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CRISPRs details
NZ_CP009513_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP009513_3                                                                                                                 
top
Strain :
Methanosarcina mazei LYC GCF_000970225
RefSeq :
NZ_CP009513 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009513_3
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
Number of repetitions :
37
Begin Position :
799772
End Position :
802424
799772
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TCAGTCTTATCTCAACAACCTCCCCCTTACACCCCT
799844
799845
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
AGTTTTTCCTTACATTGATCTAATGCCGGAACTCAA
799917
799918
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
ATGCGTATTCTATTGTATATGGTTACTTATCCAGT
799989
799990
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
GACATCCTTTGCTTTTTCTTTGTTCAGATACTCAA
800061
800062
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TTCCTTATTCTAATTTCTAATTCTACAATAAGGA
800132
800133
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CGGATGTTATACCACCGTTGCGGGTTGAGATGTT
800203
800204
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CCATTAATTTTAATCGTGTTACTTGAAGTTCCTG
800274
800275
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CTGAATTAGCTAAGTATGGTGTCACCCATATGTGA
800346
800347
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CATTATCCAAAATTCTAGTAATGGGTTAAGTAGAG
800418
800419
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TTATCCAATTGACCGTTTTTATACATTTTCATCAGAC
800492
800493
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TAAGAAAGTAGCTATCAATTACGCTAACAGAGTATT
800565
800566
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
GTTACTTAATTTTTTTTTAAAGAAGTTGAGTAATAAT
800639
800640
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CAGATTCACTTGTCTCTAGATAATGGATCATATTCAT
800713
800714
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
AAGATATTGATAGAACTGTCTTCCGAACTGAACTGAA
800787
800788
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
ATTTTATAATCTCACTGATAGAATAGTTGAAGAAAC
800860
800861
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CCGCCAGAATACGATATGATGTACTTGTCGTATTTGG
800934
800935
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TATGGTAATCGGACCCGACGAGAACAGACATCAGGG
801007
801008
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
GCCTTATTGATTCTGCACATACTGACGTATTCGA
801078
801079
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TTAGAAATATAGAAGCAAGCGACCACGTTTATATTA
801151
801152
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
ATGATATTTTCGGAAATGTTGGGTTTCAGGAGAAGAT
801225
801226
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
ATTATTGTATTTGTAGTCTTTCTGTCATGTCTGT
801296
801297
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TGTCATGTTATGCTTTTTAGAGAGTTCCTGAGCG
801367
801368
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CTCAAAATTCTGTAACTTTTGTTCGAGATAGAGACA
801440
801441
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TTACAAACACTATGCGTATTTATGAACACAATTA
801511
801512
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
AGGTGTAGCAAAAGCTATTGCTAATTATTCAGCTTC
801584
801585
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
ACAATCAGGTAGAGATGGGAAGAAAACTGTTTTTGA
801657
801658
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TTCGCGAATATGCGACCTGATAACGTTGGACCTA
801728
801729
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TTGACGACAAGATGGAAGAAATCGAGGAGATGAA
801799
801800
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
AGGAGCAGAACCTCGCACAGTAGTTAATATATTTTT
801872
801873
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CGGTTTTAAAGTATATAGGAGGCTTAAATATATGTC
801945
801946
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TGCCTGCTTTGCTTCCTGAATTGTTGGCTTAGACT
802017
802018
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
GCAGGGAACGCCTTAGCGCTCTTCAGAACAGCATTTC
802091
802092
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
CCCTCCAAAACCGATTGCGGTTTGGATAGATGCGTATT
802166
802167
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
GATATAAAAATCGCAGCTATGAAAGCTGGAAGTAGTG
802240
802241
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
TCAAAGACATTACCATGGAATATTTCAAGGAACTGTA
802314
802315
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
GTCAAACTTCTTTAGAATTTTTTCTAATGAAAAAAG
802387
802388
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATCTTGCTCGCGAAT
802424
Left flanking sequence : Till position 799772 (length
bp)
AAATCATTGATTTTTGAAAAATACCGCGGAATTTGGGATATACATTAAAGTTTGCTAATGTTGATTCTAT
TCAGGCCTGAAAGGCATCACCGGAAAACTG
Right flanking sequence : From position 802424 (length
bp)
AGGGCAAAAATTTCCGTTATTTGGCCAGAAAAGGCCTGAGATGAGCCCAATTCTGGGACTAAAATTCTTG
TTGGGATATTATCAAACCCTTTATAAATAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp