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CRISPRs details
NC_017274_8
Flanking alignement tool
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NC_017274_8                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus solfataricus 98/2
RefSeq :
NC_017274 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017274_8
DR consensus (25 bp) :
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
Number of repetitions :
71
Begin Position :
2076433
End Position :
2080895
2076433
ATTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTGAAGATAGAGTTAAATGAACTTTTGATGACACAAAA
2076495
2076496
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTCTACACCTCTTGCGTCTATTATGATATCATATTTGTCAA
2076561
2076562
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATACGTTTTCTCCATTGTCATATTGCGCATAAGTTGA
2076625
2076626
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACCAAGTGAAACTTGGAATATATAACCAAAAAGATAT
2076687
2076688
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GATTCTTCAATAAAGCTGGTAATATACTTTGACAGAAT
2076750
2076751
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGTAATAGAAACTCATTCAGAGTCTCTTCCAACCCGTACA
2076815
2076816
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGTGGTAGTGGTGGTAGTTGTTGTTGTTGTAGGCG
2076875
2076876
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
2076939
2076940
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TAGTATAGTGTTACAGTTAAACGCTGTACCGAATAATGG
2077003
2077004
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAAATGTTTAATATTGGTGGAGTAGTTGATTTCGATAATAT
2077069
2077070
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGGGTAATAGAAAGCATGCCCATATCAGCAAGTTCTAA
2077133
2077134
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAAAATCCCCAACGCCACATACGTTATAAGGGAAGATA
2077197
2077198
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTAGTGTTAAAATATATTTCAAGCCTTACGATGAGAA
2077259
2077260
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGCATCAGTTCATCGTAGTTGAACTCAGCATGGAT
2077321
2077322
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAATCCATTCGAGGAAGTGTTAGAAGAGGTGTATGGTGA
2077386
2077387
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAGAGGGAAAAAGTTTGCAGGAGATTTCAAGTATTACA
2077449
2077450
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAATATTAAATATTAGTGATTTGGTAATAACGAAAATAAA
2077514
2077515
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAGTGAGACCATGATCATTAACACTGATATTACGGTAAG
2077578
2077579
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACAAAACTTCACCAGTGATGGAACATTTGAATGTAA
2077640
2077641
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAACCGCAAGCAATAATGTACTTACGATAAGGGTGATACT
2077705
2077706
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATATGATTATGAGCGATAAGAATGATGCAATATTAGATATAT
2077772
2077773
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAATATACAGAGAATAGAGAATAGAGAACAGAGAACGG
2077835
2077836
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CCGTGATCAGATACAGTAACAGTCATGTTTTTATCT
2077896
2077897
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CATGGAAACGGGAGGAGGGTGAGACAATGAAGGTTAC
2077958
2077959
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CACATCTTTAGAGGCGAACTACAGGGGGTACAGCAACT
2078021
2078022
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GTAGTGTGAGTAGTGTAGTAGTAGTGGCCTGAATAAGTAG
2078086
2078087
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAATTCTGCAAAGGTAACACAATTGACGAGGTAAA
2078146
2078147
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CGGTTACGGGGACGTTTGGACATTTAGCAGCGCATCCCAA
2078211
2078212
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TCCCTTCCTCTCTTTCCGCTTTTGCTCGCTTCGTTTAACT
2078276
2078277
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGCATAACCGCTGCTTTCGGCTGCTGCTGCTAATTGGTCTC
2078342
2078343
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CCTTCAGCAAGTTGAAGATCTTAAGCGTTTCTTCATCTT
2078406
2078407
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCTGAACGACGTAAACAAGCTCGCACAGAAGAAAAT
2078469
2078470
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AAGTCACTGAATTGTTGGACGAACTAACTGAAAAAATTAG
2078534
2078535
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGCATTAGAATATGGGTAAAAACTTATAGCGACGAAGA
2078597
2078598
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGAAGTACTTGTTAATGTTTCACCTCTAAAGAAGAT
2078658
2078659
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TTTACCACCGCTCAGACTTCTTGAGATGTTTAAAACC
2078720
2078721
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GAATTCTATCAAGTATTGCGGAAGTAAATACTTCATATTTATCA
2078789
2078790
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TCCACTTGGCATATCTTTGGCTGAAGTTCCTTGGTGTG
2078852
2078853
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CTTCAAGTTGATGAAGTTATAAAAATGTTTGAAGCT
2078913
2078914
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CACATTAGCAAGAATCGTGCTAGCTACAGTTGGATT
2078974
2078975
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AACTTGGAAGAGTTTAGTGATAAAATCATGGAAATGTTC
2079038
2079039
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
TGTTAATATTGCCGGTTCGGCTAGTGATATAGTGTGGTTCT
2079104
2079105
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
GGTAATGGTCTGTATATTGTCTTTAAGTATTTAT
2079163
2079164
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
AGCACTAATTGCGAGATTTGAGGATGCCATCAGAAGTAA
2079227
2079228
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
CAAGCTAAGATTGCGAGTACAAGCGATCACTTACACAAAG
2079292
2079293
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ACGCCGTTTCTCTATAGTTATTGAACCATGCAATATCATT
2079357
2079358
CTTTCAATTCCTTTTAGGATTAATC
ATTAGCTAAACCATTTCAAAGGCTAACATCTTCTATGT
2079420
2079421
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAAATCCACAAAGTGGCCGTTCAAAGCAAAGAGTTTATT
2079485
2079486
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGATATTTATTTTCTCGTGAAAAGTGGAGGGCCTAGAAC
2079549
2079550
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATTATATCATGGAGACCCAGGTGCTGTGACTATCAA
2079610
2079611
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTAGCCAGCGTGCCATCTGGGTAAACGTGTATTTTGGTTAA
2079678
2079679
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATATTTCGTTCCAACTACACCTAATGGATTCGGG
2079742
2079743
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAATTGTCTGCCCTTGAGTTCCACTGAGAGAAACGC
2079803
2079804
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAGACGTACAAATATACATCGCACCGAACGGACACAT
2079867
2079868
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GGGTGCGTGCCCCACAGGTCGCGGGTCTACCCCTTGC
2079929
2079930
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TTATGTCGTTATCTTCTTCGTTTTTGCTGCGTTGTTT
2079991
2079992
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GATAAAATATTAAATTCTCAAATTCCATTTAGAG
2080050
2080051
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAATTTGAAACAATATCGCATCTTGAATAATTAT
2080110
2080111
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
GCTTCTTCCCAACGCTGTACGTACTCTTAGGTGTCACA
2080173
2080174
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTACAGGAAAAAGACGAACTAAATGAGGAAGAAATG
2080236
2080237
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TACTCAATTTGTGCGCAGTTTTTCATTGAGGGAGACTT
2080299
2080300
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AAAAATTCTGAGTGCAATGTATAATGAAAATATGGATAATA
2080365
2080366
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TGTTGTCCAAATAAATGCTGTACCGACTAACAATAATGTA
2080430
2080431
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAGGAGTTGGAGGTATTATCGGAGCATTGTTAGCAT
2080491
2080492
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATGATTTGAAAATAGATGAAGAGCTATCTAAACTCATTCC
2080556
2080557
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ACCACATTATGAAGGTACTCCAGAATTCTCTAAGAT
2080617
2080618
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
TAGATCTATTCGCAGAGTTTGCATCAACACATAAGTAC
2080680
2080681
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
ATAATATGGTGAAAATTGAAGGTGAATCATTAGCAAA
2080742
2080743
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
AATTTTTTGTTTAAAGATGATTCAGTGGAAGAATATTA
2080805
2080806
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
CAATCCCAAAAAGTAAATCCCCAATCTTCAAATAATATGG
2080870
2080871
CTTTCAATTCCTTTTGGGATTAATC
2080895
Left flanking sequence : Till position 2076433 (length
bp)
ACATTGGCTTTGGAGAGGTAGAAGTAAAATCACTTAATGGTTAATGAAACGCTATTTTCTCACTCTAATG
AGGATTATTTTACTTAGACTCTATTGCGTA
Right flanking sequence : From position 2080895 (length
bp)
TGTTGTGTTTTTATACTTCCTATTTTTCTTTTCTCCTTTCTTACTTATAAATCTTCATGACTACCCTTTA
CTCTTCATGCGACCAATTTTAGTTGTAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp