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CRISPRs details
NC_017173_8
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017173_8                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile CF5
RefSeq :
NC_017173 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017173_8
DR consensus (29 bp) :
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1742778
End Position :
1743729
1742778
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
TTTTTTAGTTAGTATTATTTTTGCTTCAAGGGGCAATG
1742844
1742845
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
ATAAAAAATGCAAATATAATCAAAATTATCATTCCTAA
1742911
1742912
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
ATAGGTTACAGCAGTAAACAGACTAACTGGAACAAATC
1742978
1742979
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
TCTGATGACATGAAAGAAATACTTGATATTTTTAGT
1743043
1743044
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
ATTAAAAAAGAGTTAGAAGGTGGATTTGCAAAAATTA
1743109
1743110
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
AGTTGTCACAATATTATTTTTAATTTCTCCTAACTT
1743174
1743175
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
TTAGGTTTACAATTTAAACATCTAAAGTCAAGTAAAA
1743240
1743241
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAG
CCAGAAGAAGCCGCATCTGCAATAAAGAAGTATGGA
1743305
1743306
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAG
ATTGAAAAAACGTCCAAATAGCAATATAATTTAATTA
1743371
1743372
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAG
ATTTATGTCTGATTTGTGTCCAAAAATAACCGATTTGT
1743438
1743439
GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAG
ACACCTCCAAACACTGCAATTTCTCCTGTTTTCAATA
1743504
1743505
GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAG
CCTATAGGAAGCTTAACTATATGTTCATAAAAAACA
1743569
1743570
GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG
1743635
1743636
GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
TGCTGTGATTTCACTAATAAAACAATTAATAATTGT
1743700
1743701
GTTATAGATTAACTATGTGGAGAAAAACT
1743729
Left flanking sequence : Till position 1742778 (length
bp)
GGTATGTGATAAGTGTTATCATTTGCACTACTACCCGCTCACTGCAAATTTAAGAGAGTTGTATATGTGT
AGGTATTGAAAATACTCAACTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1743729 (length
bp)
AAATAAACAAAGAAAGCACTTACAAATATGTAGGTGCTTTTGTTTTGCTCAAATTGGTCGGTTGAGTGAA
ATAATTAGAAAAAATTAGTAAAAACTAGTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp