Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP008746_16                                                                                                                 top


Strain : Methanosarcina barkeri CM1 GCF_001027005 RefSeq :NZ_CP008746 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP008746_16
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATNumber of repetitions :73
Begin Position : 2208753 End Position : 2214054

2208753GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTGTCGCCCGATTACTTTTTTGTGTTATTTGGTAATTTTGGT2208832
2208833GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATCTGATATTCATTATAAAACAGACTCCTCTAATTTT2208906
2208907GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTCAGAGGGTACAGCTTTCGGTTTGACTCCTTCAGG2208979
2208980GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAGTATCTGCCTCAAACGGACAGAAAAAATTAGTATT2209052
2209053GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATAATAGACTCGTGCCCATACGTTCTTTATTATAA2209124
2209125GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCATAATCTAGAATTTTGCGTTGAATATAAAGATCTAT2209199
2209200GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGCCTTGCCATAGGGCAGCCGTGACAGTGTCAG2209270
2209271GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTAGTGCTTCCTTTACTACATCAAGTGTATACTCTGGGA2209345
2209346GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGCCTAGACGTAGAATCGACATCCCTTTAGAGAATAT2209418
2209419GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTAGGGCCGGTGTTGGGAAAGTCTGCATCCTGGTCTC2209491
2209492GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATCAGTTTCGTTTTTTTGTTTTATTCATTACTTAG2209563
2209564GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATATGTGATAATGCAATTGATTGATATTGATTT2209634
2209635GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAAAAGGTCGCTCGGGCTTACGATACGCATTATTT2209706
2209707GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGTTAAACAATAGTTACATTTGCAGTCATGTAT2209777
2209778GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGGAGATGAAAAAAGGCGCATTCTGGAACTTTGGT2209850
2209851GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGTTAAACAATATCATTGATGTACTCACCGATG2209921
2209922GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTTATAAAATTCTATCAAATTTTTAAGGGGAGGGTG2209996
2209997GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGCAATCCCAGGAAATCCAAATGTATATCTAATCTT2210068
2210069GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTGCAAAAGAGCACTTCGTGAAACAATTAACACT2210141
2210142GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACCTTTTTATAGATATATCCACGCTCCGCTACCA2210212
2210213GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACAGCGGCCTTGTTGGGGCACTCCTGAAGACATTCAGAAAT2210290
2210291GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCATAAGATGATCTAATTCAGATTCGAGAGACATTAT2210363
2210364GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTAATTTTTGGAGCTGAATTACATGGCTGAACCGTT2210438
2210439GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGGTCCACCTGCGCTCCAATGTGATGTATCAAATGCA2210513
2210514GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCTTTATAGAAGAGATCTCAAAATCCGCTGTAATCAT2210587
2210588GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTAATGTATCATGCGTAATATATAATACACAATAAAA2210660
2210661GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGCCTCCTGGAACATCAATTCAACAGAAAGCTAGGG2210734
2210735GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCATACTTGTTATTATAGAAGAGGTAATATAAAAAGT2210807
2210808GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTGTTGAAGTCGTAGATTCTGGAGTCATATTTTTG2210879
2210880GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATGTATATATTTATTATTTTCAGTGTGTTTTTATAAT2210953
2210954GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATTATCCTGTTGAGATTAGGCTAGATAGTGGAGATG2211027
2211028GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAATGACTGAACGAAATACAATTGAACGCAGAAAAC2211100
2211101GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAAATGAGTCGTGAAATGTGCCGGATCTCATTTTTA2211173
2211174GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAGATCCATTCGGCTAATCATAGCATCATTTAAGT2211245
2211246GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCGGATGATATTAAGAATGTATCTCTTGGGGGTTTTAG2211319
2211320GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTTGTAATATGTTAATATATCGACAGGTATAG2211390
2211391GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCCTCGGGAATTCCATTATTTCTAAATGGTCCAC2211461
2211462GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAACGCAATCGGGCGCTGCTAGGTCGAATGTCTCGAAG2211535
2211536GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTCGCGGCTTCAGTCTCTCCATAGAACAGCTTTG2211607
2211608GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTACAGATCCGGACATATCATAAGCGTTTATAAGG2211679
2211680GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCGGATGTCTCGGAGATAATGACGCCCTGGAGGAGGACCGAA2211757
2211758GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACTTTGAAAAGTTTTTACTATTTAGAAGGATATTAGAAA2211833
2211834GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGGTTAATGGAACCCAGGTCCTACCGCCGTTTACGGAA2211908
2211909GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTATGAAAAATTCTTCTCTACAAAACAGATTTATGA2211980
2211981GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACTATATTTATGTCTCAGAACTCGTACATAATATA2212052
2212053GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTCACAATAAGAAGCAACATAAAGCCTATTATTA2212123
2212124GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTGATACTTCCGTGAATAAAGTAATCCAATAAGGAT2212196
2212197GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACTGAAATGTCTATATATTCCCCGGTATTCAGTTT2212268
2212269GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACGGTTAGATCCGATTCAATATATGGTAAATTTTG2212340
2212341GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCTGTAATGAATATTCCCCAAGAAAGCCCAACAAC2212412
2212413GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTATTATAGAGATATTAGAGAAATCGTGTATTCTCTTTCA2212488
2212489GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATTAGAACCGATTATAATAGTATTGTCTACTTC2212558
2212559GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATGTCTAGATATGTATTTTTCATCTCAGCTATTAG2212631
2212632GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCCAACCATTTGCATTTTTTTGATTTAGGGGGATAGC2212705
2212706GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCTCGAAGACTGGGGACAACTCATTACTGGATTGAA2212778
2212779GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTATTAGAAAAACTTGCAAAAGCAGGAGACCA2212847
2212848GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATACGTCATGATTGATTCATCTGATCTAAATACAGTG2212921
2212922GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATAGTTATAAATACTATAGAATCATATATTCTATAG2212995
2212996GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATTTGGAGCCCGGCTTGACCGCCTTTATACTGCCCG2213069
2213070GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAAATCAGCATACCCTTTCTTCCCCTCTTTTGCCACAG2213144
2213145GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGAGATTAATAATACCGTGGAGAACTCCACTAATACTG2213218
2213219GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGAATGTGAACTACTAAACAATGATTTCGAAAACTATTC2213293
2213294GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATAGTTTAGGTTCCTGAATTTTCTCAGTTTCCTGTA2213366
2213367GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATGTAGTATAATTTATATTATGTACTAAAATA2213436
2213437GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCAGTAATATGTATTTTTTGTATTTATATATTTT2213507
2213508GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATTGATTTCCTTTGTATCATCTTTAATTTTATACA2213579
2213580GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTACTGTATTACATAATATGCGTAACACCGTATAAG2213653
2213654GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAACATCATATTCATCTGGGCTTGCAGCGCATGAGAATC2213728
2213729GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGCATCTAAAAAACGAGAATTGAAATGGTATGA2213799
2213800GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTGTCCCGCCTCTTCAAAACGTCTTAATCGGGCG2213870
2213871GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGTATTAACTCGGTTGTTAATGAAACGCTCAGAATGTG2213944
2213945GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCACCATTTTTCCTCCTTCAAATCAAAATCAATTAT2214017
2214018GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT2214054
Left flanking sequence : Till position 2208753 (length bp)
AGGGCCAAACGGCTAGCGGCTAGAGAAATGATATACACTTTAGTGTCCGGGAATTAATACCGAGTTCGAG
ACTTTAGTGAGAAGCACCTTGGTTCTTTTA
Right flanking sequence : From position 2214054 (length bp)
AGGGCAAAATTTTCCGTTATTTGGCTAGAAAAGCCCTGAAATGAGCCCTTTTTTGGGGCTAAAATTCTTG
CTGGAAAATTATCAAACCCTTTATAAATAC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp