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CRISPRs details
NC_017276_4
Flanking alignement tool
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NC_017276_4                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus REY15A
RefSeq :
NC_017276 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017276_4
DR consensus (24 bp) :
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
Number of repetitions :
59
Begin Position :
738848
End Position :
742629
738848
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCTCTATTCCAGCCATCTCAACAACTCCTCCTCTTTAACC
738912
738913
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTTCACTAGACCGTGACTGTCGTTTAGCTCCAGCGGACTCG
738978
738979
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAAATATTTATAGAGAGAGATGAGTGAAAGTATATGGCAATAGG
739047
739048
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTTCAATATAAAACTACATTCCTGCCATGAACCATCT
739110
739111
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAGAAAGATACGTGTTATCTATTCGTAGAGCTTCTTATTCCT
739176
739177
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCGTTTTTTAGGGAAGAGTTTGGCGAGTGTGCAGCTTATTA
739241
739242
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCGCTATTATTGTCAAAGAAATAATATACTTTTATCTCCTG
739306
739307
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTTATCAACAATAACCTGAAATTCCTCGAATCTAAAT
739369
739370
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTCAATATTTTCAACCGACTGGAATAATATAATAAATCTGAAA
739436
739437
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCATTTCCTAAGATCCCTTACATTTTCCAAGTAAGAGAA
739499
739500
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAGGAGTCGTAGCACAGGGAGCTGTACAGTCACAGAA
739561
739562
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTATATACTCATAATCTCCTATTATTTGCCTCTCGGCA
739624
739625
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAAGTGTTACGATCTTTTTTACCGACCCTTTTTCTGATT
739687
739688
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTCTGTTCTTTGAGAACGGGTATGAGACTATCTTTAG
739749
739750
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATATAATTCTTGTAAGCCTAACACAATTTTTCTAACTTG
739813
739814
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTCTGTTGTAATAGTTCTTGTAATTCTTGTAATGTTAACA
739878
739879
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCACTCTATTAGGCTATTGTTGTTTGTGCTTCTTCCCTGT
739942
739943
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAATGTTAAACATTCTAAGATCTTGAAAATCTGTTCTTG
740006
740007
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTTCTTAGTTACTTTGTTTACGAAATCAATTGCATCCT
740069
740070
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTTGGGTTGAAAAATAATTATATAATTAATAACTA
740130
740131
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GGCTGGATAAACTGCACGTGCACCGGTGTTTGGCTAGCGGGCA
740197
740198
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCGGGAATTGGTGTGGAAACTCTATCACAATCCACCTTCTCCAG
740265
740266
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGGAATTCTTTCTATATACGCGACCTTTAGGATAACTATAAT
740332
740333
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCTAGCTGCGAAATTTGTATCGTTAGCTCGTAAGGCAGAC
740396
740397
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATTGACCTTAAACGTTACAACTCTCACGGGATCACCTCATA
740462
740463
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTATTTTATCAGTAGGTACACCTCTGACTATTTTTAATT
740525
740526
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACACTGTATGTTATGATATGAAAACCTGGAAGGAACTCGAT
740590
740591
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTGATTTATTTATACTGTTTATTAACCTTAAGATTTTTTTCA
740658
740659
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGGAATGTAAAATGTACCGCCCTAGGAAACACGAAACTCC
740722
740723
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCGGAAGAGATAGTTAATTCAATAGTTGTTTTTTCAGTCTTGGT
740790
740791
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACGGTAAAAACGCGTAAAACAACCTATTTTGGGTTG
740851
740852
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCTGCACTACTCCTAACCTTAGTTAATACGACACCTATTA
740916
740917
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATTTAATTTCCAAAATTACAATTCCTAATGGAATAGCGGGAA
740983
740984
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAATTTCAACAAAGAAAGAGCCGAATTACTTAACGATCT
741047
741048
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATACTGGAATGAACCCAATACTAACTTCTACATATGCACAA
741113
741114
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCAGGGTTCGTAGATACTTAAAAGAGCTGTACGGGGAA
741175
741176
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCTCTGATGTTGGTGCTAGTTTTACTATCAGCGATGGCAA
741240
741241
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATTTGCATCTTTATATAGAGAGTACAAGTTCTTTATCT
741303
741304
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTCCAGAACACGAATCTCGTCTTTTAGTTTATTTAATTT
741367
741368
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAAATTGTATACATTTCACCTGCTAATTTATATATAACAACAT
741434
741435
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTACTGGATCTTTGAGTCCTATTATTCCTATTACTTTGTTAT
741501
741502
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGATCATACATCATGTCATAACTTTTCATGAGTTTCTACGC
741567
741568
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAGCAATAATTACGCCCGAGATCATAGGACTGGCTTATGG
741632
741633
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTGTTACGCCGAGTGCCGGTAACACTTGAGCCATTTGC
741695
741696
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAGTTAATGTCGTTAAGTTCTAGGTTTAGCAAAAGTCGA
741758
741759
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATATTAAGGAGATTCCTAATTCTGAATGCTAACTCTTT
741821
741822
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GGTCTAGCCGTAATTAATGGGAAAAATTGATATGACT
741882
741883
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTGTAAATTGTATTATATATCCATTCATATCTACAGATC
741946
741947
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCTCCACCGCCTTTTACCATTCCCTGAATATGATAATAGT
742010
742011
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTTCTTTCTGCTTTTCGTACTAGGTTTTTCTTCTTTTTCT
742075
742076
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAGTTTCACCGAGTGGTCTATGGTTATTAATAAAATAT
742138
742139
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAGTAAAATCCTAACTTTGAAAGGTAGGCGTCTAAAAAATTGTTGTCCA
742211
742212
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAAAAGACTTAATAGTTACAGCAAAAATGGTCAAAAAAATACAG
742280
742281
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATACTTTTTAACGTTTTCATTTATCATGTTTCTATCACTAA
742345
742346
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTCCTTTTTCTCCTATAGTAGGAATAGATAAACAACTTCGCT
742411
742412
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCGTACTGTCCTCTCAGCAAAGCCCTATATTTTTTCGT
742474
742475
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAGGAACACCAATTCCTATTCCTACAGCTGCAGCTGTGCCG
742540
742541
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTATTGAATAAAACAGAGTACAAAATATTTAGTGGTGATAA
742605
742606
GCTAATCTACTATAGAATTGAAAG
742629
Left flanking sequence : Till position 738848 (length
bp)
TAATGTAAGCTTCTGATGAATTGAAAAATATCTGGCTAATCTACTATAGAATTGAAAGTTTTTCAGCGTC
AGGCCAGACAGAAGCGATAGTTCTATTCCT
Right flanking sequence : From position 742629 (length
bp)
TATTATGGCCTATGATTTTGACACACTTTCCTCAATTTTCCTTTCATAATCAAATTATTATATAAATTAA
TAAATTAAACGAGAAAACTCTTTAGTGAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp