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CRISPRs details
NC_014721_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_014721_4                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B
RefSeq :
NC_014721 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014721_4
DR consensus (30 bp) :
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
29
Begin Position :
2652729
End Position :
2654599
2652729
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCAAAAGTCTGCAAACATAGACGGCTCAAGGCTTAG
2652794
2652795
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTTACTTCCTTTTGTTGTAATAAAGATTCTTTCACC
2652861
2652862
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACAAAAACAATACAATGTGATAATATATAATCGTGA
2652927
2652928
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAAAGTAAACAAAAAACCATTTTACCAATCCCATAT
2652993
2652994
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCATAATAAGAAGGTTTAAAAAAATTGAATATACTAT
2653060
2653061
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTATTTGGTTGTCTAAAAACGTGTCAAGTAGTTTATC
2653128
2653129
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTATACATAGCAGTATCCAACATAGGTAATGAATA
2653193
2653194
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CCCCTACCCCCGCCGCCAACCTTCCATTTCTTTCCC
2653259
2653260
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTGATAAGTGAATTCTTCACCAAGCGCTTGAACAACG
2653326
2653327
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGTAAAGCAACCTGAACATTTTTTGCTACGTCG
2653390
2653391
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTGGAGGAAGTGCTCCACTGTTGGGAGGAGTAGAAC
2653456
2653457
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTATTATACCCACCTTCATATCCATGTCAACCCTGA
2653522
2653523
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCTGCTTGAAGTTTGAAATAGTCTTTTTTGTGCTT
2653587
2653588
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GTACAATGAAGCGATAAACAACTAAATTGCACAAAA
2653653
2653654
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTATGTATGTCAATAGTTTTTTAAACTTTCTCTACAA
2653721
2653722
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTAAAAC
ACCACAGACCTTAAATACCCAGACAAAGCCTTCA
2653785
2653786
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AAATTTGCCATTATAACATTGTTGTTTTTGTGTCC
2653850
2653851
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATAATTTAGATGAATTTAAAAAATATTTAATGACTA
2653916
2653917
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTAATACTCAACATCCTATCTATATTCAAAGCCGA
2653981
2653982
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CATTATTGCTTTGTTTGTGTTATAATCTGTCTTGA
2654046
2654047
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTTCTCATCCAATTCACATATCCAACGATAATCAG
2654112
2654113
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AACTTTTTCCAGGTATTTCTCTATATCTTCCATTTT
2654178
2654179
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAAGATGGAGAATTAAGTGAGGGATGGCGTTGTCC
2654243
2654244
AGTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTACTGTATCAGTATGATGAACTGGTATTGCT
2654306
2654307
GGTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTCAGGACGGCAGTCAGGAAATTTTCCAAAACATAG
2654372
2654373
GTTTATAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT
TCAATTTTTTAACGATACATTTCTGAACAATAATCG
2654438
2654439
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT
TTGAGCACTTTGTTCATCTCATGCACTGCTGCTTCG
2654504
2654505
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TATTTCCCTGATTGTTACATGTTCTGTCCATTTAA
2654569
2654570
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGA
2654599
Left flanking sequence : Till position 2652729 (length
bp)
TGTTGACTTTCAAGAGTTTGTGGGGTATAATAGAAATAACCTATAGCAGCTTGAAAACTTAACCATTTGT
TCCTTGCGGCTTTCTTCAAATTATCTACGG
Right flanking sequence : From position 2654599 (length
bp)
GGGAGGGGGGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGTAGGCGGGTGGGGATGAGTTGTAGCTTTCCTGTTC
GGTTTGAGGAAAAGTGAGAGAATTGGCTGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp