Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_014721_7                                                                                                                 top


Strain : Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B RefSeq :NC_014721 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014721_7
DR consensus (30 bp) : GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACNumber of repetitions :28
Begin Position : 2689674 End Position : 2691480

2689674GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAATTTTTTATCATTGTTATTTTTTTAACAATGCATTGA 2689738
2689739GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACATTACAACATAGGTAATGTTAATGATGAAAGAGCTA 2689804
2689805GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACACTTTACTTCACAGGGTAGAAAAATTATTTTAGGG 2689869
2689870GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACCCGCTTTTATAATGTGCTTCATAGGCTTTGACCATA 2689935
2689936GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTCCTCTATTTTATCGAGAGCCCCACGATAGGGTCTCTCGA 2690005
2690006GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACATATAATATAAAACCGTATCAAAATAATACCTAAT 2690070
2690071GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTCTAACTTTTTTGTTTTTACTAATCCTTTAACATTG 2690136
2690137GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACGATGAAGATTTATCGCAATACTTTGAAGAAGAAA 2690200
2690201GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTAAATTTTGGTCGGGTGCAAGTAAATCATTAAAA 2690264
2690265GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACATTCCTACTAAAATACTCGGTTTTTAATTCCTACCA 2690330
2690331GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTGACACGATGCGGATATTTAACCTTGACGAAATTAA 2690396
2690397GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACGAGAAGACTGTGTAATACATTTGGAGGGAAGTAAGA 2690462
2690463GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTTCCCGAATAACTGAAGATAGAGCTATTTCGTCA 2690526
2690527GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTTTCAGAAGCTTATCTAAGTTGAAATAGATAGT 2690592
2690593GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACGGGTGAGCTAATACGCTCATCCCTTTAGCGTTTATA 2690658
2690659GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACACTTTTTGATTGACGATGTTGATGCTGCACAGGCTA 2690724
2690725GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTCGTTCTCGTTGTAGGCCATTGCGAACTGTCCTATA 2690790
2690791GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACCCACAGTGTTCACAGTAAAAGTACTCAGGATGAA 2690854
2690855GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACCACAAAATTATAGTTTGGCGCAATCACGGTCTCCTAA 2690921
2690922GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACCGAAATACTTTACCATATCGGTAATTATATTTTACC 2690987
2690988GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACGAATAAATACTTCTCTACCACACCTTCTACAAATATA 2691054
2691055GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTCGATATCAACAACAAAATCTATTATCATTTCGTCA 2691120
2691121GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACAAATAATGGAACAGAAACTCTTGGAATTAAATCAGC 2691186
2691187GTTTGTAGCCTTCCCTTTAGGGATTGAAACAAAAACTTAATGTGCCAAATCTACAGCTTATTCAAAA 2691253
2691254GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACTCGTTCACATAATTTATCAATCCCCACACCGCCATGG 2691320
2691321GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACAGACAAATAGTAGTCTGCTACCTCTGCCCAGATCA 2691385
2691386GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACACTATATTTGCTAAATCTTGATGCCCGATGCAAGA 2691450
2691451GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGA2691480
Left flanking sequence : Till position 2689674 (length bp)
TGTTGACTTTCAAGAGTTTGTGGGGTATAATAGAAATAACCTACAGCAGCTTGAAAACTTAACCATTTGT
TCCTTGCGGCTTTTCTCAAACTATCTACGG
Right flanking sequence : From position 2691480 (length bp)
GGGGGATTGTAGCCTCCCAGTTGGGGATTGAAACGCTTTATAAACCATGTGACCTTGATACTGTGCATTA
GAAAGACGTTAATACAAATTATTGGATATA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp