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CRISPRs details
NC_018092_8
Flanking alignement tool
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NC_018092_8                                                                                                                 
top
Strain :
Pyrococcus furiosus COM1
RefSeq :
NC_018092 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_018092_8
DR consensus (30 bp) :
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
Number of repetitions :
52
Begin Position :
1465386
End Position :
1468913
1465386
TTTCAATTTTATTTTTGGTCTTATTGGAAC
CGTAGATTTCTTTTGGCCAGTGTATCAAGGCCAACCGT
1465453
1465454
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AATTGTGGAAGTTCCATCTCAGATTAAATCAGATGTGGGGGCCTCT
1465529
1465530
CTTTCAATTCTATTTTAGTTCTTATTGGAA
CCATGCCCCGAGCCCCCGGCTCGGGGCACTCATCTTGGAAACTC
1465603
1465604
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATTGCATGATCAGTTTACTGTCTCCTTACCAGATTCTCT
1465672
1465673
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTGTAGGATGTAGTCTAGCCTTCTATGTCCCGTGATTTTGCTGATTATT
1465751
1465752
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATGGTATTCTCACCTGGAAGAACGACGTAACTGCTGA
1465818
1465819
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GAGCAACGCTGAGAACCAAAATAATCGCCGCACTCTA
1465885
1465886
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGACATGAAAAACTGTTTGGAGGAGGGGACAATGTTC
1465952
1465953
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGACCAGCAAGCTCTTCGTTGCAAAGAACACTATCACAAA
1466022
1466023
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATGAAAACAACACATGTGGGGTGGTTGGAATGGCTTGGAAAC
1466094
1466095
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGGACACCTTGCCTTATACCTATATAATAACCTAGCATTATC
1466166
1466167
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCAATGACGAGCTTGACGACATAATTCGACAAGTTGCTCTCAATCCAGT
1466245
1466246
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTGTCGGATGAGGAGGTGAGGGAGTTGGAGAGGAAGTT
1466313
1466314
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCAGTTGAGGCAACCCTTGCAAGGTTTGGGGTTGATT
1466380
1466381
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGAAGTAGACGTTGAGAACGGTACCTTCATCGTGGTGGTG
1466450
1466451
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CATCTTGTCCCTAAGGGGAATTTGGGCATTTCTACTCC
1466518
1466519
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATAGAGTACAGAGGATTGTATGCTCTTAGGGAGACAG
1466585
1466586
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ACAGAGAGCTGGACTAGTAGAATGGAAGAACTTTGTG
1466652
1466653
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GCACTACTTGAGCAACCTCCTTCATCAATTCTAGCTCC
1466720
1466721
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTGGGTTGAGGGAAGAAAGGCTGCAGGAGATGAGACC
1466787
1466788
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTCCCAAGACACCCCAGGAATTTCATCTACTCCATCA
1466854
1466855
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GAGGGGTGATGTTTGGCTGAGCGGATTGCGTTTAATAG
1466922
1466923
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TAAGAAACGCTCCATACACCATTGAGAACCCAACCCT
1466989
1466990
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTCCACAATCATCCCCATGCTTGTGCCCAACGCTCCAG
1467057
1467058
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCAAAAACATAGACGACCCAGAGTTAAGGAAAGTGTT
1467124
1467125
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGTCAAGTTTTGACTGGATCCGTATCCGCAAGTATG
1467190
1467191
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGGAACTATTTGGGGGGTATTACCGCAAGAAATACAG
1467257
1467258
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGGAATTCAACAGTGGCAAAGGTTCTATCAGGAATAA
1467325
1467326
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCGCTTGAGGGAGCGACGGCTCAGGCTCAGACCGCT
1467391
1467392
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGGTTCAGGCTGGGAGGCTTGACCCGAGAATAGCGCA
1467458
1467459
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCCTTCCAGAGCCCGTTCACCGTGTCCACGCTGTC
1467523
1467524
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CAAAAATTTTTCATTGCGGGGGGTTCTGACTAATTTGT
1467591
1467592
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTATTTCTGATGGTGTAAGAGTTAGACTAAACAACTCA
1467659
1467660
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGCCGGCCCCCGGCGGGGGTCTAATGACCGCATAGGAG
1467728
1467729
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGAGATGATTGAAATTTTTACGATCAAAGAGGTTCGT
1467795
1467796
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATAGTATACCCTTGACCTTTCAATCCCTTATAGATTCT
1467863
1467864
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AAAAGCGGTGAGGGAAAAGAAAAAACGGGCAAAAAAA
1467930
1467931
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TATTTTTTTTATGTGCAGTAATCGGCAATTTGCTAA
1467996
1467997
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGGGCAAGTTCTGGCCTATACTGTCTCCTAATGTCT
1468063
1468064
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATATACCTCAAGACCAACCACACTGGATATGCAGCAA
1468130
1468131
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGACACATTAGAGCAGTTATAAAAACACACGGCACGC
1468197
1468198
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ACCCGTTCAATTTTTTCTTTACTTTTGTAAAGTTTTGA
1468265
1468266
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCGACTGTAATAACGTCAATTGTCGAGAGGACAGTAGTG
1468334
1468335
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGGGCTGGTGGTGGGTCAAGTTCAACGCCTCACTAC
1468400
1468401
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGCGAAAGCCTGGGAAGAAAACCTTTACGCACATTTCC
1468468
1468469
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGTTTATGTTCGTGTCAGGCTTATTGTTCATTAACGC
1468535
1468536
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTGCCAGTATCCGAAGATTCAGAAAAATTCAGCATAAGAG
1468605
1468606
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCGACCCAGAGCGGGTTGTAGCAGTAAAGTATGACC
1468671
1468672
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GGAGTATTTTGGTATGAAAGTTTCGGGTGCAGAACCGG
1468739
1468740
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGCACTTTTCTATACACGAAAAGTTTATAAACTTTA
1468805
1468806
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CAGCTCTGGTCAGATCAGATTGCTTAAGACAAGAAATGAATCATATAA
1468883
1468884
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
1468913
Left flanking sequence : Till position 1465386 (length
bp)
TAAAAACTCGTGTTAAAAACATCGAACACATATCTTATCAGACCTCACATTCAAATATCCGAGCATGTGT
CTCTTCCACCTTTGAAAAATAAATGTGCTT
Right flanking sequence : From position 1468913 (length
bp)
AGGGGGCTTTTTCGCCCCAATACTCCTACGGAGTAACTATATCACTCGAATTTATAACCTTTACGGGGCA
TCCAACTTACCCAGCAACCCCCCATTTATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp