Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_021826_3                                                                                                                 top


Strain : Listeria monocytogenes RefSeq :NC_021826 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_021826_3
DR consensus (29 bp) : GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATNumber of repetitions :21
Begin Position : 2517049 End Position : 2518377

2517049GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCAATGCTTAAACCGAGAGCATCAAATTGTTCCCATGC 2517114
2517115GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTACAGTACAAGCAAGGGTTATTGAGTTAAATATT 2517179
2517180GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATATTAATGATAAGAGCGGAAAGAAAACTTTCAAGGG 2517243
2517244GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTCCCCCTTAAGATACAAACTCGATTTGACAGGTGCAGGTT 2517312
2517313TTAACTACTACTTATTATGAAATGTAAATTCGTTTATGACCTTATGAAAGAGTTAACACCTCGAC 2517377
2517378GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCTTCCTACTTTTTGACATAAAAAAATAAGCCGAGTTG 2517443
2517444GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAGTTCAAAACCTCCCACACCCGCTATGAATAAATT 2517508
2517509GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTCGTAATTTTACGATTATACTTTTTAGTCAAATTAC 2517574
2517575GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTAACAAGTAGTGTTATACCTGCAACAATACCAGT 2517638
2517639GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTGGAAATGGGAAGAAAGAAATGCACTGATTGTAGAG 2517703
2517704GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTCCACATCGACAATAAAAAACACATTGTATCACTT 2517768
2517769GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATCTGGTTACTCAACTGGCGACAGTAATACACCTCAAT 2517833
2517834GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTGGATAGGTTGTTTCTGATAAATAGGTTCACG 2517896
2517897GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAAAAAAACATCTTTCCAATTTGTTGTTTTGC 2517959
2517960GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATACAAGTGCTAGAACAGAAGTTATAATTTGAACATTAC 2518025
2518026GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAGAAGCGTTAGCGGCATTGTTCGAAAGTAATTTA 2518088
2518089GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTATAAAATATTGCCCAATGTGCGGAAGGAGTTTGGA 2518153
2518154GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATAAGAAATCCGGGAAGTTTTGTTCTACAGAGCGAACGG 2518219
2518220GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATGTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTCGCTAGTTTT 2518284
2518285GTTTTAACTACTTATTATGAAATGTAAATTTTTGAAATATGAGGACTTAGAAAATGAAAAAAAT 2518348
2518349GTTTTAACTACTTATTATGAAATCATAAA2518377
Left flanking sequence : Till position 2517049 (length bp)
GAAAATCTGAAGGGATAAGTTATGATTTTTACGTAATTTTTAAGAGGTCGACAAAAATAGTGACCTGAGT
TATGATGGGAGTAGGCGTAAAATAGAGCGG
Right flanking sequence : From position 2518377 (length bp)
CGTCTTCTTAAAATTTAAACCCCAAAAATAAAAAAGGCCAGGACTCAAATCCAAGCCTTTTCCTACACTC
CTCTAAACCAACAAAACCACAACCAACGCC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp