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CRISPRs details
NZ_CP009268_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009268_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013 GCF_000807255
RefSeq :
NZ_CP009268 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009268_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
Number of repetitions :
38
Begin Position :
2831919
End Position :
2834380
2831919
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA
2831984
2831985
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC
2832050
2832051
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT
2832114
2832115
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC
2832180
2832181
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT
2832246
2832247
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT
2832312
2832313
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA
2832378
2832379
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT
2832443
2832444
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG
2832510
2832511
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG
2832576
2832577
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT
2832642
2832643
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA
2832707
2832708
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC
2832771
2832772
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA
2832837
2832838
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC
2832904
2832905
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC
2832971
2832972
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT
2833037
2833038
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT
2833103
2833104
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT
2833168
2833169
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC
2833232
2833233
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA
2833298
2833299
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA
2833364
2833365
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA
2833429
2833430
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT
2833495
2833496
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC
2833560
2833561
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT
2833626
2833627
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG
2833691
2833692
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT
2833756
2833757
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA
2833823
2833824
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT
2833889
2833890
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
ACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT
2833955
2833956
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG
2834020
2834021
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC
2834086
2834087
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG
2834153
2834154
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
CTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA
2834220
2834221
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
GGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA
2834285
2834286
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
TAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT
2834350
2834351
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
2834380
Left flanking sequence : Till position 2831919 (length
bp)
AATAACTCTGTTCTATCCATAATAAAATCCCATCCTTAATTTAAATATTAGATAATTAATATTATAACAT
ATTTATTAATCATTTATCCTTTATTTTAAC
Right flanking sequence : From position 2834380 (length
bp)
TACTTAAAACTAGCCATTCTTTACTATAATTATAATGCTCTATTCATTAAAAATAAAGGATTTAGCAAAA
ATTTTACCAGCTATTTTTAGTCTTACGTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp