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CRISPRs details
NC_014721_6
Flanking alignement tool
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NC_014721_6                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B
RefSeq :
NC_014721 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014721_6
DR consensus (30 bp) :
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
62
Begin Position :
2669623
End Position :
2673685
2669623
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
ACAATTAAAAAATTTTCTTCAATACAAACATCATCAG
2669689
2669690
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TCAAAGTAATATCGAATATCCCCAATTATCCCCTCTG
2669756
2669757
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
AAGCGTGATACAGCTTATTATATGGCATTTGTAGAG
2669822
2669823
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
ACAATTCCTGATATATTTCCATATCCATACTGCAAG
2669888
2669889
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
CTAATTTATCAAGTATCTCATTGTACTTCTGTTGATTT
2669956
2669957
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
AATTTTTTGCAGTAGCGACAGCTTCAGCAAAAAGCAC
2670023
2670024
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TACTTCTTAATGCGTTGCTTTTATTCCAGCGGAAA
2670088
2670089
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TAATTAAAACTAGCAATTTAATAATCCCCCGCAA
2670152
2670153
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
CCATCAATCTTATTGCCGTCTATCTCTGTTGTCCTGCCC
2670221
2670222
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
AGAACTTTTTTGAGCTCAGCTTTGTTAACCTCTTCTT
2670288
2670289
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATAGCTGAATAGCTTCATCTTTAATTTTACCTTTGT
2670354
2670355
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
GTAATTCCTTCGCTGACGCTCCATTTAAATTCGCTA
2670420
2670421
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TTTTTTCTTCTCTGCTAAATGCTTGTGGCTTACTC
2670485
2670486
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATTGTAAAAGATATTCGATATTGCCTAAATCATTCAT
2670552
2670553
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TCACCCTTCTTCCCATCCCTTATATCTAACAATACA
2670618
2670619
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
AAGAAATTGAATCAATAAAAGACATACCAGAAGTTG
2670684
2670685
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TCTTTTCTTTACTCTCACTATCAATTCTAATCTGC
2670749
2670750
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
GATAAAATGGTAAGAAATGGTAGCATGAAGATAAAAT
2670816
2670817
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TAAAAGACCTCGATTGTTGCACCATGCTCTTTACC
2670881
2670882
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TCAGTACCAAATCTGTTCTTGATATATTCAATCACCT
2670948
2670949
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
GACCCTCTAATTGTTTTTGTTTTGACTGATAAAATTT
2671015
2671016
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
GCAAATTATGGAATTTCAGCATCCCAATTGGTAAA
2671080
2671081
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATATCTCAGGTAATCTCAAAATCTCAGAAAAAACAA
2671146
2671147
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CAACATTGTCAATATCCATTTTTCTGTTTGTAAAAAC
2671213
2671214
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATGATTCTGGTAAAAACACACTGAGTTCTGACCGT
2671278
2671279
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATAGCACAAATAGTGTCAGACATGGCTACAAAATAT
2671344
2671345
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TATTTTAGCTTTGTGGTATGGATTTACCAAAGCAGG
2671410
2671411
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TGAACGTCTGAGAGGCATTTTAATGGCATGGTGGT
2671475
2671476
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TTGAAAACTTTGACCATTCATCTTCTTGATTTTGGATG
2671543
2671544
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CTTTCACAATTTTATAATTCCTATGGGTAAAAGTAG
2671609
2671610
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
GTGCCCGGACAATCTGTTGCCATGAGGTCTCTATG
2671674
2671675
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TAAAAAGGAATTTGAATATGCAAGACTACGACAAA
2671739
2671740
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CTCTAATATACCTATTCGTCAAGAAGTCATTGAAA
2671804
2671805
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
AAGTCCTGTAACTCTTTAATTCTTTTTGCCAAGTGC
2671870
2671871
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TGGGATGGAGTAGTACTGATGGCTATGAAGTTTTT
2671935
2671936
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CCCCACTTGAATTGCGAAAAGTAATTGAAACCTAT
2672000
2672001
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TGGTGACGAAAATGAAAGAGTGAAAATATTCACTGTAGG
2672069
2672070
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TAAAAAGGTATTGCAATTATTGTCCTATGCACAGA
2672134
2672135
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATAGATTTCATTTCGCAGCCAATAGAGCGGTTTATA
2672200
2672201
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CTCAATTTCTGTTTCTCTTTTCTCAATTATTCTTGA
2672266
2672267
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TATAATAGCCCATTCATCAAAAACTTTTTCATCGAA
2672332
2672333
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TATAATAGCCCATTCATCAAAAACTTTTTCATCGAA
2672398
2672399
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CACAAAATTATAGTTTGGCGCAATGTAAACACGAACA
2672465
2672466
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TCTATGTCTTCTTCAAGATACATATCGAGCAGCTTATT
2672533
2672534
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATACTTTTTTTCTCACGGTCTGTATGGCCTGTTCA
2672598
2672599
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TTTCTAACAGCGTTCAAATCAGCTGCGTCCTCGACGA
2672665
2672666
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
ATTTTTCTTTGCAAGAATGGTTGATTAACATAATTAG
2672732
2672733
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
AAATAGTTCTCCCAAGATAAATAGAGAACATTTAG
2672797
2672798
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
GCTAAAGCAATATCAGAAGTATCATGGTTTGAATTT
2672863
2672864
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TTTTCTACATTGTAATAATACACTTTTATAGGAACT
2672929
2672930
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
AAAATTTTGGGCAGAGCTTGGATGGATTAAAGCTCA
2672995
2672996
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TATTAAACGATTATGAAAATAATTTGCCAATTGATA
2673061
2673062
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAT
AGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGCTTAAAGCCT
2673127
2673128
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
TGTGTAATCACTACGTCAAAGGTTATTCCTTCTCCGT
2673194
2673195
GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC
CTGAGATAAAATCATTTAATTTAAGTCTTACATTAG
2673260
2673261
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTTTTTTGCTTACTCTTGGTTTAAATTCTTTTCTC
2673326
2673327
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CATGCAGTTAATGTTGATTACAGTTAATATTATAATCG
2673394
2673395
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATTTATAGAATTTTTCTGCCCAGTTCTTCATAG
2673457
2673458
CTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
GAGAACCAACCTCAAATGCATTGTCACATGTTGCT
2673522
2673523
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
TCAGTACCAAATCTGTTCTTGATATATTCAATCACCT
2673589
2673590
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
CTTTCACAATTTTATAATTCCTATGGGTAAAAGTAG
2673655
2673656
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAGGT
2673685
Left flanking sequence : Till position 2669623 (length
bp)
GTTGACTTTCAAGAGTTTGTGGGGTATAATAGAAATAACCTATAGCAGCTTGAAAACTTAACCATTTGTT
CCTTGCGGCTTTCTTCAAACTATCTACGGG
Right flanking sequence : From position 2673685 (length
bp)
GGTGGAGGGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGAGAGAGCATTTTCTCTAAATTGCAATATTAAA
TGCAACACTTTTTTAAAAGGAACTGGAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp