Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_021823_4                                                                                                                 top


Strain : Listeria monocytogenes RefSeq :NC_021823 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_021823_4
DR consensus (29 bp) : GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATNumber of repetitions :59
Begin Position : 2972636 End Position : 2976439

2972636GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGTTTTAGAAGTATGTTAGACGTTGACGAAAATC 2972698
2972699GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCAAGCTGGTATGCACTTTTTGAGGTAAGCTATTG 2972762
2972763GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGAAAAAGAACCAGTTAAAGAACCCGTGAAAGAAGAAC 2972828
2972829GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAAGAAAACTTGCAGCAGAATGACGCAAATCATGAA 2972893
2972894GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAATTCTCATGGCGCTAATAACCCCATGCCAGACGA 2972960
2972961GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCATTTCAATCACTTCTTTTGATGTAACATTAAGC 2973023
2973024GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGTAACTGCAAACGTCTTTCCGCAAATTCGTGTAGT 2973088
2973089GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTATCCATTCCGTCATATCCCCACGCATCTGTTCCA 2973153
2973154GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAGTTTCCAGCTGTAAGGCCAGATATTGATAATTTC 2973219
2973220GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTATGAAATTATCTGCGAAGAGGGAAAACTAGACGAT 2973284
2973285GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGCGGTTTTTCTTCTATAGAAGTAACTTGCTTTTGT 2973349
2973350GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTTTATAGTATGTAAAACAAACACAGGAAAATATATC 2973415
2973416GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTAAATTGTTAAGCTTGTCAACAACCTGCAAGAACT 2973479
2973480GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTTTCCAGTTTCTTCTATATAAACAACAAAAATAAAA 2973545
2973546GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACGAAAATAGCTAAATTGGATTTACTTGAGTCTTTTTTC 2973613
2973614GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCAAAGCAAGTACAGAAGCGTATTATGCTCTATTAGAGT 2973680
2973681GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTTAAGTATTAATGTTTTTAAAAAGTTTGATTTATT 2973746
2973747GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTATCAAAAAGCTTGTGCTATTATGGAAAGTCGTTGGGA 2973813
2973814GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTAATAACTATGACAGTGAATTTAAAACGAAAGCG 2973878
2973879GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCTGGAGAATCTGATGTTAAAATCTCTGATCATGTTGT 2973945
2973946GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAATTAAAGAAGGTAGGGCATTCGTTGCACCGGAAA 2974012
2974013GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAAATTAGCGTTCCAAAAATAAGACCTGTCGCAAC 2974076
2974077GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATACTAAAACTTCGCTCATTTTCCGCAACTCCTT 2974139
2974140GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTAAGAAATATGATTGATTCTCTGGATATCACTTT 2974203
2974204GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCCTCCACAATCACTCGGCTTTCTTCGTCTTTATCGAC 2974269
2974270GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTTAACAAATCAGCTAAATCAGCGCGACTCTGATA 2974334
2974335GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTCGCTAGAGCTAAAAAATGGATAGAGGAACAACAAG 2974400
2974401GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCAACTAATATTAATATCTCTTGTGGATTGGCCATT 2974465
2974466GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACTTGAAGGACGTGCTTCAAAATATTTAGTTGCAT 2974529
2974530GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCTGTTGTAACTGTTGTGCCTTCCACAGCGTGCACTT 2974595
2974596GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACATTTTGCACGCACCAAGCTTGACGGTCTGAAAC 2974659
2974660GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTATCTTTATCTATTTCTCCAGTAATAGAGCACG 2974723
2974724GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACATTTTTATCTGAGAAAGGGTTTAGGGAAAATT 2974786
2974787GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAAAAAACAACTGCGCAAGAAGGGTATGAGCAATT 2974850
2974851GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTTGGACACCGTCAGCAGAGCTTATAAATCCACTGT 2974915
2974916GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTTTCCATTCTTCTCGCCGATGTATTCCTTTTCTC 2974980
2974981GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAACAAAAATACGTTATTTGTTCGATGTAATGTAAAA 2975045
2975046GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCAACTAACGAGGCAACAGGTGTTTTATAGCTGTAAAG 2975112
2975113GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGGTAAATTTTATAGGAATGTCAACACCTTGAATTT 2975177
2975178GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCCAGAAATGGAGTGCGCGGTTGATTTTGGATTTAGC 2975242
2975243GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAGAACATTAGATGAACTTAAAGCGTCTGTTGAACAA 2975308
2975309GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAACCAGAGCCAGAAAAAGAAGTTGTGAAAGAAGA 2975372
2975373GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACGTCACTTGTTTTTGCCTTTGTTTTCGCCCTTTCCT 2975438
2975439GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTTGAAAAGCGCACCATTGTTTTAATTTTTTTAATT 2975503
2975504GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTTGTCGCATAAATTCTTTGATGTGGCGGACTGACG 2975569
2975570GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAACAGTATCATCACGTTGTTATTGCTGTCACCTGT 2975633
2975634GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTAACCAAGCATTGCCAAAAACTCGTCTGTTGATAAT 2975698
2975699GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTCTATTGCAGAACAGAATGAATTGTATGCACAAGG 2975763
2975764GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCGTTAATCATAATTGATGAAAGTCATCATGTGTTAG 2975829
2975830GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACGGGTACCAGCTTTGATTTGCCGTTTTCAATTATT 2975894
2975895GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTATCACTCCTATGCTTTTCTTATTTCTGTAAAT 2975958
2975959GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGCTTTTTTCAACAATTTTATCACCAGATGTCATTA 2976022
2976023GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGAGCAGTGTCACCTGTTTCCGTATCTGCTTTTTTC 2976087
2976088GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTAATAAATCCGATGGTGATGCCTATGTTATACGTC 2976152
2976153GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTAAAACATCGCTTCGTTATACAATGTCTTTTTATA 2976216
2976217GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGTTATCTCCTGTGATGTAAAATAACCCTTCTATC 2976280
2976281GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCAAAACAGAGAACGCGTGTTCATTATCGGACATCTTA 2976346
2976347GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT 2976410
2976411GTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA2976439
Left flanking sequence : Till position 2972636 (length bp)
GAAAATCTGAAGGGATAAGTTATGATTTTTACGTAATTTTTAAGAGGTCGACAAAAATAGTGACCTGAGT
TATGATGGGAGTAGGCGTAAAATAGAGCGG
Right flanking sequence : From position 2976439 (length bp)
CGTCTTCTTAAAATTTAAACCCCAAAAATAAAAAAGGCCAGGACCTAAATCCAAGCCTTTTCCTACACTC
CTCTAAACCAACAAAACCACAACCAACGCC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp