Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_015555_4                                                                                                                 top


Strain : Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 RefSeq :NC_015555 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015555_4
DR consensus (30 bp) : GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCNumber of repetitions :140
Begin Position : 2460483 End Position : 2469714

2460483GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGTAAATATTATAAATGGTGTAATTTCTTTTTTTTCAA 2460549
2460550GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCATATATTGCATTAGCGAAAGCAGAATTAAACGATGAA 2460616
2460617GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACCTATTTGTTGTTCGACAGCCATTACAACATTTT 2460682
2460683GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTATTACTTTTGCCAAACTAACCACCTGCCTTTTCTA 2460749
2460750GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTCCTGAAAATAAGTAATTACTACCGTTAACATAT 2460814
2460815GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACCGAAAATTTCTGACGTGATCTCATGTACTTTTC 2460880
2460881GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCTTCTTGTATGACCTGACCATTTTGATCTGTAACA 2460946
2460947GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAATTTCTATGAGACATTAGAAAATTTGCATGAAAAA 2461012
2461013GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAACCTTAATAGGTTCTATGTGATGTACTGTATCGTA 2461079
2461080GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTGGTTAGTTACAATAGTAGCACCAGTAGCAAGCAT 2461145
2461146GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACCGAAAATTTCTGACGTGATCTCATGTACTTTTC 2461211
2461212GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCTTCTTGTATGACCTGACCATTTTGATCTGTAACA 2461277
2461278GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAATTTCTATGAGACATTAGAAAATTTGCATGAAAAA 2461343
2461344GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAACCTTAATAGGTTCTATGTGATGTACTGTATCGTA 2461410
2461411GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGCGCTGGGTGCAGCACAACCTAATTATGCAACTGG 2461476
2461477GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCCATTATGGCTATACATCAGATTATATTTTTTACA 2461542
2461543GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAAAAACGCCTGTGCAAGTACATCTTTAGCTTTAAGT 2461609
2461610GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCGGATATTGTGTGCGGACAGGCGAAAATAAAGTTTT 2461676
2461677GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAAATGCAACAGTATTGTTGATTGATGACTTATACAA 2461742
2461743GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAATGGTTTTACTGTATCAACTTTTATGAGATCTGC 2461808
2461809GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTGGCAGCAACAGCAATAGATTTTACTACAGCAT 2461873
2461874GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGTTTGGAAAAGAGAAATATTGATGATGGGTATAAATT 2461940
2461941GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGAATCTGAAGCAGTTACACTTATAAATTCAACAAA 2462006
2462007GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGCAAAATGCTCTGGTATTGGAAGAGATAAATTAT 2462071
2462072GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCATATATAAGAGCGGCGAAACCGCCGTCATGGCTAT 2462137
2462138GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTTAAAAGTTCTTTTCTGAAATGCCTCACTTATGC 2462203
2462204GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCGGAACGCTTGAATTAAAAAGCGATGTACATGGGCTT 2462270
2462271GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAATATAAAGATAAAGCTGATTTTACTACATTTGACG 2462337
2462338GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTTAAAAGTTCTTTTCTGAAATGCCTCACTTATGC 2462403
2462404GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCTGCATCTGTCGGAAGTATATAAGCTATAACCTTCTT 2462471
2462472GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAATAATTTAGGTGCAAAAAATGTTGTAGATTATTT 2462537
2462538GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACGAAATGCAAACTTAGAGAAACATTTGTTGAACT 2462603
2462604GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTACGTCAGAGAATTCAAAGCCTCTTGTAAAGTTTTT 2462670
2462671GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACCTTTAAAAACGAGGGGATGGTGTCTAAATTCGCT 2462737
2462738GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGTTTTGTAGATACAGCGACTTGGGGATTGGATTTG 2462803
2462804GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAACTGCTATACTGTTTTTCAGCTTTTGAATTTTTTC 2462869
2462870GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTCCTCGTTTAATTCTTCTGTGCTTTTCTCTACCATA 2462935
2462936GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCGGAGCAGAACTGGCACAATATGGCCTTGCGACATT 2463001
2463002GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTATTCGATGATTTAGGTATGCCGTCAATAATGGTAG 2463067
2463068GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGTTTTGTAGATACAGCGACTTGGGGATTGGATTTG 2463133
2463134GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTTGGCGTAAACGAACGACTTATAAAATATAAATT 2463199
2463200GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAATTTGTATCAATCATACTTAGAAGCAAGGAAATGC 2463265
2463266GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGATATAGTAATGCAGTTTCAGTTCATGTTTTACATAC 2463332
2463333GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAATTCAATATAAATTGTACCGCCTACCTGCTTTGTT 2463398
2463399GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCAAGTATACAAAAAACATCCATTTCTAAAAGAAAAAG 2463465
2463466GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGGTCTAATCTTGCAAGTGCGTTTCTCACATGAGC 2463530
2463531GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGAAGGAGGGGGAGGCAGCGTAAAAGAGACAGAACA 2463596
2463597GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAATCAATTCCTGGCATGTTTCACAGACTGCATTCGT 2463662
2463663GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTCTTTATACTCTCTCGTAGTACCGCCGAAATACCAA 2463728
2463729GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTCATTTATAGCATTTTTAATTTGTTCATTTTTTGT 2463793
2463794GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGCAACTGGATCATCAAAGTTAAGAGGTGCTAAGTC 2463859
2463860GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCCCCAATTTCATCGGCTATAAAAGCCGAAGGTCTTA 2463926
2463927GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCATCTGTTTTTGCCTTTATTTCATCTGCTGTTACATC 2463992
2463993GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTTCTTATACCTCCACTATCCTGGTATATTTTGCA 2464058
2464059GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCTAATAGTTATGTCGTGAAATCAGGCGATACGCTT 2464124
2464125GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCAGAACAAGTAATAAATGGCACTTGGGGTGAGATA 2464190
2464191GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTATTTCATCTTTTACCGCATGCAGGTACTTTTTATCA 2464258
2464259GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCATATAAGAATTTTAGGCAAGGTAGTATCTTTTAAAT 2464324
2464325GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCTCTTGGCAATATGCTTAAACTGCTTACAGATTA 2464389
2464390GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTATTTCATCTTTTACCGCATGCAGGTACTTTTTATCA 2464457
2464458GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCATATAAGAATTTTAGGCAAGGTAGTATCTTTTAAAT 2464523
2464524GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTCTCCAGTTCTCTATCATGTTTACACACTCATA 2464588
2464589GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAAACATTGGAGGAGTTAAAAAAAGAATATAAAAAAT 2464654
2464655GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGATTTCGCAAATAATGAATTCCTGCTTAAAGATGGCA 2464721
2464722GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGCTTAAAAATACAGATCATTGCAAAAGGATCACAA 2464787
2464788GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAAAAAGTACAAGTCAGATTACAGAGCCATATTGAAT 2464854
2464855GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAAAAGCAGCTTTAAATAAAATAATGGCTCAAATTG 2464920
2464921GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTAATAGACAGAATATTGATAGAGCAGGGTTCCGA 2464986
2464987GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTTATGAAGTGGCATTAGATGTATCGAGGTTTGGTAC 2465053
2465054GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCGAAAAAGAGATGATTAAAAACATTCCCGGGAGGCAG 2465120
2465121GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTATGCTTTTTGTTGTTGCTCGTAAATTTGCAAATCC 2465186
2465187GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTCAAGAAGATAATCAGTTCCAGAAGATATAACATA 2465251
2465252GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAAAAATATTATGGTATTGATTTGTCAAGTGAATCTTA 2465318
2465319GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAAATCTTCTTTTGATGCTACAGTTGTTTCTTCTTC 2465384
2465385GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAGAGGCGTAAACAATGAAGTTTGCAAAAAAGTCGT 2465450
2465451GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGTGATTGCTTTCCAGTGTGCTGCCGGTGCTCCTTT 2465515
2465516GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAATAACGCTCAAACAAATGGCAATATACAAATTG 2465580
2465581GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTACAACTACCACATAAAAGGATTTTTAAAAAACGC 2465646
2465647GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGGTGTTATGACTGTTTTGTCTATGTTAGTAGGTGC 2465712
2465713GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTAAGCGCCTTCTCTATTGGAGGAAGTTATGCCAAA 2465778
2465779GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTAGTAATGTAAAGGCAAAGTAATGCAAAGCGCAGCAA 2465846
2465847GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTAAAGGAGTTGGGTTTATGAGCAAATATATCGATG 2465912
2465913GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTACAAAACAAGAATAGAAGGGAGACCTTTATACAC 2465978
2465979GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTATCATTTTCTGTATTAAGCTGTTGTCATCAAGCGG 2466044
2466045GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCATCAGATATAGCAGCAATTGTGCAGCGATATAGA 2466110
2466111GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGCATCTTCGCATGTGGAATACCAACTGTTTTCTTC 2466176
2466177GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACTAAAGCGAAAAGCGAAAGCTTGAAGCGGTAAAG 2466242
2466243GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACAAGTTATAGCTAAGGCTGATGGGCCTTGGACAA 2466308
2466309GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGCTGGGTTATCAACGAGACTATATTCGCTTAACTT 2466374
2466375GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCAGGAAGGTAATTATTTATCACCATTGCCACCTTA 2466439
2466440GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAATGCACCAGCCAATAGCAGTAGGCAAGACCATTCAC 2466507
2466508GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAACTTGGATTTACAGAAAAAGTTAACAAATCATC 2466572
2466573GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCGATACGTATAGTAGTATCGTATGCAGAAAATGA 2466637
2466638GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCACTGCAAATTTCTGCGAGTTTTTTCCAAGCTACAAC 2466704
2466705GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAATTAAAAAAGAAAATAGAAGAAGAATGTAAAAA 2466769
2466770GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGATGACTGAATAAATACTCTTTCGCCGATTTCTTC 2466835
2466836GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCTGATTTGTAGGCAACAGAATTACGAGTGAAGGTT 2466901
2466902GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGCAGTAATAGGAACAGTTATATATATGATTGTTAGG 2466968
2466969GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCACCCGCATGACTGTAAGGCTGTATTGGTTACATCGA 2467034
2467035GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAATATTCAAAAGCGTATTTGAGAAACAAAGCAGAATC 2467102
2467103GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCATAGCTATCTTTTAATACATCTATCCTTTCGTCTTC 2467168
2467169GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGCCTTTTTGTATTTGTGATATTTTGCCTTTGCTCCC 2467234
2467235GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAATTTTGAAATCGCCACGTCCTGAAGATCATATAA 2467300
2467301GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCATTTCCTTTCCCAGATATTAGAATTTGTCGAGACTC 2467367
2467368GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTGTTTGTCCATTGTCAGGTCATTTTTCTTAGCGAT 2467433
2467434GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGTGCTTTCTTTTGCTGCATTATTTACTTTAGCATTTT 2467500
2467501GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTCTTGTTTTTGACGATATTTGTAAGTCGAAAATTT 2467566
2467567GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAAAGCCTAAAAATATAACTAAAATTCCGATTGCGTA 2467632
2467633GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGGTGAAAGAGAAAAAGGTGGTTATTCAGAAGAAGAA 2467698
2467699GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGCTGTAAAAACATTACAGCAACAATTAAATCAATT 2467764
2467765GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCAATGGGGCAAAGATATGATAAATGGCTTTATAAA 2467829
2467830GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGATAAATATTTGTTAGGTTATCATGCTATCATTTGCTA 2467897
2467898GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCATAATCAACTATGTCACTAAATTTATATATTTTGTC 2467964
2467965GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTACATAGCTTGTCGTCATATTATCCCATATCACAA 2468030
2468031GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGGGCCAGATTCATATTTAGCAACACAAGAAATTAT 2468096
2468097GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTGAAGAGGAGGAAATCGAAGATGAAGAGGATTAA 2468161
2468162GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAATAACTGAAACAAAAGAAGCCTATTATGATAATAA 2468227
2468228GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGAGACATAAAGAGATTTAAAGTAACGCCAGATATG 2468293
2468294GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTAAACGACAAAGTTGTTGTTAGAAAATGTTTGTT 2468358
2468359GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAACGCCACTTTCAATGTCAATTTTTTCATCGCCTTT 2468425
2468426GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGCTGTCAAAAGTCCTTTTGCTACCGCCTGTTTTACT 2468492
2468493GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAAAAGTTTGTATGTATTGGCTTTTTTGTTTGCTCCA 2468558
2468559GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGACTATAAATGGATACCAGAAGAAGGCGAAGAAGA 2468624
2468625GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTCTCTGGCAAGTTCATCGAACCAATCATCGTCTAT 2468690
2468691GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGTTTGTCCATCGCATTGAAAACTTTGTGTAATACTGT 2468758
2468759GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTGTATTCCTACAATCTTTGTAAATATCTTTGTAAA 2468823
2468824GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACCGTTAAATATACTTCTTATTCCAGAAATTACG 2468888
2468889GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAAATTTGCTTCTCAGAAATCAGGGTATTGAATACGC 2468954
2468955GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGATATGAACTTGACAGAATATTTCAGCGTAAATAAAT 2469021
2469022GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGAACTGTAAGGTGAGAGAAAACAAGAGGACAAGCTA 2469087
2469088GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCCTTCAATACTTTACAGAGGGCAGCGTACCAGAAGCA 2469154
2469155GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCACATTGGCTCACCTGCTCTTATTGTTCCTAATAT 2469218
2469219GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCAAAAAGCAGATGTTGTTATTTTTACTGACAAGGAC 2469284
2469285GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCCTCCTACAAGTATAAAACCTTCTTCTTCGCCTTCTTC 2469351
2469352GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTTTCAGAAAGTCTAAAAGAAATAGTCAAAAAGTACA 2469417
2469418GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTACTGTTATTAATATTCCTAGAGCATATATTTTAAA 2469483
2469484GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCTAGGAGAGTGATTTGTTTTGAGTGTTACCTTGTATAC 2469550
2469551GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCGGATATTACCTTTTACAGTTTTTACTGTCACTGAGTTT 2469618
2469619GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATCAGTTTATGCATCTGTTATTGATTCTACTTATGCTAA 2469684
2469685GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC2469714
Left flanking sequence : Till position 2460483 (length bp)
TCATGCTATTTTATAGCCAAATAATATTGAATTATCAAGGTACAGAGCTACTTTTATAAGTGCGAAGTTT
GAGTAATTTATGTATAATAATTTTTTTGTG
Right flanking sequence : From position 2469714 (length bp)
CCACGAAAATTGCATGAAAATACTTTCCCGCTTAAATTCAATTTAACACAACATGAGTTATTTTTCAATA
CTTTTTAAAATTCCAGTCCGTTTATTGACA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp