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CRISPRs details
NC_017179_20
Flanking alignement tool
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NC_017179_20                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile BI1
RefSeq :
NC_017179 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017179_20
DR consensus (29 bp) :
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
Number of repetitions :
10
Begin Position :
3499448
End Position :
3500070
3499448
ATTTACAACTAATTTAGTGTAATCTAAAC
TTGTAGTGCCTAGTCACAACTCTCACCCCTTCAATA
3499512
3499513
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
CTCTCTACTAAAATTACTTCCACATATAGCTACAGA
3499577
3499578
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
TGTACCTGGGTCTTTTATCTTACTTGTAAGTGTACTTCT
3499645
3499646
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
ATTGCAGATAGGTCTGTGCCATCATTCGTGCTGTTAC
3499711
3499712
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
TGGGATGGATTTTGAAGCTTCTATGTCAAATGTACA
3499776
3499777
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
GAAACCTCTCTTTAAAATTATTCATAGAATTTATAAA
3499842
3499843
ATTTATAACTAATTTAGTGTAATTTAAAC
ATTGTTGCTAGAAAACATTAAAATACATTACACATA
3499907
3499908
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
GGCTGGACTTGTAATAGTTGTAACTAAAATTAGTGAA
3499973
3499974
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
GGGTAGAATGAATCAAATAGCAAAAGTACTTTCCGGAAT
3500041
3500042
ATTTATAACTAACTTAGTGTAATTTAAAC
3500070
Left flanking sequence : Till position 3499448 (length
bp)
GTTGGGGTATTATTGGGGTATAATTTTCTACTTTCTAAAACTCTTGCTAATTCAATAATATAAATCAAAC
TCTCAGTTAAGTTTCTTAATGAATAAGTAA
Right flanking sequence : From position 3500070 (length
bp)
CCCAAATAAAACTATAGTAATTACAACACTTGTAGGGTTATTAAAATAGTTAATTTGCAGTGAGGCACCA
GTAGTGTTTTTAGCTAAAAACAAAAATTCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp