Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP007181_1                                                                                                                 top


Strain : Campylobacter coli RM4661 GCF_000583775 RefSeq :NZ_CP007181 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP007181_1
DR consensus (36 bp) : GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATNumber of repetitions :16
Begin Position : 1541970 End Position : 1542995

1541970TTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATGCTTTAGGAAATGCTTTAAAACGCTTTGGA1542035
1542036GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTATGAGTTATCAAGTTTTTGTTTTTAATAA1542101
1542102GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATTTGCAAGGTATATAAAAAATTTGATTTT1542167
1542168GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATTTAGCTGATACTATCGAATTAATCGTAA1542233
1542234GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTGATTTTTATGAGTTAAAAAATATTATAGA1542299
1542300GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATGCATCAAACGCTATTGATTGCAATATAGCT1542365
1542366GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATCAATAAAGCGTTTAATGAAAAAGACGAGTA1542431
1542432GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATCTATTCTCCAATTGTTGAAAGAACAGGCCA1542497
1542498GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATAATTCCTAATAAAAAAGTAAGTTTTGAT1542563
1542564GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTACATTTACTTAAGTCTTTAAACTCAGGGT1542629
1542630GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATACCACCATAACAATTAATAAAATATTGAGT1542695
1542696GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAAATCGTAGGGCTAAAACAATAGCACGAGA1542761
1542762GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATAGAAATTACTACAGCACAAGCTTATGCA1542827
1542828GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTTTCTTATGAAGTTTTTAAAGGAATTATAC1542893
1542894GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATCAAAATTTGATATTCATGAAGTGATTAA1542959
1542960GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT1542995
Left flanking sequence : Till position 1541970 (length bp)
TTTATTTCGATTTTAATCAACCCTAAATTTCAATAAGTTTCAAATTTGCACCTCCTTTTAGTGAAGTAAT
TAGCCCTAGCAGAGTTTCAATCCACTAGGG
Right flanking sequence : From position 1542995 (length bp)
AGATATTTACCAGATAATGAAAATTTCGGGGTTTTTTCATGAAAAATAGCAAAAATTATGCTATAATCTC
AATAAGAAATTTAAAAAGGGACTAAAATAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp