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CRISPRs details
NZ_AHJR01000001_2
Flanking alignement tool
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NZ_AHJR01000001_2                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus M.16.43 GCF_000245235
RefSeq :
NZ_AHJR01000001 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AHJR01000001_2
DR consensus (24 bp) :
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
Number of repetitions :
85
Begin Position :
860409
End Position :
865757
860409
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATTAAATCAAGAAGAAAAAGAAGTAGATGAGTTTTTTT
860471
860472
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGAAATTACAGAAAAACTTTTTGAGGAATTTGGATTAG
860535
860536
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTATTGTTAATCACCAACTCACCGTTTTGCCAGTACGG
860597
860598
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTATAAATAGAGAGTTTGTTTTTAGCGTATCTACTTTCTCT
860663
860664
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAGAAGAAGATAAAAAGAAAGTCTATCAGAGCATAGATGA
860728
860729
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACCCGCATTCAACCCCGCGGGGGAATCCCCCGGCCCCA
860790
860791
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACGTTAGAGGAAGTACGCAAAACGTTAAGTACCGTCAAA
860853
860854
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAGGCTATGTACCAGTGCAAATAATAGGGCAAAGCGCC
860916
860917
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGAAAGTGTGTATCACACCACACTACTACATTCTCAT
860977
860978
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCTAGGGCGGTGGCAAACCATGTTTTACCAGTTCCAG
861038
861039
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAACTGAAGCACCTTGAGGCGAAGGGCCAAGCGGTGAT
861101
861102
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGGTGCGCCTTGTTGTTCTAAAAGTCTTGCTAATATAT
861164
861165
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACGGGGTTAGCATTATTAGATTCCAATCGTAGAATAAGCCC
861229
861230
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAATCTACAAGATACGTGGGTTACTATCTCACCGCG
861290
861291
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGCAGTAAAACCGCAAAATGGACAAATTCCACCTGGTTT
861353
861354
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCCCTTGTTGAATTAGTAACTGTTGTATCTGATTTG
861414
861415
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCAAATGTACCCCGCAATATCCTCTTTCCTACATTCACTT
861478
861479
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAATTTGATGTTTAATGTTGGTAGTGTAAAGTTTGAAGGAA
861543
861544
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GGTTGATATGCATATGTTTGTTGAAGTGTACGCGAAAATA
861607
861608
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGCCAAAAAGTACTTCCTTTTTGCACATAAAAATTGAAC
861670
861671
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTCTTCTTGGTCTTCCTTTACAACTTCTTCCTCATCCT
861733
861734
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTAACCTTATCTTGCGCCCTAAGAGTAAGACCGTATC
861796
861797
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTACAGAGTGTGAAAGAAGTCAGGTAAGAGATTAAGG
861857
861858
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCTAATTCTCTTTCTGCATTTCTCTCTAAATTTAATTCA
861920
861921
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCAAGGATCAGGCAATATTATTAAATGTAATGGAGATG
861983
861984
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAAATAGATCTGTGAATCCTTCTCTTGAGAGATGATACGC
862048
862049
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCCAATACGTTGAACCAATGCTAAGACCAGTTACAATAG
862111
862112
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCGAATTTCCATCTCATCAGGAACCTGCACAAGTTGCCG
862175
862176
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCTCATCTATATACATCACACCACTGAAATATATTAT
862237
862238
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCGATCAAGAGACTTATGAGTTATTAACTAAAGCAGTAGA
862302
862303
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATACTATCACCTGTAGAGAGATACTGTGTCAGCAATAATTT
862367
862368
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGTTAGATCAAACTCGGGAAGCAGTAAGAAAAGAAGTGTT
862431
862432
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGCTTGCCTTAGCTGAGATTTTAGAACAGGTTTAA
862492
862493
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGGACTCCTCACACGTTTAAGTTTGGGAAATCCAGTTAT
862557
862558
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTTCATTTTGTCTAGCTTATATTGAATAATATTTAATGAT
862622
862623
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATTAACGCAAACTACTAGCACTTTCGCATTTACTTATG
862685
862686
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAGGATGGGGAAGTAATTGATATGTTAAGAGATGGAAGTTT
862750
862751
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTGAAGTAATCCGTATTGTCCTGCAGTCTCGTAATATACTT
862816
862817
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CACTACTATAGAATGATGGTATGATGGTGTACGGGTCGGTAT
862882
862883
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGGTCTGTCGATTGAAGAGCATTTATTATGTTACTAAGA
862945
862946
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTATTTCCATCAGTTGATTGGTCTCCGACGTTAGGTGAGA
863009
863010
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTGTTAAAGTCCTCATTGATGTATAATTCTAACCCTT
863070
863071
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTGGCTTAGCAGATTTAAAGTTCAAGCATATCATTG
863132
863133
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAGTGTGTTCAGGTACTGGGCGTATTCCAACATACTCAAG
863197
863198
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGCTTTAAGTTTTTGTTCTATATCTTCTACTTTTTGT
863260
863261
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGTCGCTCTTTATAGCGTCCATAGCGTCATTTCTCA
863322
863323
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAATTCATCAGTTAAAAGCATAACAATAACTAATCAC
863384
863385
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACGAAATGAGGACGGTGATAAGTATTGATGTCGTTACTATC
863449
863450
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCATACATTCAAAAGCTTATATTAGATAATAAAGATAATT
863513
863514
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATACCGCCGTGAAGTACAATGGATATGATGAAGGAACTG
863577
863578
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GGATAATGAATGTGACGTGCAATATCGTTGATAATATCA
863640
863641
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GACATCATATGACTACGGTTATCAATGGTCAGTAGGG
863701
863702
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTATGACCTTCTCTGGGATTTTATCTATCGCGAACATT
863764
863765
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATCAGGGGATGTAGATTTACCGGTTTACTTTTTACCA
863826
863827
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGAACAGGTTCGTACTCAGGCACAGGCTCGTATTCCCTCT
863890
863891
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTTACTTTACCTTCCCATCCTATTATTTCTTTTGACAT
863953
863954
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAATAGTTTAGAAGCTTTTGTGGCGTAACTGGTGTGAA
864015
864016
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCCACCTTTAGCAATCCATTTCATAGATAAGAATTAGAAA
864080
864081
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGGTTTTAGGTGAAAAGCTTAATCGGGTGAAAAATGTA
864142
864143
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAAGCGGAAAGTTTGAGAGTGTAACGGAGAAAGTTACAA
864206
864207
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTTAGACGCGACGAACTTCCTCATATACTTTATCGCG
864268
864269
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAATGGCACCGTATGGTTCAGTAATGGTTAATACCTTAATG
864334
864335
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAATAGATAATTCCTCGTTTCTATCGTTGAAAGGATCG
864397
864398
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAGCAATATGATGTACTATATTTAAATGAAAAACTGT
864459
864460
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTTTTCTTCACCTTTGATATTTAATTTTACTATGAT
864521
864522
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTATTCTATTAAATGTGCATACTTCTTGATTTGCCGCCAT
864586
864587
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTAGTGCCAGGGTTCAGGGGTGTACCCTCACTGCCACA
864648
864649
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTAGATTAAGTTTTACATAAATTATAGACACGATAACA
864711
864712
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAAACTAAATATTGACGTGAAACCGCAACTAATAGATAA
864775
864776
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAACAATAATAAATGTTACTATTGAGGGCGTATTATTCCCAG
864842
864843
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGTAGTTGCATCTCCTTATTGCCGTTTCTGAACTTCTTTT
864907
864908
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAAGAGTATTAATTGATCTGGCTATAGCGTCCTTCCTTAT
864972
864973
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGATTTTGTAGTGCTTCTTGCAGCAGTAAAGCTCTAG
865033
865034
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTATCGGCTTATATCTAACATCCTCTGGGAGGCTTTCCAT
865097
865098
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTATGCTTATCGTATAAAGTAATTTGCCAAAGTTGTACG
865160
865161
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCGATTTTGGGAATCCCACCGCCCAGCAATTCGCAGAC
865223
865224
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACTCCAGTACTGCTTCGCCGTAGGATCCGTCCTCAGACG
865287
865288
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTCTATTAAGAGAAAGTTACACTTTATCAAAAGACACT
865350
865351
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGAAACAGTGTATGGGATAAATTAGGTATAAGTGGCG
865411
865412
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCACCACCACAGTATATAATACATTTGATGGATTATTAA
865474
865475
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTTCATCACGTCCACGTTTGTTATTTTTGTTGATTTAA
865538
865539
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTCCAAAGTTACGTCATCGATGACCACGTAATGGAAA
865600
865601
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAATAAGCGGGGCGAAGCCGACGTGTACGCCGTGTCTTTC
865664
865665
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTTATATAAAATCAAAATTGTATGAAATCCAAGCTGAAGTTTTT
865733
865734
GATAATCTACTATAGAATTGAAAT
865757
Left flanking sequence : Till position 860409 (length
bp)
AGTGAAAGAATGAGGAGAAAAATTGAAAAGATAATACAGAGTAAAGCTTATAAATAAAGAAGAGAGAACA
AGATATTAGATAAAAGTTAATAAACCCTCA
Right flanking sequence : From position 865757 (length
bp)
ACTATAATGTAAGTTGGATTTTGTAAGTAGAGTCTTTATTTACAATAGTTACAATGGAGTAAGAGGACTA
GTTTTAGCTTAAGATGTTGAAAATGAGCGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp