Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_020291_13                                                                                                                 top


Strain : Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) RefSeq :NC_020291 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_020291_13
DR consensus (29 bp) : ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :26
Begin Position : 5276899 End Position : 5278564

5276899ATTTACATTCCTCATAGTCAATATAAAACTAAAAGAGAAATAGTAGTATGGTCAAAGATTAAAAT 5276963
5276964ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAACAACTGGTGGAAGTAGTGGTGGTTCACATCATTC 5277029
5277030ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTAGCCCACCCAATTTCTCTAAACATATAATAATTT 5277094
5277095ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAAGGAGAAATAAATTTAACTGATGTAATAAATATA 5277159
5277160ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTCCGAAATATCCAAAGCACAAAAAGAAGGCAGAACAG 5277225
5277226ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAATTTACACTAGAAGGGGCTACAAAGGAGCCAGTAAA 5277291
5277292ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTTTCTTAATTTGCTTTTTCCTCCCATTCTAGTAAT 5277356
5277357ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACATGGAAAAATAATTATTGAAACTAGTCTTGATACCAA 5277422
5277423ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACATAAATATCACTTGTAAATCTATCTATTGTACCTTT 5277487
5277488ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGCAAGAAGCAATGTCGGGCATGATGGTATTAATGCA 5277552
5277553ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTCACATTTTTGAGTATACAACAACAAAATATATGCC 5277618
5277619ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTGTACAAAAATATCATCAATGATAATGTTATAATCA 5277684
5277685ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTAGTAATAATATTTTCTTTAGAAGCTATAACAAAGTT 5277750
5277751ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTATAAAGAAACTTTTTGTATGTTGCCACGTAAGC 5277814
5277815ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCTTCAATCGATAAGGATAAGCTTTCTTTTGAGGAAAA 5277880
5277881ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAAATTTATCATTTGAAGCTAAAATGGCTAATATGGT 5277946
5277947ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTACTTTTGATATATCAGTATTTTTAAATTCATAAAG 5278012
5278013ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAAACACAAGATTGTAACGTGGATGGCAACATTCCAC 5278078
5278079ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAGATTTCAGAATTTTAATATTAAATGGTGATTGCGT 5278143
5278144ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTAAAATAATAATTCATTTATTGAGATAGGAGAATG 5278208
5278209ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTGATATCTTTTATTATTCTTAAGCAACCATTTAAT 5278273
5278274ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAATTGAACTGATTCATTATTGAATAGATGATCTAA 5278338
5278339ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAATTAATGTTAAACTTTCATCATCTAAACTCATTG 5278403
5278404ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCTATGCAACAACGCGTCATAAGTGATTTAGAAGCATT 5278469
5278470ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTCATAATATTCACGTATAGTCTTATCAACCATCTTA 5278534
5278535ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC5278563
Left flanking sequence : Till position 5276899 (length bp)
TATGTCATATATTTTTTTCTATAACATACTTATTATAATTTTATTGAATTACAATATATAAAACAATAGC
TGAATCTTTTATTGTTCATTTTTCATCATA
Right flanking sequence : From position 5278564 (length bp)
TAGACTATTGGCTTTGGGATAAATACGATAATAATAATTTACATTCTGTTTAAATGTAGTTGCATTTATC
TTATTGAAAGCTGATAAATACGATAATAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp