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CRISPRs details
NZ_CP003328_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP003328_2                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida subsp. multocida str. HB03 GCF_000512395
RefSeq :
NZ_CP003328 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP003328_2
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
22
Begin Position :
1549120
End Position :
1550407
1549120
AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTA
1549179
1549180
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGAC
1549239
1549240
TTTCTAAGCTACCTACACGGCAGTTAAC
AGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATC
1549299
1549300
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCT
1549359
1549360
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGATCCTTTTACGCGTAAACAGAATGCTTTT
1549419
1549420
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TATTCAGAATCAAAACGAATACCCAAAATTGC
1549479
1549480
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGGGTGCGCAAATGGTTTGCGACAAAAGGCGA
1549539
1549540
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AACTATAATAAAAAAGGCTGTTGCCATTGCTA
1549599
1549600
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTT
1549659
1549660
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTT
1549719
1549720
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGAT
1549779
1549780
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCAT
1549839
1549840
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAAC
1549899
1549900
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTT
1549959
1549960
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACAT
1550019
1550020
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAAT
1550079
1550080
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TACGCCATTATGGCGACTGACTTCCGCGATAA
1550139
1550140
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACTTGTGCAAGGGTTGTGTGTTCATAGGCTTT
1550199
1550200
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TAAAATTAAAACTATCGTCGCTTGCTTGTAGC
1550259
1550260
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACTAGCGGAGGCTCAACAATGACGGAAGGTAA
1550319
1550320
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TGTGATTCTGGCTTGTGCAACCGGTATGAGTG
1550379
1550380
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
1550407
Left flanking sequence : Till position 1549120 (length
bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACCGATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 1550407 (length
bp)
TAAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCTATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTT
CTAGACATAGAAATAACCCTTTGATCTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp