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CRISPRs details
NC_017174_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017174_5                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile M120
RefSeq :
NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017174_5
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
18
Begin Position :
1826292
End Position :
1827440
1826292
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTTGTAGATAATGCAGAAGAAGAAGAAAAACAGATT
1826356
1826357
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GATGCTACCTTATTTTTATCTAATCCCCAAATAAACT
1826422
1826423
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTATTTCTTAACCAGTCAAATAATCTATTTTGTCCTG
1826488
1826489
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATCATAGTTTATTAACACAGGAAACGAGGTTAGTTC
1826553
1826554
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AACTCTTTTAAAAAAGAATATACGATTTTCAGAGAAG
1826619
1826620
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TATTAATTGCTTATCTATTAATTCTTTTAATTTTTCA
1826685
1826686
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGAAGGGTTATAAAAAAAATAATAGCGAAAAGGGCG
1826750
1826751
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CACGAAAAAATCAGAAGGGGAGGGGGGTTATTTAAAA
1826816
1826817
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTAAAACTTGAATTATTTCAAAAAGCTAAACATCAAG
1826882
1826883
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTAATTGCCCTTCATAGAATATTATTTCACCTTCTT
1826948
1826949
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TATGAGAAAGTTGAATTTAAAGGCGAAATGAACATGG
1827014
1827015
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCTTTATATTGATATCCAAGAATAAGCGCACGTTCTT
1827080
1827081
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGCTTAGCGCAATAACTTTTGAAAATACTACAGGAGT
1827147
1827148
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAAGATGTCCAAATGCTAAGAGAGAATTCTTAGGATA
1827213
1827214
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAAGAAGTTTTGAAAGTAAATGTGTAAATAATAATA
1827279
1827280
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GAAGTCAACAATTTGGCTATTGGTTAAGTACAACTAGC
1827346
1827347
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAGAAAATTGGGTTTTTGATTAAGAACTTGCGAAT
1827411
1827412
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
1827440
Left flanking sequence : Till position 1826292 (length
bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTAAGAAAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1827440 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACTCCAATAATTTATATAGCATTTTCTCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAGTAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp