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CRISPRs details
NC_017174_12
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017174_12                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile M120
RefSeq :
NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017174_12
DR consensus (29 bp) :
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
33
Begin Position :
3266657
End Position :
3268778
3266657
ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAAAC
TTATCCATTCGCTTTAAAAAATCCCTTGCGAAACGT
3266721
3266722
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACTAACTCCAGTCCACTGTAATTACTATTCCTTAAT
3266786
3266787
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CATTGCATATAAGATAAGCTGCATTGATTTTTTAGGT
3266852
3266853
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGCATTGTAAACTAAAATGCTTTATTCTATATTTA
3266917
3266918
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TCTATTAATAAAATTATCTAATAAAGATGCAAACCC
3266982
3266983
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACACATATTGCCTTCCCTTAAATCTCCAAAATCTATG
3267048
3267049
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGCTTATACTTCTTGCAACCTGCTCCTATAACATAA
3267114
3267115
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAT
CTTGCTCTGCTTCGCTTTTACTCATTGTGTCAACTG
3267179
3267180
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACTACAATAATAGTGCCTTTTAGCAAAATTTACTAG
3267244
3267245
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACTTTTCACATAACCATGATACATTGCTCTACTTAA
3267309
3267310
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AATCGGAGCTAATTTAGAAATTAAAGAGCTTACAAT
3267374
3267375
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAAATTATCTGCGTATCTTCCAGTCGCAAAAGCTA
3267438
3267439
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CCGTATATATACCCATCGAAAACAAAACATTATTTCG
3267504
3267505
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TGTCAGTAGAAGCTATTTTTGAAGGTATTTTATGC
3267568
3267569
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTTCTCTATCATATTGTATATTATCTCTATCACATG
3267633
3267634
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTATCAATCTTAAGCCAAGTACCAGGTTGTCTACCAA
3267699
3267700
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GAGAACATGCCCAACCAGATTTTAAGGGTGCTTTAAA
3267765
3267766
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATAAGACTTTTCTTCTGATTTAGTTTTAAACTGTCTCT
3267833
3267834
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTATATTGAAATTTATTATGCCTTCATTTTACCATT
3267898
3267899
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTGCTTTACCTGCCTTTCCCTGGTCTCTTGATACTC
3267963
3267964
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGGAGAAATGGCAAGACTTACGGAGTTTGGAGTTA
3268028
3268029
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGCCACATCCCTCTTATATTCTTCTTTTTCATCAAA
3268094
3268095
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTTTCTCTTAAAAATCCGTTATTTTCTTAGTAAACCA
3268160
3268161
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AGAAAATACAATTACAGGAGTTGTGAGGATATTTTAGA
3268227
3268228
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAGAAGATAGAAGAAGCAATATAAAAGCAAAAATGCG
3268293
3268294
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GGAATTACTTGGGACTAAAAAAGTAGAAACAGTTTT
3268358
3268359
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ATGCTACAGCAGAAAAAGTTGTAAGTATAAGCAA
3268421
3268422
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTGTTAATCCAAAGAAAGTATCTCCCATTTTACCATC
3268487
3268488
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACTTGATGGTATTAAACTCTCTAATATTATGCAATT
3268552
3268553
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATATCAAAGCTGGAAAATCAAGAGTACAAAGATAT
3268617
3268618
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTGTAAATAGTATCGTGTTTCTCTGTATAAAGAAT
3268681
3268682
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TTGTAAAGCTCCTAAATCTGCTCCTGCTAGAATATATTG
3268749
3268750
CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
3268778
Left flanking sequence : Till position 3266657 (length
bp)
TGATTTTATTTATATCTTTATTGTTTAATTTCCTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATCATGTTTATAGGTAAGTGTATTTT
Right flanking sequence : From position 3268778 (length
bp)
CCCAAAATAGGTGTAATTGAATACATTGAAAATACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAACAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp