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CRISPRs details
NC_018648_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_018648_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum B str. Eklund 17B(NRP)
RefSeq :
NC_018648 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_018648_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
Number of repetitions :
16
Begin Position :
2143741
End Position :
2144745
2143741
AATTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAAAC
AAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAAT
2143804
2143805
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
ATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTG
2143870
2143871
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
GATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGC
2143935
2143936
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
TTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACC
2143999
2144000
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
TTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTG
2144063
2144064
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
AGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTC
2144129
2144130
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
AGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATAT
2144195
2144196
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
ATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCA
2144261
2144262
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
GAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACA
2144326
2144327
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
CAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGA
2144390
2144391
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
CAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAAC
2144454
2144455
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
TCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGC
2144519
2144520
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
GACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAA
2144584
2144585
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
AACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTG
2144649
2144650
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
ATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTA
2144715
2144716
ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
2144745
Left flanking sequence : Till position 2143741 (length
bp)
TATATTTCTATAAATTTCTTTGCAAATTCTATTATACTCTATATTTTTCCATATAAAAATCAAAAAACAC
CAACACGTTCAGTGCTGATGTTTATAATTT
Right flanking sequence : From position 2144745 (length
bp)
CACAGTAAAATAGCCATTCTCTAAAATCAATAATACCATTAAGGCATTGAAACTTCAAGGTTTTAAGGAA
ACTTTACCAGCCGTTTGTCAAATTTTAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp