Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_017174_5                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile M120 RefSeq :NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017174_5
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :18
Begin Position : 1826292 End Position : 1827440

1826292GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTGTAGATAATGCAGAAGAAGAAGAAAAACAGATT 1826356
1826357GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGATGCTACCTTATTTTTATCTAATCCCCAAATAAACT 1826422
1826423GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTATTTCTTAACCAGTCAAATAATCTATTTTGTCCTG 1826488
1826489GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATCATAGTTTATTAACACAGGAAACGAGGTTAGTTC 1826553
1826554GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAACTCTTTTAAAAAAGAATATACGATTTTCAGAGAAG 1826619
1826620GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTATTAATTGCTTATCTATTAATTCTTTTAATTTTTCA 1826685
1826686GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGAAGGGTTATAAAAAAAATAATAGCGAAAAGGGCG 1826750
1826751GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCACGAAAAAATCAGAAGGGGAGGGGGGTTATTTAAAA 1826816
1826817GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAAAACTTGAATTATTTCAAAAAGCTAAACATCAAG 1826882
1826883GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAATTGCCCTTCATAGAATATTATTTCACCTTCTT 1826948
1826949GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTATGAGAAAGTTGAATTTAAAGGCGAAATGAACATGG 1827014
1827015GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCTTTATATTGATATCCAAGAATAAGCGCACGTTCTT 1827080
1827081GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGCTTAGCGCAATAACTTTTGAAAATACTACAGGAGT 1827147
1827148GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAGATGTCCAAATGCTAAGAGAGAATTCTTAGGATA 1827213
1827214GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAGAAGTTTTGAAAGTAAATGTGTAAATAATAATA 1827279
1827280GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGAAGTCAACAATTTGGCTATTGGTTAAGTACAACTAGC 1827346
1827347GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAGAAAATTGGGTTTTTGATTAAGAACTTGCGAAT 1827411
1827412GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT1827440
Left flanking sequence : Till position 1826292 (length bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTAAGAAAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1827440 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACTCCAATAATTTATATAGCATTTTCTCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAGTAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp