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CRISPRs details
NZ_CP008883_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP008883_2                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium psychrophilum GCF_000831205
RefSeq :
NZ_CP008883 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP008883_2
DR consensus (46 bp) :
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
1579000
End Position :
1580560
1579000
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GCTAAATATTTCTTTTATTTTATTTTGCTT
1579075
1579076
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TATTGAACAGCAATTTTCATCAGATGATGA
1579151
1579152
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TACGGCATTCAAACCCCCCATCTATTACT
1579226
1579227
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAGACTTATTTAAGTCTAAAGAAGTGCCT
1579302
1579303
GTTGGTAATTATAAGCTGAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAATGCGTGCGCTGTATGTATTTCGTTTT
1579377
1579378
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AATGTGTCTATTGTGAATACATTACCTACT
1579453
1579454
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACGGAATAAACGGAAACGAGCAACTTATTA
1579529
1579530
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTACAGTTGCTTTAAATAAAAAGTAAAA
1579604
1579605
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAACAATCATCTATGTTGCTAAATCTTTT
1579680
1579681
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAACACATAACAGGACACAAGGCATTGGCT
1579756
1579757
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACTTTGATATACGACATCTCGCTTACTGGA
1579832
1579833
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAAGTTTTCCTACTTAACCATTTTTTAAAA
1579908
1579909
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATAGTACTTTGATTTCACGTGCGAAAACG
1579983
1579984
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGTGGCAATGTGTATTCAAACACGGATATA
1580059
1580060
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGAGCTGGTTCGGGTACAATTACATTAAAT
1580135
1580136
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTCTCTTTCAGTTTTTCGATATTGTTTTT
1580211
1580212
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CTGTCGTACGCTCTAGTATTAGATATATCT
1580287
1580288
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAATATTTAGCATAAATTTATAATCGTCCT
1580363
1580364
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AGTGCTACCTTCGATAATTAGCGCATTAAT
1580439
1580440
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CACAAATGGGGAATTTGACGAAAACAAAA
1580514
1580515
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATAACCCGTTGGGTGTAATTAAATTA
1580560
Left flanking sequence : Till position 1579000 (length
bp)
ATATTAGACCTACCAGAATATCAACACACAAACAGAACTGTTTTTTAATTTCAAAATAAGCATATAACCA
CCAACATATCAAACGATTAACTCGCGGTAT
Right flanking sequence : From position 1580560 (length
bp)
TTTGATGACACTATCCCGCAAAGTTTTTATAGGGGTCAAAACACCATTTACTTTTATGATGTTTTACGTC
GACCTCAATTGCGATTTCCTGTGTTTGTGG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp