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CRISPRs details
NC_017174_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017174_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile M120
RefSeq :
NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017174_3
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
10
Begin Position :
1343256
End Position :
1343882
1343256
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTCAAAATTAAATAGTTGGCTATGGTTAAGGGATTGCC
1343322
1343323
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATAATAGCAGATATGATGTTTAATAACGGAAGTATAAG
1343389
1343390
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTGAATGAACCTAAGGTAGTTGAACAGATTGAAAAGAC
1343456
1343457
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TATGTCAGGACTTCTTAAACCATATTCAGCATACACTC
1343523
1343524
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAATTTAATATTGCTGGAAAAGGAGAAATGGATATTG
1343589
1343590
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AATGCTGAACTTAAAGTAATGATGCTATTTTGGGACA
1343655
1343656
GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
AAATTTGCAAGGCTAAATTGCCCCTTAATTAATGGTG
1343721
1343722
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGTTTTTCTATATATTCAGATATTTCACTTTTATCTT
1343787
1343788
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GAAATATGTATAGAAGCATTGAAACAAGATAAATATT
1343853
1343854
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
1343882
Left flanking sequence : Till position 1343256 (length
bp)
GATGTGTGATAAGTATTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTAAGAGAGTTGTATAGATGT
AAGTATTGGAAATACTCAATTTGTTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1343882 (length
bp)
TTTATATTCCTCACACATATAATACAATTAATTCAGTTTTAATTGTCATTATGCTCAATATTTAGTTTTT
CTGTATCTTATAAACCAAGAATATAATTGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp