATGTACTGATATAAAAACATTGACACCATTGCATAAAG
TTGATATAATAAAATCAAGCTTTCCAACGT
Right flanking sequence : From position 2478857 (length bp)
GCAATGAAGAGGTGACCAAAGTGAACTACCATCCACCTAAAGAGGTGGAGGCTTCGTGAGAAGTTTGGTA
GCAGCTAAGCTACCCTTATTCTCACAGGGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp