CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_019970_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_019970_1                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795
RefSeq :
NC_019970 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019970_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
42
Begin Position :
266775
End Position :
269560
266775
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AGACATAAAAACAATAATAACGCTAATAAGGCGTTTTA
266842
266843
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTCGAAAATGTGGTATAATGTTACTGGTGATGAAAA
266909
266910
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAAGGATATGAGTTTTATAAGTGGCTGATGGAAAG
266974
266975
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTATACCTACAAGCCTTACCGTTCGTGATGCCAATGG
267041
267042
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTATCATCAGCTTGAAGCAGAAAAAGCGAGATTAA
267107
267108
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTAGGAAAATAAAGGAGAGATGAAAAAATGTTTGA
267173
267174
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAGAATTGTATGCTTTAAAAAAGATTGAATTTAAAGAC
267241
267242
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGCTTTTCGTATACAGTTTTGTACCGTCGCTGGCGT
267307
267308
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAACAAAAAAGAAGAAGGCTTACTCAGCCTTCTTGGACT
267376
267377
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCTCGATTTTGTATATATTTCTGCAAGAGCATCTTCT
267443
267444
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCAGGCTGCACAACATCGCTTGCCTGCCAGTTTGTTTT
267511
267512
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCATAGAATTCCTGCAAATGTCTTGGCTTTAGCTTTGA
267579
267580
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TATCTTCCCAGAATTCTAAAAGCTCTGGATCGTCCTC
267646
267647
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAATGCAATGCAAAATCAAAGTACGACATTTAACGGC
267713
267714
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCTAGTGAAACTATAAAAACAACAAAAACACAGAAACAG
267782
267783
GTTTTTAGCCTAGCTATGAGGAATTGAAAC
CCTTCACCGCAGCATGGATCAAGGACGTTATATTGTG
267849
267850
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATAAGTTCCGCATCACATTTTTCATCATCCATATAG
267915
267916
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGACGAAGAATATAAAAAATATAAACAAGTCGTAATT
267983
267984
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGAACTTAAACAAAAAGGTTTTGATGTTGTTATAACA
268050
268051
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTATCCGATGGGATTGACTTGTACGTTTTGTGTTCCA
268117
268118
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGATTCTTGATATACCTAAAAACATCTTCTAAATTCT
268184
268185
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTATTTTTTCTTTTTCTCCTTTATCGTTTGTTTTAATC
268252
268253
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATCGAATATGAGAAGAATTTGAATGAAGAATTTAGAGA
268320
268321
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AATGATACGCCAACGTTGCCGGGTGAGACACAATTTC
268387
268388
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTATGTTCGTATGTTAAGTAACTTTTGTAAAGTGC
268452
268453
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTAACTCTGAAAACACTCTGCCTAATAACATTGGAA
268518
268519
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTGGATTTGGGAATGTGATATGAATGACCTCATC
268583
268584
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTCTTCAACACAATCAAAAGCATCTTCAATATCTCTAT
268652
268653
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTTTTCGTATGTGTACAATATAGACAATACTCACTATAC
268722
268723
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACATCTTTTGTTAAGCGTCCAATAAGGACTACATTA
268788
268789
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCTCTTACATGGGCCTCAAGAATATTCGGTACGACA
268854
268855
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CTTCCAAATACAGACTTTCCAAAGCTTGAGTCTGCTA
268921
268922
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGGAGCTGGTACTGCACTGCTGAAATTAGCCAGTGA
268988
268989
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATAAAATATTCCGCTTTGATTGTACCGCATTTTG
269052
269053
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TCTTTTGGCAACAAGCTACCAAACACAGAAACCCTGAC
269120
269121
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTGTCCTCAGGCCAGTATAGGCTATAATTTTCACATAT
269189
269190
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAGCATATTGACTCTTTAATTGCTCTATAATATAACG
269256
269257
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTGATAATACATCGAGTTTAAGCAAAAATGGCAGTGTTTTTA
269328
269329
GCCTATAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTATAAGCCAAAGCATATTGACTTCTCAGACTCTCAAT
269397
269398
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTGATGTTTAGCCCTAAAATCGTTGACAAACTGAAAA
269465
269466
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATTTTTAAGCGACTTTTTTGTTTTGTTTTTCATG
269530
269531
GTTTTTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC
269560
Left flanking sequence : Till position 266775 (length
bp)
ATTAGGAGAAAGGAGAGTTTGCGTCATTATCAAGGATGATAGCTTGACATTAACCTGATTTTTTGCAAAA
AGAGAATGGCTTTGTAAAAGGAAGTGAAAG
Right flanking sequence : From position 269560 (length
bp)
TGTGGTTGAAGTACAGCCTGCGGACATGTTCCCTCATACATATCATGTGGAGACGGTCTGCCGCATAATC
AAAAAAAGTAGTTGATATGGCAACAGGATC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp