Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009528_28                                                                                                                 top


Strain : Methanosarcina barkeri MS GCF_000970025 RefSeq :NZ_CP009528 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009528_28
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATNumber of repetitions :121
Begin Position : 3468845 End Position : 3477647

3468845GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTGTCGCCCGATTACTTTTTTGTGTTATTTGGTAATTTTGGT3468924
3468925GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATCTGATATTCATTATAAAACAGACTCCTCTAATTTT3468998
3468999GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTCAGAGGGTACAGCTTTCGGTTTGACTCCTTCAGG3469071
3469072GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAGTATCTGCCTCAAACGGACAGAAAAAATTAGTATT3469144
3469145GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATAATAGACTCGTGCCCATACGTTCTTTATTATAA3469216
3469217GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCATAATCTAGAATTTTGCGTTGAATATAAAGATCTAT3469291
3469292GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGCCTTGCCATAGGGCAGCCGTGACAGTGTCAG3469362
3469363GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGCCTAGACGTAGAATCGACATCCCTTTAGAGAATAT3469435
3469436GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTAGGGCCGGTGTTGGGAAAGTCTGCATCCTGGTCTC3469508
3469509GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATCAGTTTCGTTTTTTTGTTTTATTCATTACTTAG3469580
3469581GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATATGTGATAATGCAATTGATTGATATTGATTT3469651
3469652GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAAAAGGTCGCTCGGGCTTACGATACGCATTATTT3469723
3469724GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATTGAACAGTAGTTACATTTGCAGTCATGTAT3469793
3469794GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGGAGATGAAAAAAGGCGCATTCTGGAACTTTGGT3469866
3469867GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGTTAAACAATATCATTGATGTACTCACCGATG3469937
3469938GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTTATAAAATTCTATCAAATTTTTAAGGGGAGGGTG3470012
3470013GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGCAATCCCAGGAAATCCAAATGTATATCTAATCTT3470084
3470085GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTGCAAAAGAGCACTTCGTGAAACAATTAACACT3470157
3470158GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACCTTTTTATAGATATATCCACGCTCCGCTACCA3470228
3470229GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACAGCGGCCTTGTTGGGGCACTCCTGAAGACATTCAGAAAT3470306
3470307GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCATAAGATGATCTAATTCAGATTCGAGAGACATTAT3470379
3470380GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTAATTTTTGGAGCTGAATTACATGGCTGAACCGTT3470454
3470455GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCATAAGATGATCTAATTCAGATTCGAGAGACATTAT3470527
3470528GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTAATTTTTGGAGCTGAATTACATGGCTGAACCGTT3470602
3470603GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGGTCCACCTGCGCTCCAATGTGATGTATCAAATGCA3470677
3470678GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCTTTATAGAAGAGATCTCAAAATCCGCTGTAATCAT3470751
3470752GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTAATGTATCATGCGTAATATATAATACACAATAAAA3470824
3470825GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAACAAAAATATACTCTGAAGAAGAATATATTTTATT3470897
3470898GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATTTCCATGTAGGAAGGCAGGGAACACTATGAAATA3470971
3470972GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAGGCAGCGTTTAACAGGCCCTAAACAGGTACAGCTATT3471046
3471047GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTTTTCAGTAATCTTTGCATTAATATCACAAAGTTTGT3471122
3471123GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTGATAGGTACACGCCTAATTTCACAGTACCTATAAT3471197
3471198GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCGTCACCGACGACACCTGGACAATACAAACCATCAT3471270
3471271GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAACAAAAGGGACATGGATGTTATGAGGGTATTCTGAA3471345
3471346GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATGATGAAAATGGAGAAAAAACATGAAACTGTCAA3471417
3471418GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAGATTCTTGGATCTGTGGAGCTTGTGCAGTCATT3471489
3471490GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTCAAGAACAGAAGCTATAGACATATACGACCACA3471561
3471562GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACGGAGAAGTTGAAATTATTGAAAAGGAAATGGTG3471633
3471634GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCTTCTAAAAGCCATGAGAGAAGGCAAGAAAACTCAAA3471708
3471709GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCTCCCAATTCTCAGCCAGTACGTCCCATCCAGACAG3471782
3471783GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACGATGAAACTTGAGAGACCTCAACTTATTATACGAA3471856
3471857GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTATTGTTTTTATTTATTTGTTGTAATATTGTAG3471927
3471928GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTAAGTATCACGGAAAGAGAATTTACACGGAGATAACACAA3472006
3472007GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTTACCAGTACTTTTGAGCAGTCCGGTTTTATA3472077
3472078GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGATATCAAAGGGAAGCGTACCGGTCACGACACTA3472149
3472150GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAACAGAATCAGAGCACCGGCAAAGTTCCTGTGAC3472221
3472222GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTGTTAATCCAAAAAATCATACAGGTATTCCCTGG3472294
3472295GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGCCAGGTTTTACCGTGCCTGCAATTTCTTCAAGACACA3472369
3472370GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTACCCAATAGCACCAAAGAAGACTCGGAGGTAATAT3472442
3472443GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCGTTTATTATTTTGGTATTTGTTTCAATATTGGTTAT3472516
3472517GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAACAGATTGGTGGACTTGCAGATCTATTCAAAGA3472588
3472589GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTCGTTTATCAATTGAAAACAACCGGGCGTGTTTAA3472661
3472662GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTCTGGCAATGCTCGTTACTGCATACCCAAGGCTCTA3472736
3472737GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAACTGCAGGAGGAAAATGATAGTAAAACCTGCGACGG3472810
3472811GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTGATACTGGAACGCAAGCCGTTGGTGTGATGAA3472881
3472882GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATTTCACGAAATTTGGTGATTACCTCCCGGCTATGT3472954
3472955GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACTATCGAGAGACTTAATAACCATCGAAAATGGGGAA3473028
3473029GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGAGGATTGTGAGTTAAAATTTGTTTGGAGAATA3473100
3473101GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCATCCCCCAACTTAGCCCATCAAAACCAAGATCTCT3473173
3473174GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTTAAAGTCGAAGTGAAAAATATAGATGTGTTAA3473246
3473247GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTTTTTCCATATGCTTTACTGGTTGCCACACTGTT3473319
3473320GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAGTTAGACTTAAACAATTTTATACGGGTCTTTTTTA3473392
3473393GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAAACCGTTTTTTTTTGCGGCAACCCAGATAAGTATT3473466
3473467GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCATCGAATCTCTGGTAACTGTTACACCGTCCATTTC3473540
3473541GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTCTGCCCTATCTAGAGTCGCGAGACAATTGGGTGTTA3473615
3473616GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATAGTTTCGACAACATCTTCAAAATGCTTCAATTTTT3473689
3473690GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCGGCACAATTCGAAAATGGATTGTATTCAGGAACAA3473762
3473763GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGATCTTTATTCCTTTGCTATATAGAAACCCAGTGA3473834
3473835GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGCTATGCAGGAAGTTTCAAATAGGTTGTTCATGGA3473907
3473908GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTCAGGCGGCCCCAGTGTTCAGGGATGGGGTATATA3473981
3473982GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAACAGGCACGCTCGCAAATACCGATTTTAGTCAAGCGG3474056
3474057GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTGAAATTAATCAAATCGAAGAACATCGTAAGATGT3474130
3474131GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTTGATTGTGTGTTTGAAGGGGGAGAAAATGAAGCCG3474205
3474206GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAGAGACAACGGAGGTGTAACGTGGATAAATTCAAA3474277
3474278GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATTATCAAGTATAGAGGCAGACACATCAACTTCTAA3474350
3474351GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGGCCAACTGGAAACAGTGTTTAGGCTGAGAAT3474421
3474422GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAACTTGGTTTGATGATTGATAAATCATGATGATAA3474493
3474494GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGATAAAATTATTGCAGAAATTAACAAGAGGTGTGCA3474567
3474568GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGAGCCAATGTGTGGGGTTTCTTTGTCGAATTTCAGCT3474641
3474642GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCATCACAAAAACGATGAATGCAGAATACAACAC3474712
3474713GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAAAGTCAGGGTCCACAGCACAGGCCGCCCCTAGAG3474785
3474786GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATCAATTACACCACCAACTATATTTTTAATTGAA3474857
3474858GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTAGCGAATCTTCAGACTATGATACGTAATCAGAA3474930
3474931GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTTGTATATTTTACTTTAATATTTTTGTGGAGAAA3475003
3475004GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTCAATTCAGAACGCATTTCATCAATCAGAGATAT3475076
3475077GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAATATGCTGGATATCTCTCGAATACGATGGTCCA3475148
3475149GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTGATCTAATGATCAGTTTGTTACAACAAACCGT3475220
3475221GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCCGAAAATACAATATTATTGTATCGAGTAGGTGATT3475293
3475294GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATAATCACTTATATTAGTCAATCCATTTATTGT3475363
3475364GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACCTGGAATAATCAATGGAGTATACGTGATGG3475432
3475433GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGTTTGGATTATACCAGGAAATTCATTATTAGTTAT3475504
3475505GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTACCAACTGCTAAATCAAGAACATCTTTAACAGA3475576
3475577GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGGATTTTTATTAAAATCAAAAAACGAAGATAATGAT3475650
3475651GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTTACTTTAAATCCTTTCAGTGGTGGATATGCTTGAT3475725
3475726GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGGTCGACAACAAAGCTTTGAATGAAGAAAAACTCAT3475798
3475799GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAATAATGCATCTATCTTCTAAGATATCAATCCT3475869
3475870GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTTGTATTAGGTTATACCGAATCATGGATTGCAGATCCATCTA3475949
3475950GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCAGACTCTGCTGGAACAATTTCAGTTGAATTATCA3476021
3476022GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATTTTTTAGATCGTTATGCTGAGTGGATTGAACATAT3476095
3476096GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTGTACACGGAGTTGAATATGCATGTACAGATATTGA3476168
3476169GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATGAAAAGTTTAGGACTTAATGAAGAAGAATA3476237
3476238GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATATATAGCAGGACAGGATTATCCTGGTGAAAT3476307
3476308GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATATCCTAGAGTAGTTGTGTGGGGTTTAACAAGTGGTA3476380
3476381GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTTGTACAAACAAGATTGACGAATATTGTAAAGTT3476452
3476453GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAAAAAGGTATTGGTCGCTTAAATGTCGATAGAA3476523
3476524GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCTAACCCTCTTTTTTTTGGGTCCATGACTAGAT3476594
3476595GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGCAGACCCTAAAGGCGGTTCACTCTGGGAAATAAA3476666
3476667GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTATCATATACAATATCATCCGAAGACGACGGAGAAA3476739
3476740GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAAGCGTCAACCCTAGCTGGAAAATCGACCTGAATTA3476812
3476813GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATAACTCTTTCTGCTCATCTCACCAGTCATACAA3476884
3476885GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTGGTGGCAAAGTATTGATGATGGGTGGAACATTTT3476957
3476958GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTCTTTTTATTCTACCCGTTCTAAGCTTCAATAT3477027
3477028GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATGTAACACATACTCCGGAGTTAGAGACCCCTTTATAA3477100
3477101GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTTATACGCCATGCGGACTTAAAAACGACAATAT3477170
3477171GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCGCGGAACAGTTAGGCGTATCTATGGCCGATGTCGG3477243
3477244GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATACAGTAAATGACATTCCAAGAAAACCTATGTAAAACCA3477318
3477319GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAGCAGGAACGGAGGCTTAATATGCCTCCAATAGATTT3477392
3477393GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATAATAAATCATACAGGCAGTAATGCCTACGAATCAGG3477465
3477466GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATTAAGTGGTCTTTACCAGAGTCTATAAGAGCCTTTAT3477538
3477539GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAATCTCATTTAGTAGAGCGATTTCAAGTGGGAAATTTG3477610
3477611GTTTCAATCCTTGTTTTAGTGGATCTTGCTCACGAAT3477647
Left flanking sequence : Till position 3468845 (length bp)
AGGGCCAAACGGCTAGCGGCTAGAGAAATGATATACACTTTAGTGTCCGGGAATTAATACCGAGTTCGAG
ACTTTAGTGAGAAGCACCTTGGTTCTTTTA
Right flanking sequence : From position 3477647 (length bp)
AGGGCAAAATTTTCCGTTATTTGGCTAGAAAAGCCCTGAAATGAGCCCTTTTTTGGGGCTAAAATTCTTG
CTGGAAAATTATCAAACCCTTTATAAATAC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp