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CRISPRs details
NZ_CP010905_17
Flanking alignement tool
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NZ_CP010905_17                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile 630 GCF_000932055
RefSeq :
NZ_CP010905 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP010905_17
DR consensus (29 bp) :
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
Number of repetitions :
20
Begin Position :
3440035
End Position :
3441310
3440035
ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT
GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA
3440098
3440099
TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT
AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT
3440163
3440164
ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAAC
CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT
3440229
3440230
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CGGTCGTAACGTGTCAATCCTATTGGGTTTTAGATA
3440294
3440295
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAGAAAGAGCTATTGAAGCATTAAACAGAATACAGG
3440359
3440360
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CGTCTACTGTTGCATCATTTAGTGACCTAGCACTTTG
3440425
3440426
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ATTTATATAAGTATGCAGGTGAGGGGATTTTTTGATA
3440491
3440492
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTAAAAAATTACTACCTTTAAGTTGACCTTTTAAA
3440557
3440558
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATATTAGATAGAATAGGGATAAATGAAGAATATG
3440622
3440623
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTGT
3440688
3440689
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TAATTTGTTCTATTTTTTTATCTAGTAACTTAATTGG
3440754
3440755
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AACTACATATAAATAAATTCAAAGCCATGAAATTCG
3440819
3440820
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
ACGGATACTTTCTTTTCTTGCATCAGCATTTTGTTTCA
3440886
3440887
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATAATATAATGTTTAGTATAACTAAATAATTTTGA
3440951
3440952
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
CTTATGGTACTCTTACAAGAGTAGAAGGTGTATACCT
3441017
3441018
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AGAATAAGATAACAACAATAGAATATAAAAATATCGT
3441083
3441084
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
TATTAAAATCTGTGAAAAATGCTTGGATGCCAACTCG
3441149
3441150
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
GTTATTCAGATGCATATAAAAACGCAGGTCAAACCTT
3441215
3441216
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
AAATTGAAGTAATAAAGAAAATAAGCTATGAAGCTAA
3441281
3441282
ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
3441310
Left flanking sequence : Till position 3440035 (length
bp)
TGATTTTATTTATATCTTTACTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTGTAGGTAAGTGTATTTT
Right flanking sequence : From position 3441310 (length
bp)
CCCAAAATAGGTATATTTGAATACATTGAAAACACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp