Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017178_15                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile 2007855 RefSeq :NC_017178 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017178_15
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :19
Begin Position : 1841322 End Position : 1842537

1841322GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT 1841387
1841388GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA 1841453
1841454GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA 1841520
1841521GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG 1841586
1841587GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC 1841652
1841653GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA 1841718
1841719GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG 1841784
1841785GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT 1841851
1841852GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT 1841916
1841917GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC 1841982
1841983GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA 1842048
1842049GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC 1842113
1842114GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA 1842179
1842180GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA 1842243
1842244GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT 1842309
1842310GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT 1842377
1842378GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT 1842443
1842444GCTTTATATTAACTACATGATATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT 1842508
1842509GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT1842537
Left flanking sequence : Till position 1841322 (length bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1842537 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTACTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp