Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009268_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013 GCF_000807255 RefSeq :NZ_CP009268 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009268_2
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACNumber of repetitions :38
Begin Position : 2831919 End Position : 2834380

2831919ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA2831984
2831985ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC2832050
2832051ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT2832114
2832115ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC2832180
2832181ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT2832246
2832247ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT2832312
2832313ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA2832378
2832379ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT2832443
2832444ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG2832510
2832511ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG2832576
2832577ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT2832642
2832643ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA2832707
2832708ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC2832771
2832772ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA2832837
2832838ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC2832904
2832905ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC2832971
2832972ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT2833037
2833038ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT2833103
2833104ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT2833168
2833169ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC2833232
2833233ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA2833298
2833299ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA2833364
2833365ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA2833429
2833430ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT2833495
2833496ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC2833560
2833561ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT2833626
2833627ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG2833691
2833692ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT2833756
2833757ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA2833823
2833824ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT2833889
2833890ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT2833955
2833956ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG2834020
2834021ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC2834086
2834087ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG2834153
2834154ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA2834220
2834221ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA2834285
2834286ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT2834350
2834351ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC2834380
Left flanking sequence : Till position 2831919 (length bp)
AATAACTCTGTTCTATCCATAATAAAATCCCATCCTTAATTTAAATATTAGATAATTAATATTATAACAT
ATTTATTAATCATTTATCCTTTATTTTAAC
Right flanking sequence : From position 2834380 (length bp)
TACTTAAAACTAGCCATTCTTTACTATAATTATAATGCTCTATTCATTAAAAATAAAGGATTTAGCAAAA
ATTTTACCAGCTATTTTTAGTCTTACGTAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp