Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_014538_3                                                                                                                 top


Strain : Thermoanaerobacter sp. X513 RefSeq :NC_014538 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014538_3
DR consensus (30 bp) : GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACNumber of repetitions :63
Begin Position : 2342830 End Position : 2346967

2342830CACTATTTTCAGGATAGGTAAGCTAAAAACAATGAAATTCAAATCTTCAACAGTAAAGATTTTGGC 2342895
2342896GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCACATACAGGACATTCCCACACCCGCTCCGATAACT 2342961
2342962GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAGATTAGCTATTCTTCAACATCCACAGTATCCCTTCA 2343029
2343030GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAAGAAGTTTTCTTTTATAGATTGTTAGTGGTTTG 2343094
2343095GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAAAGAAGATTTTCACAGCATGGCACTTAAAACAG 2343159
2343160GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCTCAAGGCAACAGGTAGTACACCACAAACAGGAAACA 2343227
2343228GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCTGTGGTGACATGCTTTTTAAAGCTTCTGCCTCATTG 2343294
2343295GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTACAATGTTGCCCTTCTACTTGCAGCTCTAACACGG 2343360
2343361GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGTAATGTGGATGGTATATTGTCATGGAGGTGGAGATA 2343427
2343428GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCATTTCTATGCTTGCAATTATGCGGGCGAAGGAAA 2343493
2343494GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCAGCGCCTAAAACCAAAATTACGTTTTGCATTGTAGG 2343560
2343561GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATTTTGCATTCACCTTCTTCAATTTTCTTCTCTGA 2343625
2343626GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTCTCTGCTTATAACAGTCATTTTCTGTCATGAATTTT 2343693
2343694GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAGCGCCATCATACTCGATTTCCTGCCGTATCACAAAA 2343760
2343761GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAGCAATCACCGGCAAAACCAACTGGTATGATGCACC 2343827
2343828GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAACAAGATGTACATGGAGCATATACCGATATCTA 2343892
2343893GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCCTTTTTCTTGCCATTAAAATCACTCCTAAATGTA 2343958
2343959GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCTAAAGTGTAGTTTGTATCTCTTACAATCGTTGCGG 2344024
2344025GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATTTTTTGAATTTGAAATTCACGAGTCAAAGGGT 2344088
2344089GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGGGTTGTGCTTTAAAAAGTTTATGATTAACACTACA 2344154
2344155GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATATAGGCCCTGAAATTCCTCTGGTAGTGCTTCTCT 2344220
2344221GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCAAAAAGCGCAAGGGGAGCAACAACAAGAACCTAT 2344285
2344286GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCGTCCACCTGTAAGTGCAAAAGAATGGGTGGAAGAAA 2344353
2344354GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCAGCGTGAGTCAATTTATTCCGTATTCAGTGCGGG 2344419
2344420GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGTGAGGAGCGCCAAGAAGACGAGCAGGCGGTGCAAA 2344485
2344486GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCATACAGTTCCCCGCAAAGAAGTAGCTCCAGCCTG 2344550
2344551GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCCGGGATGAATACACACACATCGGCGCCAGCCGA 2344615
2344616GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGGCTAATAAAATGATTTTGCAAGCATTAAAAAGACA 2344681
2344682GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATACTCCTTATTTGCCTGTCTATCATCCTTAAATCT 2344747
2344748GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCAACTCTGTGGATACACGTCAACCATGTTTGTTTT 2344812
2344813GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCAACACATGAGAGTAGACGGAAACGATGATGATAGTC 2344879
2344880GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCGGCAGGCCATATTGATGTTAGTAGCACATCTCTA 2344944
2344945GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTATTTATATGCTCCTGTACGCATGGCGAGCTGAATA 2345010
2345011GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAAGAAGAGCTTGAAAAGGAGGAGATGAATTCAGAA 2345076
2345077GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCATAGATACCGAATACGTCAAAGTTCTTGAAGACT 2345142
2345143GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTATAAAGCTCAACTACTTCTTTTGGTGTTATATTCAA 2345210
2345211GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCTGGGGAAGTCTTTAATGAACCTGTGCAGGAATA 2345274
2345275GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCCCCTTGGGTATTTCTACGTAACCGAGATTGAGCG 2345340
2345341GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTAGTCCCATGTTACCCATGCTCCAGATGCGGAATACTT 2345408
2345409GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCAGGCTTGGACACTCTTACAAGGTACTTTTACTC 2345473
2345474GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAAGGTTGCCTGGGCTATGTGGACAATCCAGAAGGCA 2345540
2345541GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCGTAGTAGTTTACAATTACAAGTTTTAACTTCAAA 2345606
2345607GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGGAGTCTTGGAAAGGACTCCATTACTTCGAACTCGA 2345672
2345673GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCATCACGGATGCACTAAAACCGGCTAAATTCAGCG 2345738
2345739GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTAAAACGTTCTGGAACTGTTCTTGTACGCTATCCGCA 2345806
2345807GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGACATAGTATGGAACAAAAGGGTTTTAAGTTCGACG 2345872
2345873GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCTGCTATGACTATCCCAACAGGGCCAGTTATTAGAG 2345939
2345940GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCATCCATTTTACAAAGCAGTATATATCACAAAATAGA 2346007
2346008GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTAGGCAATAGTTTATACGTCTAAAACAAAATCAAAG 2346073
2346074GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACACTCTCTCATCGACGACCTCCGCATCTCCAACCGTG 2346139
2346140GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCATCTGCCGTCAGCCACTCTTTTAGCACTTTGCCT 2346205
2346206GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGGCGTAGATAACCCAGACAGGCAGTACACCATAGCAA 2346272
2346273GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCGTAGTTTTTGAAGAAGTAAAGGAGGATTACTCTT 2346337
2346338GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCATTAAACGGGATTTGGGGGATATAGGGTTTCACA 2346403
2346404GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTGCAAGCTAATCATAAAGAAAATAAAGTCCCTTTTGG 2346471
2346472GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGACAATGGTATACCACTTAAGGAATGCGTATCAGA 2346536
2346537GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCACTTTTAAAGCAAGGAGCTTTAAAAGGACTTTCTAT 2346603
2346604GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTAGCCAGCTTTTTATTTCTGTTGTAGAAATTTTATT 2346670
2346671GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCTACATCTAAGAGTGGACGGAACCGAAGAAAATAGTC 2346737
2346738GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAAGTGTATCTCCCAAGACCACCGATACAAGCAATCAA 2346805
2346806GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGTTCATTTAACTTCCCTCCTTCGCTGTTTCTATAGT 2346871
2346872GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTATTTCAGCATAGTTATTGCTATCCTGCTGGGCATA 2346937
2346938GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC2346967
Left flanking sequence : Till position 2342830 (length bp)
TCTGCAGTGTCTTAACTTTTAATTTAACTTTATTAACCATTTATTTATCCCATATTTTTACATCGGTATG
GGTTTAGTTTTTTGTTGCCTTTTTGAGAGA
Right flanking sequence : From position 2346967 (length bp)
AACCAAACTTGAAAAAAGCTGCATTTTTCAAGTTTAGTTTCAATTCCTTATAGACTCCCATGCCGCAAAT
GCAGCACCAGCAGAGGATGAAAATGTCCTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp