Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017178_10                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile 2007855 RefSeq :NC_017178 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017178_10
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGNumber of repetitions :15
Begin Position : 1288149 End Position : 1289102

1288149GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG 1288214
1288215GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC 1288281
1288282GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG 1288345
1288346GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA 1288413
1288414GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG 1288479
1288480GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA 1288547
1288548GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT 1288610
1288611GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT 1288676
1288677GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA 1288742
1288743GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG 1288808
1288809GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG 1288874
1288875GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG 1288941
1288942GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC 1289007
1289008GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA 1289073
1289074GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG1289102
Left flanking sequence : Till position 1288149 (length bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1289102 (length bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp