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CRISPRs details
NC_017764_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017764_3                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida subsp. multocida str. 3480
RefSeq :
NC_017764 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017764_3
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
13
Begin Position :
1618012
End Position :
1618760
1618012
AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGAGTTTTGCCAACAGTTTTCGCAAAATTTCA
1618071
1618072
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CAGAGTTCAAGTCAGCACATCGACTACAAGAT
1618131
1618132
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TCATTAAGCGTCTTAGTAACGGAAAATATAAA
1618191
1618192
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GGTGCTTTAATCTAATTAAAGGCAGTTATGAT
1618251
1618252
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GAAGTGGAAATTGACGAAGGATTAAAAAATCG
1618311
1618312
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACAGTTAAAAGTGGTGATGTCGTCGTGCTAGG
1618371
1618372
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AGCTGATGGGAATTATTCCAACAAATGCGGCA
1618431
1618432
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTAAACGGCATTTAAACACTATCAAAGGAGTA
1618491
1618492
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGAGGGTGGCAAACTCAAAAGAAAAACAGTG
1618551
1618552
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AACAAGTGCCAGTGTGGCGTGCCGTCGTGGTGC
1618612
1618613
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CATCGCAATGGAAAAGATGCGTTGTGAAAAAT
1618672
1618673
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAGATTTTCTAATATCAAATTCAGTAAGTTCT
1618732
1618733
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
1618760
Left flanking sequence : Till position 1618012 (length
bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACCGATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 1618760 (length
bp)
TGAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCGATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTT
CTAGACATAAAAATAACCCTTTGATCTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp