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CRISPRs details
NC_017178_10
Flanking alignement tool
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NC_017178_10                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile 2007855
RefSeq :
NC_017178 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017178_10
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1288149
End Position :
1289102
1288149
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG
1288214
1288215
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC
1288281
1288282
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG
1288345
1288346
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA
1288413
1288414
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG
1288479
1288480
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA
1288547
1288548
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT
1288610
1288611
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT
1288676
1288677
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA
1288742
1288743
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG
1288808
1288809
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG
1288874
1288875
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG
1288941
1288942
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC
1289007
1289008
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA
1289073
1289074
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
1289102
Left flanking sequence : Till position 1288149 (length
bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1289102 (length
bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp