Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_016749_1                                                                                                                 top


Strain : Streptococcus macedonicus ACA-DC 198 RefSeq :NC_016749 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_016749_1
DR consensus (36 bp) : GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACNumber of repetitions :51
Begin Position : 1412482 End Position : 1415817

1412482GTTTTATGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTTTCTAATACGAATTTTCGTATATTGTTTT 1412547
1412548GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCTGGATAAATACGGAATACCAGTTAGTAAT 1412613
1412614GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTAAAGAAATTACCTTTGAAGTGCCTATTTC 1412679
1412680GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTGCAAATCGAGCTAGGTTGGATTACTATCG 1412745
1412746GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGAAAAAGTCGTAATGTTTGACGGTAAGCCG 1412811
1412812GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCCAGAAGCGTTCGCTGATTTGAAAACAAAAT 1412878
1412879GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTTCATACATCACCTCAAAATACAATCATTT 1412944
1412945GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTAGTACGTGGCATAGGTATCTACCACAAGC 1413010
1413011GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACATGAGAAAACTCTTACATATCAAACACTTG 1413076
1413077GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTCTGGGCTATAAGTGACATCAACATACGA 1413141
1413142GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCAATGTGCCTAACCAATGAAAACAAGCTTT 1413207
1413208GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAGCTTGTTGTGACAAGGTCTTCATGGCTTG 1413273
1413274GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAATTGTGCTTCTACTGCTCTATTCAGTTCA 1413339
1413340GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAACCTACATACCCTTGTTTACCTGTTTTAC 1413405
1413406GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCTGGTACTGGTTACTTTAACAGCGGTTATC 1413471
1413472GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACATAAAGTTGTTGACTATGATGAAGAAATAA 1413537
1413538GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACATACGCTTTAAAACTAGCTATGACTAACGA 1413603
1413604GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCGTATATCAAACTCAGGAATAACCGCATTCG 1413670
1413671GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAGTGAACCGCCAAACCACTTGGGGACGGCG 1413736
1413737GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTCGTAGAGACGATACTAACTACAGGCCTAT 1413802
1413803GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACACACGAACTGGGCTGCTTGTTTTGTTTGAA 1413868
1413869GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTTACTGCGATAGAATTATAGCCTGCTTCAT 1413934
1413935GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCTACTTAACGTCCTTACGCATTTCGATGGA 1414000
1414001GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTAGCGATTGCAGGAATTGCCGCTTTAGTAG 1414066
1414067GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAAAACTTATTATGTTTGGTTGCGAAAGGCA 1414132
1414133GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGCTAGAGCCGTATCAACCTAGCTGGAAGTA 1414198
1414199GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGCTGTTTCAGAAACATTGAGTTTAGCGGTT 1414264
1414265GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGTTCATCTTGCGTGAGCCCAGCTTCTTTGC 1414330
1414331GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCACTCGCTTATGTTGAACGTGAGCTTGTAG 1414396
1414397GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCAAGCATTGTTTTGTAAACTGCCATTTGCA 1414462
1414463GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACACAGTGCAAAACCTTCATAATTGATGAAAA 1414528
1414529GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGCCAATGGAAACTGATAACAGCTTGTCATA 1414594
1414595GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCAAGCATTGTTTTGTAAACTGCCATTTGCA 1414660
1414661GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGTGAAGACACCTGCATTGAACATCTGCGTC 1414726
1414727GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACATATCGCTTATGCTGATAATGCCACAGGCG 1414792
1414793GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAAGCAGGGCTTTTTCTTTTTGGGCAGGCGC 1414858
1414859GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTTAGAAGTGCAGATGTTAGAAAAGAAATCA 1414924
1414925GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTGGGAGAAAGATAGCAGTTATCCAATCATT 1414990
1414991GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAGAGATTGTCAACAAGAACCAATCAACCAA 1415056
1415057GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAAGCAGGGCTTTTTCTTTTTGGGCAGGCGC 1415122
1415123GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTTAGAAGTGCAGATGTTAGAAAAGAAATCA 1415188
1415189GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTGGGAGAAAGATAGCAGTTATCCAATCATT 1415254
1415255GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACAGAGATTGTCAACAAGAACCAATCAACCAA 1415320
1415321GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACGCCTTTGATTCACTGGTATGTGTCGTTGCA 1415386
1415387GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTCGTTTAGCTTCCAACGCATTCAACTGTTG 1415452
1415453GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTGTTCCTTGTGTATAACCACCAAAGACTTC 1415518
1415519GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACTTGCCGACAACGCTACTGGTGGCGGATTTA 1415584
1415585GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCCGAATTTGGCTTGACCTTGTTTTGCAAT 1415649
1415650GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACCTGATTAGATAGCCATTTTCTCGCAGCCAT 1415715
1415716GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAACACCAAAGATATGCTGACAACTACGCAGATT 1415781
1415782GTTTTACGGTTACTTAAATCTTGAGAGTACAAAAAC1415817
Left flanking sequence : Till position 1412482 (length bp)
ATAAAAAGTTTTAGAAGTCATTTCAAGAAAAGAAAAAAGCATCATAAGATGCTAAAAAGGTTAAATATTA
TAAAATGATTTCGTCTAAAAGCATATTAGT
Right flanking sequence : From position 1415817 (length bp)
CTCAAATCGTCATTTTTAGTTTTTGTATCCTACAAATCGATTATAGTTTGATTAGGCAAAAAAGTCAATC
TTTGTCCTTTAAAAAGCTTATTTCTAGCGG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp