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CRISPRs details
NC_017547_2
Flanking alignement tool
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NC_017547_2                                                                                                                 
top
Strain :
Listeria monocytogenes Finland 1998
RefSeq :
NC_017547 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017547_2
DR consensus (29 bp) :
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
Number of repetitions :
59
Begin Position :
543872
End Position :
547675
543872
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AGTTTTAGAAGTATGTTAGACGTTGACGAAAATC
543934
543935
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TCAAGCTGGTATGCACTTTTTGAGGTAAGCTATTG
543998
543999
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GAAAAAGAACCAGTTAAAGAACCCGTGAAAGAAGAAC
544064
544065
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AAAGAAAACTTGCAGCAGAATGACGCAAATCATGAA
544129
544130
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AGAAATTCTCATGGCGCTAATAACCCCATGCCAGACGA
544196
544197
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
CATTTCAATCACTTCTTTTGATGTAACATTAAGC
544259
544260
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TGTAACTGCAAACGTCTTTCCGCAAATTCGTGTAGT
544324
544325
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTATCCATTCCGTCATATCCCCACGCATCTGTTCCA
544389
544390
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AGAGTTTCCAGCTGTAAGGCCAGATATTGATAATTTC
544455
544456
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TATGAAATTATCTGCGAAGAGGGAAAACTAGACGAT
544520
544521
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AGCGGTTTTTCTTCTATAGAAGTAACTTGCTTTTGT
544585
544586
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GTTTATAGTATGTAAAACAAACACAGGAAAATATATC
544651
544652
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TAAATTGTTAAGCTTGTCAACAACCTGCAAGAACT
544715
544716
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GTTTCCAGTTTCTTCTATATAAACAACAAAAATAAAA
544781
544782
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ACGAAAATAGCTAAATTGGATTTACTTGAGTCTTTTTTC
544849
544850
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
CAAAGCAAGTACAGAAGCGTATTATGCTCTATTAGAGT
544916
544917
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ATTTAAGTATTAATGTTTTTAAAAAGTTTGATTTATT
544982
544983
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TATCAAAAAGCTTGTGCTATTATGGAAAGTCGTTGGGA
545049
545050
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTTAATAACTATGACAGTGAATTTAAAACGAAAGCG
545114
545115
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TCTGGAGAATCTGATGTTAAAATCTCTGATCATGTTGT
545181
545182
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AGAAATTAAAGAAGGTAGGGCATTCGTTGCACCGGAAA
545248
545249
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AAAATTAGCGTTCCAAAAATAAGACCTGTCGCAAC
545312
545313
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ATACTAAAACTTCGCTCATTTTCCGCAACTCCTT
545375
545376
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTAAGAAATATGATTGATTCTCTGGATATCACTTT
545439
545440
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
CCTCCACAATCACTCGGCTTTCTTCGTCTTTATCGAC
545505
545506
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ATTTAACAAATCAGCTAAATCAGCGCGACTCTGATA
545570
545571
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GTCGCTAGAGCTAAAAAATGGATAGAGGAACAACAAG
545636
545637
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TCAACTAATATTAATATCTCTTGTGGATTGGCCATT
545701
545702
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ACTTGAAGGACGTGCTTCAAAATATTTAGTTGCAT
545765
545766
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TCTGTTGTAACTGTTGTGCCTTCCACAGCGTGCACTT
545831
545832
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ACATTTTGCACGCACCAAGCTTGACGGTCTGAAAC
545895
545896
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTTATCTTTATCTATTTCTCCAGTAATAGAGCACG
545959
545960
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ACATTTTTATCTGAGAAAGGGTTTAGGGAAAATT
546022
546023
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AAAAAAACAACTGCGCAAGAAGGGTATGAGCAATT
546086
546087
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GTTGGACACCGTCAGCAGAGCTTATAAATCCACTGT
546151
546152
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTTTTCCATTCTTCTCGCCGATGTATTCCTTTTCTC
546216
546217
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AACAAAAATACGTTATTTGTTCGATGTAATGTAAAA
546281
546282
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TCAACTAACGAGGCAACAGGTGTTTTATAGCTGTAAAG
546348
546349
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TGGTAAATTTTATAGGAATGTCAACACCTTGAATTT
546413
546414
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
CCAGAAATGGAGTGCGCGGTTGATTTTGGATTTAGC
546478
546479
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AAGAACATTAGATGAACTTAAAGCGTCTGTTGAACAA
546544
546545
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AAACCAGAGCCAGAAAAAGAAGTTGTGAAAGAAGA
546608
546609
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ACGTCACTTGTTTTTGCCTTTGTTTTCGCCCTTTCCT
546674
546675
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GTTGAAAAGCGCACCATTGTTTTAATTTTTTTAATT
546739
546740
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTTTGTCGCATAAATTCTTTGATGTGGCGGACTGACG
546805
546806
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
AACAGTATCATCACGTTGTTATTGCTGTCACCTGT
546869
546870
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TAACCAAGCATTGCCAAAAACTCGTCTGTTGATAAT
546934
546935
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTCTATTGCAGAACAGAATGAATTGTATGCACAAGG
546999
547000
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TCGTTAATCATAATTGATGAAAGTCATCATGTGTTAG
547065
547066
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
ACGGGTACCAGCTTTGATTTGCCGTTTTCAATTATT
547130
547131
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTTATCACTCCTATGCTTTTCTTATTTCTGTAAAT
547194
547195
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
GCTTTTTTCAACAATTTTATCACCAGATGTCATTA
547258
547259
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TGAGCAGTGTCACCTGTTTCCGTATCTGCTTTTTTC
547323
547324
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTAATAAATCCGATGGTGATGCCTATGTTATACGTC
547388
547389
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TAAAACATCGCTTCGTTATACAATGTCTTTTTATA
547452
547453
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TGTTATCTCCTGTGATGTAAAATAACCCTTCTATC
547516
547517
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
CAAAACAGAGAACGCGTGTTCATTATCGGACATCTTA
547582
547583
GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAAT
TTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT
547646
547647
GTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA
547675
Left flanking sequence : Till position 543872 (length
bp)
GAAAATCTGAAGGGATAAGTTATGATTTTTACGTAATTTTTAAGAGGTCGACAAAAATAGTGACCTGAGT
TATGATGGGAGTAGGCGTAAAATAGAGCGG
Right flanking sequence : From position 547675 (length
bp)
CGTCTTCTTAAAATTTAAACCCCAAAAATAAAAAAGGCCAGGACCTAAATCCAAGCCTTTTCCTACACTC
CTCTAAACCAACAAAACCACAACCAACGCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp