Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP010888_8                                                                                                                 top


Strain : Clostridioides difficile GCF_001577795 RefSeq :NZ_CP010888 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP010888_8
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :10
Begin Position : 2036281 End Position : 2036905

2036281GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTTTTAATTATGTTTATATTAATAAATCCAAAATAT2036345
2036346GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCAAATCGTTAGACTGGAAGTATAAGTTGTAGTGACC2036411
2036412GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCCTATATTACTTAAATTATTACTTAAATACTGATA2036475
2036476GTTTTATATTAAGTAAGTGGTATGTAAATTATAAAACTTCTTGCATCTCTGCATTAAAAAAAGACT2036541
2036542GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATAAGGAAGAAGAATAAAAAGGGGATGTTTTTATGGAA2036608
2036609GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTATTATTATAATGGTCATGTATATCAAGTTTAGTAGC2036675
2036676GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTATTTCTTCCTTTTGCACATATACATCATCTAAATTG2036741
2036742GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATGACTAAAATCATAGAAAAAGCACTAGAACCAGCTAAGG2036810
2036811GGTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA2036876
2036877ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA2036905
Left flanking sequence : Till position 2036281 (length bp)
GGTATATGATAAGCTTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTAAGAGAGTTGCATATGTGT
AAGTATTGAAAATGCCCAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 2036905 (length bp)
AAACATGTATTTATACTTAAATTCTGTACCTATATAAAAAAGTGAACTCTGTCAACAAAGCACTTTTTTA
TATAGATAAATTATCATTTTGTTTTAAGAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp