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CRISPRs details
NZ_CP009439_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009439_4                                                                                                                 
top
Strain :
Streptomyces glaucescens GCF_000761215
RefSeq :
NZ_CP009439 (plasmid pSglau1 line)
CRISPR id :
NZ_CP009439_4
DR consensus (29 bp) :
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
Number of repetitions :
34
Begin Position :
40839
End Position :
42864
40839
GCTCTCCCTGCGCCCGTGGGGATAGTCCC
CCGCTCGCCATCTGCTACGGCTCCTGGAACT
40898
40899
GCGCGTCCCGCGCCCACGGGGATGGTCCC
GTGATCGCGTAGGGACTAAGGCGAAGACGAA
40958
40959
TTGCCTGTTGCACCCGCGGGGATGGTCCC
ACGTGCAGGTACGCCTGGAGACGGAACGCCGT
41019
41020
CTGCTCCCCGTACCCGCGGGGATGCTCCC
TGATCGCGGATCTCCTGGTTGAGCAGGGCGGC
41080
41081
CTGTTCCCCGCACCCGCCGGGATGCTCCC
CCGCCCGCCCGCATGGCTGGTGCAAGCA
41137
41138
CTGCTCCCCGCACCCGCGAGGATGGTCCC
CCGCTCCAGGATGGCCTCGCT
41187
41188
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CCTCAGAGCCTGACGGTGACCCGCTCGATCAA
41248
41249
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TACGACAACCACGGCACCGTCTGGGGCACCGA
41309
41310
CTGCCTCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TTCGGCTACCTCGTCGACCGCCGGGACGCCGT
41370
41371
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
GCGACGAAGGCGGCGCCGCAGCCGCATGTGTC
41431
41432
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CCCGTGAACAACGCGAAGGCCGCCGCGGTGAT
41492
41493
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CAGCCGTAGAGGGTGCTCGCGCTCACCTGGGC
41553
41554
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
ACCACGGCCACCCTGGAAGGACCGGGCGCGCT
41614
41615
CTGGTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TCCCGCCCGGCGTGACGGCCGATCAGCTGCTT
41675
41676
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TGGTTCAGGATGCGCAGCTGGTGGCCCGACAG
41736
41737
CTGCTCCCCGGACCCGCGGTGATGGTCCC
CCCCCACCCCCCGCACAAGGCACCCATCACGAC
41798
41799
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CCCTCATGGCACCTCGGGAGCCGGACGGG
41856
41857
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
ATGGTCGGCGCGGCCACGATCAGCAGCCGCAG
41917
41918
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TACCTGCCCTTCCAGGTCTACAGTTTCTTCGC
41978
41979
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TGGGCCTGGACCTCGTTCAGTTTGACCAGTTC
42039
42040
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
AGCGCGGGCATCTCCACCCCCTCCAACGCCCT
42100
42101
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CCGGCCCCGCGCTGCTCGCCAAGCTGGAAGCC
42161
42162
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CCCCGCCGCAACGTGGTGCGCGACACGATCGA
42222
42223
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
TCGTGGGCACCGAAGCCCCAGATCGCGGCGAT
42283
42284
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
GAGACGGCGTCCGCGATCGCGACCGCCGCAAC
42344
42345
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATAGTCCC
GCTGGCACGGGCGAGGTCCGGGCGCGGGTCGG
42405
42406
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGAATGGTCCC
CTTCCCGTCGGTCTCCCAGGCGGGCTCGGCTG
42466
42467
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
GCCTTGGGCGCCCCGTTCATGGGCCGCCCGAC
42527
42528
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
GACGCGGCGCCTGTGTCGGTCCCGGCTCCGGC
42588
42589
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
ATCGGTGACCCGAAGCAGTCCTCGATGTACGT
42649
42650
CTGCTCCCCGCACCCGCGGAGATGGTCCC
TGGCGCGGGCCCCTTCGCCATGCTGGGTTC
42708
42709
CTCTGCCCCGCACCCGCAGGGATGGTCCC
TCCAGCCCGAGGGCTTCCGCACATGGACCGTG
42769
42770
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
CAGGCGCGCCGCGCCTGTACCGGGAGACGCACGGCAC
42835
42836
CTGCTCCCCGCACCCGCGGGGATGGTCCC
42864
Left flanking sequence : Till position 40839 (length
bp)
CGAAGACATCGACCGATTCCTTGCGCAGGCAGGGACCACCACAAACCCACCTTCCTACCGCGTGAGCAAG
TGTCCCGGTCGCCATGCCGCTCCGCCGGGG
Right flanking sequence : From position 42864 (length
bp)
GGCACCTTCACCTCGGCGTGGGTCGGCGCGATCTGCTCCCCGCAGGTTGACCACAGCCGGGCCAGCGCCA
GCACGGCCCGACCTCGGCGCGAATCTTAGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp