CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_017027_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_017027_3                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06
RefSeq :
NC_017027 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017027_3
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
22
Begin Position :
1613482
End Position :
1614770
1613482
AATTGACACTGCCTATACGGCAGTTAAC
CAGCTCAAAAAGCCAAAACACCGCTCTTTGGT
1613541
1613542
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGCCCGCGACAAGTGGTTGCAGATCCAAGCGT
1613601
1613602
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TCATTAACGATGTTGATGCTTATGATGGTGAT
1613661
1613662
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACGTTAAATTTTACGGCAGTCTTAGACAGTTT
1613721
1613722
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GAAGATGTGGGCGGGTTTCACATTCGTGAGAT
1613781
1613782
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTTAGTTAAGCCGCTCACTGAAGCTTTCGAGA
1613841
1613842
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAATACGGCTCAATTGCACAAGTGCCACTTGC
1613901
1613902
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GATTAACTTTAATGTACGCAGACAAGTGAGAA
1613961
1613962
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAAAAATAATCTACAGACCATTCACTACGCTT
1614021
1614022
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AGAATATTTAGTCGTTGGAAGACTTGCTGAGT
1614081
1614082
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CCCGACTGTCGCGTTATTAATCTTGTTCGGTT
1614141
1614142
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AGCTGATGGGAATTATTCCAACAAATGCGGCA
1614201
1614202
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTAAACGGCATTTAAACACTATCAAAGGAGTA
1614261
1614262
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGAGGGTGGCAAACTCAAAAGAAAAACAGTG
1614321
1614322
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AACAAGTGCCAGTGTGGCGTGCCGTCGTGGTGC
1614382
1614383
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CATCGCAATGGAAAAGATGCGTTGTGAAAAAT
1614442
1614443
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAGATTTTCTAATATCAAATTCAGTAAGTTCT
1614502
1614503
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GTTATTCCGCTGCCGCAGGTTTAGCAGACCTT
1614562
1614563
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACATTGATTGGCTAGCAATAGAACAGGATTTT
1614622
1614623
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAGGTTTAACTTCAACCGTGGAACGATTAAAA
1614682
1614683
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CTCAGTAGTCTTTGACTATCAAAAATCGGAAG
1614742
1614743
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
1614770
Left flanking sequence : Till position 1613482 (length
bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACTTATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 1614770 (length
bp)
TGAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCGATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTT
CTAGACATAAAAATAACCCTTTGATCTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp