Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_014652_1                                                                                                                 top


Strain : Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 RefSeq :NC_014652 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014652_1
DR consensus (29 bp) : GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACNumber of repetitions :80
Begin Position : 2613496 End Position : 2618702

2613496GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGTATCAGGATACATTCGAACAAGAATTGTTGATATTGA 2613562
2613563GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCGCCTGCACTTCTTGTTATTCCTATCATCGCTATCTG 2613628
2613629GTTTACATCCCTAATAGTTCAGTTAAAACTGGGCCTGCTTCACGTTGTTGATAGCATTGTTAACCAC 2613695
2613696GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGAATTAAAAAGTATGTCTTTTAAAAACTCTTCTCTC 2613761
2613762GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAGTCCTGCACTTCTCATATTCTCATGGGGTAGCGGT 2613827
2613828GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCTGTGATGAGTCAGCAGGGTCTCTTATAACTTTAGT 2613892
2613893GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACAAAACTAAATTACCATTGACTTCTCCCCGCCCTAA 2613958
2613959GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGTAAGGCAAGACTCGTAGAAGATTTGAGAATGTG 2614022
2614023GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGCAATATATCGTCGCCTTCATAGACTTCCTGTATAC 2614087
2614088GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTTCAACAAGATTAAATATTTTGCAAACTTAATTGA 2614152
2614153GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACATTGTTAATGTCAGTAGCCACTAATTCCACAACACCA 2614218
2614219GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCTTTCTTAAGGAGTGATAATTTTGTTAATTGCTTTTGA 2614285
2614286GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTGGGCCAGAAGATATTAAATCTACAGAAAGCTAAAG 2614350
2614351GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAAATTCTCGCCAGAAAACATGCCAAAACTCAAATAC 2614416
2614417GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCTAATCTCAATTTTTTCCATTTCTTGTTTTTCTT 2614480
2614481GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACCAAAAATCCTTTCTTTAAAGTTGCAACAATATTATC 2614547
2614548GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTCAACCTTCCAACCGATTGTTGAGTATTGATTCAA 2614612
2614613GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCGGTGAAGTATTGTCGCTTTGGTGCTGGAAGAAG 2614675
2614676GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAAACAGAGTCTTGAAGATTTAGAGAAGCGATACGA 2614740
2614741GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCTTCTCCCAAGACAACGTACGGCATAACTGCACCGT 2614806
2614807GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAAAGTCAAGTTGCTAACACTTAATAAATACACATCT 2614872
2614873GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCAACGTCATCAATCAAAAAGTTGAATGCTTTTGCT 2614937
2614938GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCTTGTCAATACCACCCTAATTGTTAACAAATTATGA 2615003
2615004GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGCAGCTGGGAATGATATGTGTTGTAGACGAGATAAAT 2615069
2615070GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTAGCTGTTGGACCTGCGTGCCAGGCCCTTTCGTTCCA 2615135
2615136GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAATTATTGATGGTTGGAAAAATAAGTTTTTTGATAG 2615201
2615202GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACTACAACGACTTTTACTGTGACAGTTGATACAGCT 2615266
2615267GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTGTTTGGAATGCGATTAAGAACGTCTTTCTGACAATC 2615332
2615333GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGAGATAGTGAGGGAAAAGACAAGCGGATTTGCAGCA 2615397
2615398GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGCACTCCAGCGCTGAGCTGGGGTGCTGATTTCGTAT 2615463
2615464GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGCACTCCAGCGCTGAGCTGGGGTGCTGATTTCGTAT 2615529
2615530GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCTCTCATCAAGCTCTGCTATCCATTCCCAATCCCT 2615594
2615595GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGATGGAGCAGGAAATACTTAAGTTTGTTACGACGCA 2615659
2615660GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGATGAGTGAGAAAAACTTCTTTGAAGAACTTTTAGCTG 2615726
2615727GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCTCCAATACTTTTAAGTTTGCTTAGCGTTATGCTTGC 2615792
2615793GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACAAAAGCAAGTATGCTAACTGCACGATATCTTTT 2615856
2615857GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGCGCTGTTGCTAATGCGACCAATGCAGATACACTTGA 2615923
2615924GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCTATGATTTTTTTAGCTATTTCCTCTTTCTTTTGT 2615988
2615989GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTCACCTGTTTCCAAGTAACAAAAGAATGTAATATA 2616053
2616054GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCCCGTCTATCATCATCGAGCATCAGCTCCTAATCGC 2616118
2616119GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAATGCCTCACCTACTTCGTTGAGGTCCTTTAAACAC 2616183
2616184GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTTTGAGTTTGAACATTACGGGCTTTAAAGACAGGTC 2616249
2616250GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCTGGAAGGAAATGGGCTTATCACCAGCAGATATGCAC 2616315
2616316GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACAGGCTGAATATGGAGGACAAGCATAATGGAGAATT 2616381
2616382GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTGGCAACTTTTAGTGAAAGGCTAAAGAAATTGAGA 2616445
2616446GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAATCAGGCAGGACGCAGAAGAACTTAAGAAACTGCT 2616510
2616511GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACATTTCTTCTGGCTTAAAGGTTACTATTACCCCACCAA 2616576
2616577GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACAAGTGGTTTTAAACTTGAACGAGCAGGTGGCTTTG 2616642
2616643GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACTGTTTATTTTTGTTTGCAAGCTGTTTTTTTGCTTTTCA 2616711
2616712GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTCTGTTGCATAATCTCCAGTCAGCAACAAGTCAATAAT 2616778
2616779GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCGAAGCAATAGCTTAGCAATACAAAGCACAGCATAG 2616843
2616844GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTATTACCACCTTTACCGTCCCCGGTCCGTTCCAGAG 2616908
2616909GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACTCATCTTTTGTCAGTCTTGGCACATCTTGAACTTC 2616974
2616975GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTCGAGAAGAGCTCCAAGAACTAGAAGAAGCTGAGA 2617039
2617040GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAACAAGAGCTGATGATTTAGCAACGATGATTGTAG 2617104
2617105GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCCAGTTATAGGCATTCCTTTGCTAATCATTAAATAC 2617169
2617170GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCAAGCACCAGAACAACAACAGTTTATGCTTGAAGA 2617233
2617234GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTGTTCAAAAGAATCAATAGCAAATTCGCTTCTTAAGA 2617299
2617300GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGTATGTGCTGTAGTTATCACAATATCACTTTTTGTG 2617364
2617365GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACACTCATATCCTAAGAACTCTTCATAAGCAATTCCATT 2617430
2617431GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACGAATGCATTCTCTGCAACATTCTGAGACATGTCCC 2617494
2617495GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACATTAAAGAAAGTGTTTAACACGACAATATAATAATT 2617559
2617560GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCTTGATGTAAACAAAGTATTAGTAGTCTTTAAAGA 2617623
2617624GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCATATAAAAGCCCATAGACAATCAATTTTATGCTTAA 2617689
2617690GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGAATAAGTCCAATTCAAATCCAAACTCTATGAAGC 2617754
2617755GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGAATAAGTCCAATTCAAATCCAAACTCTATGAAGC 2617819
2617820GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGTATTTTCTTGTTGCAATGTAAGTATCATCATAAGC 2617885
2617886GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCATCGTGTATTCTCTCTAACTGATGCAGTTTTAATGC 2617951
2617952GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTAATCATTGATGATTTAGGAGCTGAAAATGAGAC 2618015
2618016GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTCTACCGCTCTTCTTCCTTTGCGATAAACAACCCA 2618080
2618081GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAGCAGAAAGAGCACAAGGTTAAGCGAATAGTGGACA 2618146
2618147GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTAAAAAGCTTTTAGGCTTGCAAGCCAACAACAAAAT 2618212
2618213GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTTCTGAAGCTGAATCAAAAATTGGGCAAGCACAATAA 2618278
2618279GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAGTATCAGATTGGCAAGAAAATACCCAGACTTTGGAC 2618344
2618345GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCAACAGCAGATAGGCAGACTTTTATCGTGCTTTGCA 2618409
2618410GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCATTGCCTGACTGTAAGCATTAATCACAGCTGCTAT 2618474
2618475GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACCTTTCTAAAACTTTACCAAACTTCTTGCTAACATACTC 2618541
2618542GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACTAGCATTTAAGCAAAGCTATGTTTCGTATGCACAGAT 2618607
2618608GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAACAAGAAATCAATCAACGTTACCATAAACGTTGAGAAAA 2618673
2618674GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC2618702
Left flanking sequence : Till position 2613496 (length bp)
ACCCAACTTTATAACTTGCGTTATAAATTGGAAACACAAAATTCTTGACAAGTCTCTCATTTTCACTCAT
TTTCGTTTATTACAGGAATGCTTTATAAAT
Right flanking sequence : From position 2618702 (length bp)
CCACTAAAATAAAAATTACCTCATTTATTGATATAATTAGATTATAAAGCATTTACAAATTTATTGCAAT
AAATAAAAGTTTGCAGCAAAGGTATGGTTG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp