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NC_014652_1
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NC_014652_1                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108
RefSeq :
NC_014652 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014652_1
DR consensus (29 bp) :
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
Number of repetitions :
80
Begin Position :
2613496
End Position :
2618702
2613496
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GTATCAGGATACATTCGAACAAGAATTGTTGATATTGA
2613562
2613563
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CGCCTGCACTTCTTGTTATTCCTATCATCGCTATCTG
2613628
2613629
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGTTAAAAC
TGGGCCTGCTTCACGTTGTTGATAGCATTGTTAACCAC
2613695
2613696
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGAATTAAAAAGTATGTCTTTTAAAAACTCTTCTCTC
2613761
2613762
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAGTCCTGCACTTCTCATATTCTCATGGGGTAGCGGT
2613827
2613828
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CTGTGATGAGTCAGCAGGGTCTCTTATAACTTTAGT
2613892
2613893
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACAAAACTAAATTACCATTGACTTCTCCCCGCCCTAA
2613958
2613959
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGTAAGGCAAGACTCGTAGAAGATTTGAGAATGTG
2614022
2614023
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GCAATATATCGTCGCCTTCATAGACTTCCTGTATAC
2614087
2614088
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTTCAACAAGATTAAATATTTTGCAAACTTAATTGA
2614152
2614153
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ATTGTTAATGTCAGTAGCCACTAATTCCACAACACCA
2614218
2614219
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CTTTCTTAAGGAGTGATAATTTTGTTAATTGCTTTTGA
2614285
2614286
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TGGGCCAGAAGATATTAAATCTACAGAAAGCTAAAG
2614350
2614351
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAAATTCTCGCCAGAAAACATGCCAAAACTCAAATAC
2614416
2614417
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCTAATCTCAATTTTTTCCATTTCTTGTTTTTCTT
2614480
2614481
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACCAAAAATCCTTTCTTTAAAGTTGCAACAATATTATC
2614547
2614548
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTCAACCTTCCAACCGATTGTTGAGTATTGATTCAA
2614612
2614613
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CGGTGAAGTATTGTCGCTTTGGTGCTGGAAGAAG
2614675
2614676
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAAACAGAGTCTTGAAGATTTAGAGAAGCGATACGA
2614740
2614741
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCTTCTCCCAAGACAACGTACGGCATAACTGCACCGT
2614806
2614807
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAAAGTCAAGTTGCTAACACTTAATAAATACACATCT
2614872
2614873
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCAACGTCATCAATCAAAAAGTTGAATGCTTTTGCT
2614937
2614938
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCTTGTCAATACCACCCTAATTGTTAACAAATTATGA
2615003
2615004
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GCAGCTGGGAATGATATGTGTTGTAGACGAGATAAAT
2615069
2615070
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TAGCTGTTGGACCTGCGTGCCAGGCCCTTTCGTTCCA
2615135
2615136
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAATTATTGATGGTTGGAAAAATAAGTTTTTTGATAG
2615201
2615202
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACTACAACGACTTTTACTGTGACAGTTGATACAGCT
2615266
2615267
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TGTTTGGAATGCGATTAAGAACGTCTTTCTGACAATC
2615332
2615333
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GAGATAGTGAGGGAAAAGACAAGCGGATTTGCAGCA
2615397
2615398
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGCACTCCAGCGCTGAGCTGGGGTGCTGATTTCGTAT
2615463
2615464
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGCACTCCAGCGCTGAGCTGGGGTGCTGATTTCGTAT
2615529
2615530
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCTCTCATCAAGCTCTGCTATCCATTCCCAATCCCT
2615594
2615595
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GATGGAGCAGGAAATACTTAAGTTTGTTACGACGCA
2615659
2615660
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GATGAGTGAGAAAAACTTCTTTGAAGAACTTTTAGCTG
2615726
2615727
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CTCCAATACTTTTAAGTTTGCTTAGCGTTATGCTTGC
2615792
2615793
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACAAAAGCAAGTATGCTAACTGCACGATATCTTTT
2615856
2615857
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGCGCTGTTGCTAATGCGACCAATGCAGATACACTTGA
2615923
2615924
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCTATGATTTTTTTAGCTATTTCCTCTTTCTTTTGT
2615988
2615989
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTCACCTGTTTCCAAGTAACAAAAGAATGTAATATA
2616053
2616054
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CCCGTCTATCATCATCGAGCATCAGCTCCTAATCGC
2616118
2616119
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AATGCCTCACCTACTTCGTTGAGGTCCTTTAAACAC
2616183
2616184
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTTTGAGTTTGAACATTACGGGCTTTAAAGACAGGTC
2616249
2616250
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CTGGAAGGAAATGGGCTTATCACCAGCAGATATGCAC
2616315
2616316
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACAGGCTGAATATGGAGGACAAGCATAATGGAGAATT
2616381
2616382
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TGGCAACTTTTAGTGAAAGGCTAAAGAAATTGAGA
2616445
2616446
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AATCAGGCAGGACGCAGAAGAACTTAAGAAACTGCT
2616510
2616511
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ATTTCTTCTGGCTTAAAGGTTACTATTACCCCACCAA
2616576
2616577
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACAAGTGGTTTTAAACTTGAACGAGCAGGTGGCTTTG
2616642
2616643
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACTGTTTATTTTTGTTTGCAAGCTGTTTTTTTGCTTTTCA
2616711
2616712
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TCTGTTGCATAATCTCCAGTCAGCAACAAGTCAATAAT
2616778
2616779
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CGAAGCAATAGCTTAGCAATACAAAGCACAGCATAG
2616843
2616844
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TATTACCACCTTTACCGTCCCCGGTCCGTTCCAGAG
2616908
2616909
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACTCATCTTTTGTCAGTCTTGGCACATCTTGAACTTC
2616974
2616975
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTCGAGAAGAGCTCCAAGAACTAGAAGAAGCTGAGA
2617039
2617040
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAACAAGAGCTGATGATTTAGCAACGATGATTGTAG
2617104
2617105
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CCAGTTATAGGCATTCCTTTGCTAATCATTAAATAC
2617169
2617170
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CAAGCACCAGAACAACAACAGTTTATGCTTGAAGA
2617233
2617234
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TGTTCAAAAGAATCAATAGCAAATTCGCTTCTTAAGA
2617299
2617300
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GTATGTGCTGTAGTTATCACAATATCACTTTTTGTG
2617364
2617365
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ACTCATATCCTAAGAACTCTTCATAAGCAATTCCATT
2617430
2617431
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
GAATGCATTCTCTGCAACATTCTGAGACATGTCCC
2617494
2617495
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
ATTAAAGAAAGTGTTTAACACGACAATATAATAATT
2617559
2617560
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CTTGATGTAAACAAAGTATTAGTAGTCTTTAAAGA
2617623
2617624
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CATATAAAAGCCCATAGACAATCAATTTTATGCTTAA
2617689
2617690
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGAATAAGTCCAATTCAAATCCAAACTCTATGAAGC
2617754
2617755
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGAATAAGTCCAATTCAAATCCAAACTCTATGAAGC
2617819
2617820
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGTATTTTCTTGTTGCAATGTAAGTATCATCATAAGC
2617885
2617886
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CATCGTGTATTCTCTCTAACTGATGCAGTTTTAATGC
2617951
2617952
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTAATCATTGATGATTTAGGAGCTGAAAATGAGAC
2618015
2618016
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTCTACCGCTCTTCTTCCTTTGCGATAAACAACCCA
2618080
2618081
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAGCAGAAAGAGCACAAGGTTAAGCGAATAGTGGACA
2618146
2618147
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTAAAAAGCTTTTAGGCTTGCAAGCCAACAACAAAAT
2618212
2618213
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TTCTGAAGCTGAATCAAAAATTGGGCAAGCACAATAA
2618278
2618279
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AGTATCAGATTGGCAAGAAAATACCCAGACTTTGGAC
2618344
2618345
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CAACAGCAGATAGGCAGACTTTTATCGTGCTTTGCA
2618409
2618410
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CATTGCCTGACTGTAAGCATTAATCACAGCTGCTAT
2618474
2618475
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
CTTTCTAAAACTTTACCAAACTTCTTGCTAACATACTC
2618541
2618542
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
TAGCATTTAAGCAAAGCTATGTTTCGTATGCACAGAT
2618607
2618608
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
AAGAAATCAATCAACGTTACCATAAACGTTGAGAAAA
2618673
2618674
GTTTACATCCCTAATAGTTCAGATAAAAC
2618702
Left flanking sequence : Till position 2613496 (length
bp)
ACCCAACTTTATAACTTGCGTTATAAATTGGAAACACAAAATTCTTGACAAGTCTCTCATTTTCACTCAT
TTTCGTTTATTACAGGAATGCTTTATAAAT
Right flanking sequence : From position 2618702 (length
bp)
CCACTAAAATAAAAATTACCTCATTTATTGATATAATTAGATTATAAAGCATTTACAAATTTATTGCAAT
AAATAAAAGTTTGCAGCAAAGGTATGGTTG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp