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CRISPRs details
NZ_CP009517_7
Flanking alignement tool
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NZ_CP009517_7                                                                                                                 
top
Strain :
Methanosarcina barkeri 3 GCF_000970305
RefSeq :
NZ_CP009517 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009517_7
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
Number of repetitions :
71
Begin Position :
200327
End Position :
205460
200327
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AATTACATCCTTTTCGTGTACTCCCATATATGTAAT
200399
200400
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCCTGCTCACGAAT
TCTAGATTAAGTCCTGAACAATTTGCAAATGAGAA
200471
200472
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATGATGGAGGACTTTGTAACATCTCTGTTCCCAGATAT
200546
200547
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AATTATGTCGTATTTTACATTTAGGAGGATTGAA
200617
200618
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATATGATATAATAGATTTGGTTGGAAAAATGGAAATGTA
200693
200694
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AGACATACGCGCAGCCAAGCAATGTTACTCAATGGA
200766
200767
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ACTGTCCCCTGCCCCGTTTCATATGATCCAGTCGG
200838
200839
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
CAATGGTGGTCTATTGTGAGTGGTCTTACTTACAT
200910
200911
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AGTGTAATATGAAGAATATTGAAGAAGCCGTCTTTTCAATCAGGT
200992
200993
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TGAGCAGCGCAGAAGCACGTAAACTAGACATTTTGT
201065
201066
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGAATCTTGCTAACGAAT
ATTGTGGTGGGAATCGGAAGAAGAATATGAGGAACG
201138
201139
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTAACGAAT
TGTGGAGAAGCATAGAGTTAGGAAAGTATCACCTAA
201211
201212
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTAACGAAT
CTTTTGGGCAACTGAAGGAAACCTGAACCTGACACA
201284
201285
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTAACGAAT
GATCTGCCTGGGTGGGTGGAATGCTGAGGTATATGA
201357
201358
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAGGCAGGACCGGAAAGATTAGAAGCCGCATTAAAAC
201431
201432
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATCACCACTAGATGCAGCAGCAGCAACACAGGCACT
201504
201505
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TCAAAAAGAGCATCTGCATATGGAATTCCATCCGA
201576
201577
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TTTGTTGACGGCGTTGGGGTTTTTGGGCAATTGGG
201648
201649
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ACTACTATGGAACTCAAAGAACTCAATGAAAAATA
201720
201721
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TTTTTATAGTACGTTTGTTTAAACCATCGTTT
201789
201790
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATCGTGGATCAGGGGGAAACAGCGCAGGAGAGAAAT
201862
201863
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TCGAACAGGAAGCAGTACAAAAGCCTCTGGAGGTCT
201935
201936
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AGGGACAATCTGCAACAGGCCAAAGCTCAAAGTTGA
202008
202009
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TCCCATGTTTTTGAATTGTGCTTATAGAAGGAATGAA
202082
202083
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TTTCAGTTTGGGGAGCATGGATAATAATATCCTGG
202154
202155
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TCGAAGTCAATGAAGTCATATCGCTCTCATCAACTCCA
202229
202230
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAAAGGAGAAGGCTGGAAGCGTACCGATGGATCAAT
202302
202303
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AATAATCCAATTTGTTAACGTCAACCGTGGGAT
202372
202373
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
GGTTGCGGTACACGCGAGCCTATATGGAGTGTGAA
202444
202445
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TGTGATTTTTTGAGCAGTGGAGCCGAAACGTAATT
202516
202517
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TTGTAATGGTCGAGTGCTACCATCTGAGTTCCAGT
202588
202589
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAGTCAGGATGGTAGATTTTGACGAGTTGTTTAA
202659
202660
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TAAGTTTGCTCAGGAAGTTCAGGGGGTGGTCTGATGT
202733
202734
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TAGAAAAATTAACTCCGGTATGGAACACGCTTAAAAT
202807
202808
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TCCCAAGGTGTTTTCCTTCTTCTCTAGCTCTTTG
202878
202879
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TGGTTTCCAGGTACTCTATGAAAAACAAGTTGAAG
202950
202951
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATATAAAGTTTGTCCGTAGTATGTGGATAAAAAAA
203022
203023
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TTTGAGTCTATGTCTTTTCAAGCTTTACAGATAGT
203094
203095
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
GAGAAAAGACTTCCAAAAAAGGAGAGGATTCTGA
203165
203166
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
GAGTGCATCATCGGATAGCGGAAACGGACTTACAA
203237
203238
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AGTTAAGTAACGGTGGTTTGATTCCACCTAATCTTTTT
203312
203313
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
CGTATGTTTCTGTTTCAGAACTGTAATTTTCGTCAA
203385
203386
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TATGTGTGGAAGAGTGTGGATACATGGAACTATACCA
203459
203460
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TGGTTTTCCATAGCAATCTTTCACTATTTTTTCAAC
203532
203533
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAGTTTAGTAATTCGCATTCCAGCTTTAATTTTAA
203604
203605
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
CTACATGTATATAGATCCTAAAAAACACTGTAATAAT
203678
203679
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAGAAGCTTACCCCGATGAACCAAGCGATGAAGACA
203751
203752
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AATTTAAAATCCACTTCCAAGTGATCGACGGTTCCGTAG
203827
203828
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
CAAGCTCTGGAACCTTCTGAGCTTGTTCAATCGCA
203899
203900
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TATTAAAAACCAGAGATAAAAGAACATCTATAGT
203970
203971
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TGCAAAGGATCGAATGATAGATTATTCTTGTTCA
204041
204042
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
CTAGCCGGTTTTCAGGAAACTCTAAAAAACCATACT
204114
204115
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAAAAAATGAATGAATCATACAAACAAACAGGAATTA
204188
204189
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
GGTTGGATTAACCTCCACAAGCTTCCTAAAGCAACTA
204262
204263
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATCATTCGAGGAGATCAAACAAGAACTAGGTGAAAG
204335
204336
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TAATTCCGCAAAAGTTATTACTTGATATCAGGAAAT
204408
204409
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
GAGAGTATGTCAAGGGTATAAGCTGTCCTGAAGAAAA
204482
204483
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AGAGAATGTAGAAGAAACCATAGAGGAAGTCCAGCC
204555
204556
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAATATTGCGCCCATGTTAGCTCCATTTTCATTG
204626
204627
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATATTTTGGTTTGTGTTTCATACTCCTCCTTTTTCTT
204700
204701
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AACTCCCTGGTTCTTTCCAACGACTATACATTCCACAA
204775
204776
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAGGCTTCTTTCGAACTGCAGGTAATGATAACGTTG
204848
204849
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATGTAATTGCTGTGACCTTGTTGTGAATATCATT
204919
204920
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AAATACGAAATGCGGTAATTCACGCAATATATTCAA
204992
204993
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
TTCAAAAAGAGCATCCGAGTATGGAATACCAGGTGA
205065
205066
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
AACCTACTACACTCTAATATTATTTATTATTTTT
205136
205137
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATATATTATACTAAGTCCTTTTCGTTCCCCTATCAT
205209
205210
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ATTTACAGGTCAATCACTTATTAATATATTAAAT
205280
205281
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ACGACACGAAGCTTTCATACACGTTTCCTTAAATG
205352
205353
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
ACGTCAGCAGGTGCAAACTTTGGATGCATGATAA
205423
205424
GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT
205460
Left flanking sequence : Till position 200327 (length
bp)
AGAGAATCAAAACCAGTTCCTTTTGTATTTCGGTTTAAATTTTTCCAGGCTGTGTAAAGAACTTCTTCTT
TCAAAAAACGATATGTTAAGGGGAAATGGA
Right flanking sequence : From position 205460 (length
bp)
AGGGCAAAAATTTCCGTTATTTGGCCAGAAAAGGTCTGAAATGAGCCCTTTTTTGGAGCTAAAATTCTTG
CTGGAAAATTATCAAACCCTTTATAAATAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp