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CRISPRs details
NZ_CP008918_1
Flanking alignement tool
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NZ_CP008918_1                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida GCF_000754275
RefSeq :
NZ_CP008918 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP008918_1
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
18
Begin Position :
89698
End Position :
90745
89698
AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTA
89757
89758
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGAC
89817
89818
TTTCTAAGCTACCTACACGGCAGTTAAC
AGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATC
89877
89878
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCT
89937
89938
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGGGTGCGCAAATGGTTTGCGACAAAAGGCGA
89997
89998
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AACTATAATAAAAAAGGCTGTTGCCATTGCTA
90057
90058
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ATGACTTTTGGGGAGCTATCGGCATAGTGCTT
90117
90118
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACGTGATGACGTGCTCATCTGCGCTGTGGCTT
90177
90178
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCTTACGGGGATTAACGTGAGCGCGGACACTT
90237
90238
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGTTTCTTCATTTCGCTTACGCTCCCGTTGAT
90297
90298
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTTGATCCATCAAGAAGTGATCATGTGTTCAT
90357
90358
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GAATACGCGGGGACAGCTTACAACCTTGCAAC
90417
90418
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAAGGCAATATGCGACAAATTCCAGAGATTTT
90477
90478
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCTCGCGGAAATCTACCCCGATTTAGACACAT
90537
90538
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CTCGGGATAATCATCCACTGCTCACCTGAAAT
90597
90598
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TACGCCATTATGACGACTGACTTCCGCGATAA
90657
90658
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGGTTATATTCTACACACAATAAACACTTTT
90717
90718
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
90745
Left flanking sequence : Till position 89698 (length
bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACCGATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 90745 (length
bp)
TAAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCTATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTT
CTAGACATAGAAATAACCCTTTGATCTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp