Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009526_5                                                                                                                 top


Strain : Methanosarcina barkeri Wiesmoor GCF_000969985 RefSeq :NZ_CP009526 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009526_5
DR consensus (30 bp) : GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACNumber of repetitions :51
Begin Position : 831230 End Position : 834572

831230GTTTCAATCCCTATAAGACCTGATTTTAACGCTTCATTATCCAGCCGCCGTATTCCTAAAATTTCTCTT831298
831299GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCGGAAACTTGTTTTAATCAGAAATGGGATGGTGAACAT831366
831367GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCAGTTTTAAATGCCCCGCCTTTTGGTTTTCATAGTTTTT831435
831436GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGCAAGGATATATGACGAAAATTTGTAGAGATTATAT831501
831502GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTGTGAGGATATCATGCCAGCAGCGCCATTTGAAGATT831568
831569GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACACTAAGAAAATGAAAGAGATTTTCTTTGGTGAAAC831633
831634GTTTCAGTCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGAAAAAATGAATATCCCTTCTGGATCAAACAGAGAAGC831701
831702GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTTAAGCAGGTTGCCCCATACCCTACAGACTGAGATT831767
831768GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGTCTTCTTCGATTATCCATGGACTTAATCTTACCC831832
831833GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGCTAAAAAGCGGAAACATGATAATGATGCTCATAA831897
831898GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTTTTTTGCATTTCCAAATGGAAACCTTGGAAATTGC831963
831964GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACATTTCCATACAGATTTTCTGAATACCGCCATTTGAT832029
832030GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCCCAACTGCTGAAGCAAATACTTTAGCCGTAGTCGT832095
832096GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGTTTCTACAAGATATCATGTCCTTGAAAGTTACGTG832161
832162GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCAGAGCGGAATGAGTAACAGTACTTTGTATTATGC832226
832227GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTTGATATCTATTCGTTGAAGCGATGGAGAACTTGAGG832293
832294GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTGTTTCACACCAAGGGAGTGTTTTCCATCCGAATAT832359
832360GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTGCAATTTCCGTAAAAGATATTCTCGATATTGCAAT832425
832426GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAGTGCTGCTACTGTGTCTATAAATGGTTTATAACTAA832492
832493GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAACTTATAGATTTTAAAGGGCTTCAAAAAGAATATCT832559
832560GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTATCTAACTATTATTGAGCTGTCAGAAACATACAC832624
832625GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGTATAGCTTAGACAGACAATCGTTTTTGTTTTTAT832689
832690GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTATATAAAATTTCAAGTTGGGGTTAAAGAAGAGCAC832755
832756GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCATATTTGACATTTTAGATATTAAATTCACAGATTC832821
832822GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAACACAGGAACCAGTAGAACAGGATCACCTAAATT832886
832887GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTTATAATTCATGAGTTTCTTATTTACTTTCTTTATATG832954
832955GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCTGCATTGCTCGTCCCTCCGATATCCCATGAATCAA833020
833021GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCGACTTAAGACCAAACACTCCACTAAAATCATCATT833086
833087GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAAAGTTTAGTTTTATTGCCAATCATCCTAATCCTC833151
833152GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACACTGCTATGGGTGTGACTGCTGGGAGCCAATTAAAC833217
833218GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACATCCTAATCCTCCAGCATTCCTTGAATACTTAGTTAG833284
833285GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTCGTAAAAGATGCTTATATAAAAAGTGGATTTGAT833349
833350GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAGAGTAAAAACCCCTTGAAATCCTTCGGTAGCTGA833414
833415GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCAATTTTTTAAATCCGTACAATTGTTAGAATTATA833479
833480GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACATTTTTCAATTGCTCCGCCGGTCACCGGTTGAACTC833545
833546GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACACGTGTTGTACTCGGGAACTAAGAAGATTATTCCTAAA833613
833614GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTTTCCCACCCGTATTGTTTCACATCCGTCACATTC833678
833679GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACATTTATACTTATAATTCTAGGAATTATTATATATTGAT833746
833747GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCTCTTATCCATACTGCTTCGTGTCTATGTCCAGGATA833813
833814GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACATATTTTTAAGGTTCATATGTGTTGCTCCAAAAAAG833879
833880GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGATACTAACAGGTGTCTGTGCATCGAGTTTTGACAG833945
833946GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCAGACCCGCAGGCAACCCCGACTAGCTGCTTCCAAT834011
834012GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAAGGGGCTTCTTGATGAAAGATTAAGACTCCTAGATT834078
834079GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAGTATTTTGGGAGTTCGGGATATCCAGACTCAGAATA834145
834146GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTATCGTTTGCATTAAGAATATCAGTTATAGACACA834210
834211GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACCTTTTGCGTGGATTCCGTCTGTTTCTCTCCATGCGG834276
834277GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACACTAAATCAGGTCCGCCTGTATGATCATATCTTGCATT834344
834345GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACGTTCGAGATCAAATGATAGATTATATTTTACTATTAC834411
834412GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACAAGGACAATACTTGCTGGATATATTTTTGATTCAAC834477
834478GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAACTTTCTTTTGCTAGCCAGTCCTGAATTTCAAGTTCA834542
834543GTTTCAATCCCTCTAAGGCCTGATTTTAAC834572
Left flanking sequence : Till position 831230 (length bp)
ACAAAAGGAAAAATCTTATAAAAATATAGAAAGTCTTTAATAAGTAACTTCCCTTTTTCATCAAATAGAA
AGAGTTAAATATTTCTTAAAAAGAGTCGTT
Right flanking sequence : From position 834572 (length bp)
CAAGGAAATTTTCCCCGAATTTCAGATAAATTGGATGCTAAATCCTATCTCTAAAAAGAGTAAAATTCGG
GCTTATATTGCTGTTTTTATGTGAGAATAG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp