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CRISPRs details
NC_015555_2
Flanking alignement tool
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NC_015555_2                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11
RefSeq :
NC_015555 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015555_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
Number of repetitions :
85
Begin Position :
2388534
End Position :
2394161
2388534
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGAACGATGAAGAAAAAAGACTATATAAAGCTAGAAT
2388600
2388601
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GCTTTAAAAAACTTATTATACGAAACAAATATTTCGTA
2388668
2388669
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GGATGTAGAGGCTTTAGAAAAATATATCCATATTGC
2388734
2388735
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GGAGATTTTGAAAATGAAATATGTTATAATTTCAAT
2388800
2388801
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AATTTTAAAAAAGGAGATTGATAAAAATGTTAAAAAA
2388867
2388868
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CTATCGTAAAACTGATGCTTAACTCATCGCCTGCAAA
2388934
2388935
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATTTTAAGTTGCTCTAAGTTTTTGATTGCGTTGTTG
2389000
2389001
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTGGATGTTTTTTAATAAAGGCAGCTTTGTAGCT
2389065
2389066
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GAATAAAATTCCTCTTTTATTTTTTTGCCTATTTTTAAA
2389134
2389135
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGCCTTGCAAAAGTGACGTTAAAACTGTCTTTGTTGG
2389201
2389202
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GTTATTTAAGACTTAACTATACTTTTGATGATAGAAA
2389268
2389269
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GAAACAATTTGATCTGTCATACCACTAAAAGCAGTAG
2389335
2389336
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTTGCATCTTTTTATCCCCTTTTATTTTTTTTCT
2389400
2389401
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTCTAATTCTTCTTCTTTTTCTAAAAAGTCATTTTTTG
2389468
2389469
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CTGCTGATGCAGTGTTTGCAGCGGTTACTGAGGGTA
2389534
2389535
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTACACCAGCAAACATAAACGATCCTAATATAACAT
2389600
2389601
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAAGTTGCTACAAAAGTTGAATACTTTAGGGTGCCTC
2389667
2389668
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGGCTCTTGTGTCTCTGTTGTCATTAGTAATGTAATT
2389734
2389735
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CAAGGTTTTTAAGGCATTTTTATATATATCCATACTG
2389801
2389802
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAGTCGACGATAAATTTATATTCTGGTTTCTTCCACG
2389868
2389869
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ACTCACTCACGCCGTATTTGTCAAGCCAATTACTGT
2389934
2389935
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTACAAGCACAACATTTAATATGTCCGAAAGCGA
2389999
2390000
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTATAACACACGCACAACACAATGTCAACATACAAA
2390065
2390066
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GGCTATGATATAATTCTTGTTGCTCAAGACTTGCGTA
2390132
2390133
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TATATATCCTGCTTTTAGCTATACCAGTATTTGGAAA
2390199
2390200
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GTGGTTTGACTGTTAGTCTTACTCACTATTCTGATCC
2390266
2390267
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGCCTTCTGTTCCAAATATAACGCAAGTTCAGACTTA
2390333
2390334
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CCAAAAATTATCAACGACAAAAACGATGATTTGTATT
2390400
2390401
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GGAATATTATTCCAGCCTTGCACAAATTCTATGTA
2390465
2390466
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTATTCTTGTTACTCGCAAGCTTTTTGGAGGTGCGCAG
2390533
2390534
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CTCTTAACCAATTTTAACACTTTATCCACCTCACTAT
2390600
2390601
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATCTTGATATATTGCTAAAAACTACTTCTTCGCTTGT
2390667
2390668
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCGCAGACAATTACTTGACAAATAAAGAAATAGACA
2390733
2390734
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTCTCTAAGAGATTTAATCCTTTTACAACATCGTCA
2390799
2390800
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CATTGTTAATTATGACGTTATTCAATATAAAGAAAC
2390865
2390866
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAATAAAATAAATGAAATTAGCAAAGAAGAATTAAAGT
2390933
2390934
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CTATCAAGCACAACATCACCACTTGAAGGACTTACAG
2391000
2391001
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTGAAGTGGAGTATTACAAACGTGACAAAAATTA
2391065
2391066
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTGCAATATAATCATTTCCGTTAGACACTCTATTTA
2391131
2391132
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTATAGCAAACGTTTGTCCTCTACCCAAATCCAAC
2391197
2391198
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGATATATATTTTGAAAGACTGCAAAAAATTACTAA
2391263
2391264
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TATTCAGAAATAATTGTTTTAGAAGCGGTATATTGT
2391329
2391330
TTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CAAAGACTTCCTAAAAAAGAGGTCTTTGCGTATGA
2391394
2391395
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ACGTCTTGCTAAAAAAGGAGAAACGTCTGTAGCCAT
2391460
2391461
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTGTATTTTCCAATAGTTGCCTTGCCAACCATAGCAAA
2391528
2391529
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGTATTCACAAGGAATTAAAGCGACAACAAGGCAAAT
2391595
2391596
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAAATAGTCATTCCAGGCAAGCCAGTGCCAGCAGCAAGAA
2391665
2391666
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGACCCAAGACTTGTAACACGCATAACACAGTATGGGTC
2391734
2391735
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTAACATTTACTTCAAGCAAAAACATAATCTTTTTG
2391800
2391801
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CGACAGAGGGCAGAAAATGGTAGAAATCGAAAAGAT
2391866
2391867
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAAGAGAAGAAGGTTACATTAAGCGTTTCCGGTATATC
2391934
2391935
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CCAGCTAAAGATTAAGAACTTGAGAAGCAAGTTAGA
2392000
2392001
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTACTGCAAGTGTAAATTTTGCTGTCGGTGTTCCGTT
2392067
2392068
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTCATTACTGCCATTGCATTTGGGTCATTGTACAT
2392133
2392134
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGGCAGGGCAATGTAATGCAATGGTTATGTTATGC
2392198
2392199
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTGCTATCATGAATGGTATTAATGCTCTTGTAACTG
2392264
2392265
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TATAGACGAAGATTTACCATTTTGAAAGGAGAGTA
2392329
2392330
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GCAGTAAAAGAGGCAGAGGTAAACTTTTGAAAGAATA
2392396
2392397
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CGAAATATTGTTTTTGTTAATGAAGATAGGGGTAGTGG
2392464
2392465
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTGTTTGGAGAGTGGTGTATTTTCAAAGCAGGTGAAAG
2392532
2392533
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TATCGGCAGAACTGGGACGCATATAATAGATTTTTT
2392598
2392599
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CGAATCGCTTACTCTCGACAAATTCCTATGATGAA
2392663
2392664
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATTATTAGCATATTCAATATTTTTATTCTTATGCA
2392728
2392729
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CTCCATAAAGAACCTTCGACTTATCACCCCAATCTAA
2392795
2392796
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TACGCATTGGCGATGTATGGATTAGTAATGTAAAGG
2392861
2392862
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAGTAACATTACTCAAATTATAAGTGCCAAGACTTTTA
2392929
2392930
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GCTGATTGTGGTTGGAGTGCATGTTCAATATAAAGT
2392995
2392996
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTAGAAGTATGGCCGACTTTGAGGTTATGCATAAGGCCT
2393064
2393065
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAACTATCAGGAGGGCTATCCTCCAAAGGGTTTTTGG
2393131
2393132
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CGCTTTTATTTTATCTTTTAAATGTAAACCTATACA
2393197
2393198
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CTACAATTGTTCCTGTGTCATCAATTGTAATTATA
2393262
2393263
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAGAGGAGGTAATTCTATGTTACAAAAAGGAAGTACAGG
2393331
2393332
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GTTGTGTTGCTTCTCAAGGTGTTCCAATACTTTATTATCAT
2393402
2393403
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CATATTCTGTTTTTCCTGCTCCCATTGGACCAACTA
2393468
2393469
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TATTCTTTTTCAGGATGTTCTTCTACTTCGGAATCTGT
2393536
2393537
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GGCTATACTCCTGTCAACAAAGCAGGGGATACGAT
2393601
2393602
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGTTTTCAGGTCGCAAGGAGGCCTAACGTTTAAATA
2393667
2393668
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTACAGCTTAAACGGGACATACAAAACAGCGAAATAA
2393734
2393735
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGCTTTAAGTTTAGGTGAATTACCAACCATGTACAT
2393800
2393801
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCTTTAATGCTTGTTCTTGTTATATTACAAAATAAAT
2393867
2393868
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTTCTTCAGGAGTCGTTGCTTTTATAATTTTCAA
2393932
2393933
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATTCGCAACTTCTTCAACATCAAGTAAATAATTTC
2393997
2393998
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATGTACCAACAGCATCCATTGCATAAAAGGAGGCATA
2394064
2394065
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GAAATTCCTGAACTGAAATATATTTCAGTTCAGGAAA
2394131
2394132
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
2394161
Left flanking sequence : Till position 2388534 (length
bp)
GATCCCATTCACCATTGACAAAAATATCATAGCCTTTAATTAAATGTTTTTTGTCCATTAGGCCTCAACT
CCTCGTAACCAATGCAGCAATAAAAAATTA
Right flanking sequence : From position 2394161 (length
bp)
ACGTTAGAACATAGAAAATTCAATACACTTATCTTGCATAAAATTTATCTCGTGTAAAGCTTATGACTTT
ATTATACCACAAACTTCCGAAAATTCAACT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp