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CRISPRs details
NC_020291_14
Flanking alignement tool
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NC_020291_14                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)
RefSeq :
NC_020291 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_020291_14
DR consensus (29 bp) :
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
34
Begin Position :
5278666
End Position :
5280855
5278666
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CTATGGTTGGTGTTGTAGCTACAAGCGGTGGAGCTA
5278730
5278731
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CCTTTACTAGTAAATCTACTCTAACTTTTATCCTAT
5278795
5278796
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TAGAACATTATGACGTTTATAACATGGAATATATTGA
5278861
5278862
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTTGGAAATCTGATAGTTTTAGACAATATTAAAAGG
5278926
5278927
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
ATTGACAAAATTTATAAATCTGTTAAATTATATATG
5278991
5278992
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
AAAATTTATATAGAACATAAAGGGAATATTACTCCA
5279056
5279057
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
GCATTAAGAAATTTTTTTATAATATTAGCCATTCTATC
5279123
5279124
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
GTGATGCGATTGACTTCATTATGAAATATAAAAATTT
5279189
5279190
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
AAACTGAACTGATTCATTATTAAACATATGGTCCAG
5279254
5279255
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TATTCTTTCTCTTTTATTCATGTGTATATCTCCTTT
5279319
5279320
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TGATTATAATTCTTTCAATTCTTTAATTTCTTCAAT
5279384
5279385
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
GTTCTAAAAGTTATTGGAACTGGCACACTCCAATCTTT
5279451
5279452
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
ATGGAATTCAAAGAACATACAACTATGTAAAAAACGA
5279517
5279518
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TAACATTATCCTTAATGTACTCTATCATTATTTCTTT
5279583
5279584
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
ATGATGTGTTAATATCTACAATAACAAATGTAAACCA
5279649
5279650
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTATACATTTATTGCAAGAAAAAAGCAATAAAAATA
5279714
5279715
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
AATGTGGAAAGCTTCAAAATTCAGAAATTATGATTAG
5279780
5279781
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTGATTAGTGACCATGTTAATGAAACAATTAATTTGA
5279846
5279847
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CTTAACAAAACAATTAATGTCTATGGCATTTGAAAA
5279911
5279912
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
GAAGACAAGAAACTTGATGAACAAAAACAAATTCAAA
5279977
5279978
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CTTTATGAAATTGAAGAAAAGAAGAAAAGCAGCAAG
5280042
5280043
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTTAAAGAAAAAAAGAGGCTGGAACGTGAAATTTGG
5280107
5280108
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TGAATATATAATTGATGGGGATGGTATCTTAGTTGT
5280172
5280173
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTAGAGGTAATAAGTTAACTCTTATGAAATCTTATTT
5280238
5280239
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTTAATAGATTCAAATGGAAGATTAAAATAATTAAA
5280303
5280304
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CTCTATAAGCATTGTAATAAGTTCCATATAAAGCAG
5280368
5280369
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTAAAAATACAACAGATACATTATTTATTTTTAATA
5280433
5280434
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
GTAACGCCAAAAAAGAACAATCAGAGAGTAGCCTAT
5280498
5280499
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CTGAAATAGTTAACTGGTTTAAAAACATGAAGAAAAA
5280564
5280565
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
TTGATGAACATAAAATTGATATGAATAATATCCATG
5280629
5280630
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CAAGTGATGCAGGAAAGTTTTACATGAAAATACCAA
5280694
5280695
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
GAAGAAAGTGAGGTTGATTGCAATGGCATTAGGTAAA
5280760
5280761
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
CTTTAGGCGGTAAATTAAGAACTTGTCTCCATTCATT
5280826
5280827
ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
5280855
Left flanking sequence : Till position 5278666 (length
bp)
AGACTATTGGCTTTGGGATAAATACGATAATAATAATTTACATTCTGTTTAAATGTAGTTGCATTTATCT
TATTGAAAGCTGATAAATACGATAATAATA
Right flanking sequence : From position 5280855 (length
bp)
CCTAAAAAAAGTATACCATAACTCTAGTAAATTAGCCATTTATCGCTGATAAATTTGATTTAATTTTTAT
ATTCTTGCGGTAAACCTTTAGTATGGAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp